More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3075 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3075  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
602 aa  1158    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320155  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  46.78 
 
 
657 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0632  tetratricopeptide protein)  48.07 
 
 
566 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0666  Tetratricopeptide TPR_4  48.26 
 
 
575 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0666  Tetratricopeptide TPR_4  49.55 
 
 
566 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3794  TPR repeat-containing protein  37.25 
 
 
657 aa  350  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0677  TPR repeat-containing protein  46.53 
 
 
616 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  41.58 
 
 
697 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3076  TPR repeat-containing protein  44.98 
 
 
697 aa  313  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2298  TPR repeat-containing protein  38.64 
 
 
570 aa  313  7.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 
638 aa  290  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.99 
 
 
653 aa  281  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000395442 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.34 
 
 
654 aa  278  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  34.01 
 
 
605 aa  254  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  32.75 
 
 
792 aa  219  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 
762 aa  212  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  32.57 
 
 
827 aa  205  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1411  TPR repeat-containing protein  34.8 
 
 
708 aa  191  5e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000178962  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0125  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 
812 aa  178  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.298389  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0656  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 
639 aa  174  5e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329411  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  33.45 
 
 
766 aa  174  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3244  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.52 
 
 
699 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3018  hypothetical protein  26.93 
 
 
540 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00759929  hitchhiker  0.000000786199 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 
613 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1112  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.93 
 
 
536 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 
645 aa  117  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.35 
 
 
576 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2067  TPR repeat-containing protein  33.45 
 
 
586 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0230242  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  29.55 
 
 
559 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0796  hypothetical protein  29.11 
 
 
648 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0873  hypothetical protein  30.3 
 
 
580 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.386857 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 
589 aa  99.8  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3174  hypothetical protein  30.27 
 
 
634 aa  97.1  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.676773  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  25.28 
 
 
686 aa  92.8  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0622  hypothetical protein  27.18 
 
 
499 aa  92  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.130503  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 
795 aa  91.3  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 
581 aa  89  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 
643 aa  87.8  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 
686 aa  87.8  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.3 
 
 
641 aa  87.8  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 
587 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0584  hypothetical protein  26.11 
 
 
546 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 
715 aa  84.3  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.71 
 
 
810 aa  81.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 
879 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3897  hypothetical protein  29.24 
 
 
648 aa  80.5  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0599  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 
748 aa  80.1  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  35.62 
 
 
505 aa  79.7  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  38.93 
 
 
718 aa  80.1  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  36.57 
 
 
878 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 
534 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1408  TPR repeat-containing protein  21.42 
 
 
759 aa  76.3  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 
4489 aa  76.6  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2893  hypothetical protein  26.64 
 
 
497 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0588266 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 
542 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2696  hypothetical protein  27.64 
 
 
460 aa  75.1  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1498  hypothetical protein  25 
 
 
582 aa  74.7  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.579024  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 
593 aa  74.3  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  33.59 
 
 
733 aa  74.7  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  38.86 
 
 
732 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 
833 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  34.35 
 
 
1061 aa  72  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 
1094 aa  71.6  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  35.77 
 
 
637 aa  71.2  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  40.44 
 
 
828 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  37.23 
 
 
1276 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  33.14 
 
 
3035 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1404  hypothetical protein  23.4 
 
 
571 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.35845 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
3560 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  37.41 
 
 
833 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35 
 
 
632 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  30.92 
 
 
681 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 
362 aa  69.7  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 
3145 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  38.78 
 
 
828 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0795  hypothetical protein  26.07 
 
 
650 aa  68.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.492982  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 
739 aa  68.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 
909 aa  68.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  38.14 
 
 
875 aa  68.6  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 
217 aa  67.8  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
1827 aa  67.8  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 
648 aa  67.8  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  35.04 
 
 
1694 aa  67.8  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  36 
 
 
750 aa  66.6  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  39.23 
 
 
714 aa  67  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  40.87 
 
 
714 aa  67  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  34.45 
 
 
685 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 
955 aa  65.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7095  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
354 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.524118  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  31.47 
 
 
661 aa  66.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  34 
 
 
754 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  39.86 
 
 
484 aa  65.5  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  42.27 
 
 
649 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  42.27 
 
 
649 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 
744 aa  64.3  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  42.27 
 
 
646 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  31.43 
 
 
725 aa  64.3  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32557  predicted protein  23.88 
 
 
614 aa  64.3  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  34.45 
 
 
221 aa  64.3  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>