More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2415 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 686 aa  1400    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  38.84 
 
 		 686 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.46 
 
 		 641 aa  361  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.78 
 
 		 576 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 776 aa  292  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 643 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 589 aa  265  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 587 aa  259  9e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 593 aa  259  9e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  33.99 
 
 		 581 aa  250  6e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1451  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 		 585 aa  227  6e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 879 aa  203  8e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 762 aa  194  5e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 645 aa  188  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0584  hypothetical protein  31.62 
 
 		 546 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  28.53 
 
 		 795 aa  156  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1112  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.07 
 
 		 536 aa  152  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 827 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  27.49 
 
 		 559 aa  140  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 605 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1274  TPR repeat-containing protein  49.23 
 
 		 559 aa  139  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0599  TPR repeat-containing protein  28.6 
 
 		 748 aa  136  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 		 613 aa  134  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 715 aa  129  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4326  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 790 aa  126  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 		 792 aa  126  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 534 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 697 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  23.99 
 
 		 648 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1408  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 759 aa  114  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 3145 aa  113  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  22.63 
 
 		 744 aa  112  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 		 638 aa  110  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3076  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 697 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6647  hypothetical protein  23.6 
 
 		 437 aa  104  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2298  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 570 aa  103  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0622  hypothetical protein  28.57 
 
 		 499 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.130503  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  26.97 
 
 		 733 aa  103  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 878 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2893  hypothetical protein  28.97 
 
 		 497 aa  98.6  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0588266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6633  hypothetical protein  21.19 
 
 		 613 aa  97.8  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0642176 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.17 
 
 		 810 aa  97.8  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.76 
 
 		 725 aa  95.9  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  33.7 
 
 		 456 aa  95.5  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 3172 aa  94  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7095  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.12 
 
 		 354 aa  94  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.524118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1498  hypothetical protein  24.71 
 
 		 582 aa  90.1  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.579024  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  30.04 
 
 		 681 aa  90.1  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4471  tetratricopeptide TPR_4  30.66 
 
 		 598 aa  90.5  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.623043 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.42 
 
 		 3301 aa  90.1  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 637 aa  89.7  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.06 
 
 		 639 aa  89.7  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3794  TPR repeat-containing protein  22.98 
 
 		 657 aa  89.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 657 aa  87  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 718 aa  87  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 649 aa  87  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 685 aa  85.9  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  29.13 
 
 		 714 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  23.3 
 
 		 766 aa  85.1  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0666  Tetratricopeptide TPR_4  25.22 
 
 		 575 aa  84.7  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  30.3 
 
 		 603 aa  85.1  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  25.43 
 
 		 887 aa  84.3  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1641  hypothetical protein  26.4 
 
 		 572 aa  84.3  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 3035 aa  82.4  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2696  hypothetical protein  23.73 
 
 		 460 aa  82  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  31.55 
 
 		 714 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.42 
 
 		 632 aa  81.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.24 
 
 		 988 aa  80.9  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 808 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 614 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  30 
 
 		 626 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 		 573 aa  80.5  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  29.61 
 
 		 614 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  29.61 
 
 		 614 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 		 750 aa  80.1  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 		 362 aa  80.1  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  28.38 
 
 		 626 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 		 700 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3244  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.14 
 
 		 699 aa  80.5  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 		 614 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  29.61 
 
 		 626 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 		 614 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 		 909 aa  79.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 847 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 		 4489 aa  78.6  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 708 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  25.74 
 
 		 820 aa  78.6  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.63 
 
 		 622 aa  77.8  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 		 1105 aa  77.8  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 602 aa  77.8  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0677  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 		 616 aa  77.4  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6471  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.66 
 
 		 1274 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.707662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  25.74 
 
 		 875 aa  77  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  25.1 
 
 		 764 aa  76.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3075  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 		 602 aa  76.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320155  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.77 
 
 		 1022 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.87 
 
 		 1056 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  27 
 
 		 620 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>