More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4081 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  100 
 
 		 456 aa  925    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0529  Methyltransferase type 11  44.23 
 
 		 444 aa  326  6e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  37.35 
 
 		 436 aa  259  6e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  28.22 
 
 		 561 aa  199  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  28 
 
 		 561 aa  197  5.000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  25.75 
 
 		 577 aa  162  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  25.81 
 
 		 577 aa  160  5e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1075  methyltransferase type 12  35.13 
 
 		 303 aa  144  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3443  methyltransferase type 12  27.79 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605302 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3396  methyltransferase type 12  29.89 
 
 		 439 aa  137  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0197  Methyltransferase type 12  34.64 
 
 		 310 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  36.11 
 
 		 308 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  35.78 
 
 		 875 aa  131  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0157  methyltransferase type 12  34.66 
 
 		 338 aa  130  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0701135  normal  0.868895 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2106  methyltransferase type 12  28.78 
 
 		 436 aa  129  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0226  Methyltransferase type 12  32.54 
 
 		 311 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0591  methyltransferase  33.9 
 
 		 326 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2147  methyltransferase type 12  34.8 
 
 		 276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43435  predicted protein  28.07 
 
 		 456 aa  122  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1594  methyltransferase type 12  35.83 
 
 		 274 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 329 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1028  hypothetical protein  33.6 
 
 		 255 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1063  hypothetical protein  33.2 
 
 		 276 aa  117  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.051758  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2294  Methyltransferase type 12  35.15 
 
 		 272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2061  Methyltransferase type 12  35.98 
 
 		 272 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1472  methyltransferase type 12  27.23 
 
 		 417 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1472  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 308 aa  113  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0030  methyltransferase type 12  29.96 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  31.74 
 
 		 1252 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1539  Methyltransferase type 12  39.71 
 
 		 312 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 718 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 		 1252 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2059  hypothetical protein  34.78 
 
 		 241 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.98 
 
 		 810 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  39.7 
 
 		 754 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3559  Methyltransferase type 12  32.87 
 
 		 331 aa  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3256  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  39.7 
 
 		 754 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3235  methyltransferase type 12  36.89 
 
 		 331 aa  107  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 878 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 3145 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  36.26 
 
 		 542 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.28 
 
 		 632 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  36.24 
 
 		 833 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0489  methyltransferase type 12  26.69 
 
 		 447 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3693  methyltransferase type 11  40.95 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 		 505 aa  100  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  34.58 
 
 		 626 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  34.58 
 
 		 626 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  34.47 
 
 		 626 aa  99.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  34.58 
 
 		 614 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  34.58 
 
 		 614 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  34.58 
 
 		 614 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  34.05 
 
 		 828 aa  99.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0630  methyltransferase type 12  36.56 
 
 		 330 aa  99  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0132659 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  34.58 
 
 		 614 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 601 aa  99  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5381  methyltransferase type 11  25.74 
 
 		 438 aa  98.6  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554977 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  37.13 
 
 		 203 aa  97.1  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 828 aa  97.1  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 		 686 aa  95.9  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  37.24 
 
 		 789 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  39.43 
 
 		 732 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 573 aa  96.3  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  36.51 
 
 		 667 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0749  tetratricopeptide TPR_2  30.88 
 
 		 308 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 808 aa  94.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 602 aa  94.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  33.51 
 
 		 681 aa  94  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  34.45 
 
 		 833 aa  93.6  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  32.66 
 
 		 620 aa  92.8  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  33.49 
 
 		 715 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 637 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 685 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  32.66 
 
 		 620 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 649 aa  92  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  33.95 
 
 		 700 aa  91.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.86 
 
 		 689 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 		 828 aa  90.1  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 311 aa  90.1  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  30.96 
 
 		 762 aa  90.1  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  28.02 
 
 		 733 aa  89.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 909 aa  89.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  29.38 
 
 		 816 aa  88.2  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  28.88 
 
 		 1764 aa  88.2  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 		 1737 aa  88.2  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 		 441 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.49 
 
 		 441 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 		 739 aa  87.8  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.04 
 
 		 725 aa  87  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  34.01 
 
 		 619 aa  87  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  28.82 
 
 		 622 aa  86.7  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 		 1085 aa  86.3  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  23.39 
 
 		 820 aa  86.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  30.39 
 
 		 764 aa  86.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 626 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 566 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  28.63 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 598 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 		 615 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.36 
 
 		 1056 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>