186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3253 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3253  cellulose synthase domain-containing protein  100 
 
 		 1542 aa  3087    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.706167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2043  putative cellulose synthase operon protein C  59.1 
 
 		 1588 aa  1132    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.360789 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5839  cellulose synthase operon C domain protein  58.72 
 
 		 1569 aa  1123    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0252988  normal  0.398453 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1030  cellulose synthase operon protein C  33.93 
 
 		 1230 aa  432  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4081  cellulose synthase operon C domain protein  30.57 
 
 		 1309 aa  256  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3893  cellulose synthase operon C domain protein  30.25 
 
 		 1331 aa  244  9e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05080  cellulose synthase subunit C  30.59 
 
 		 1367 aa  242  5e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3938  cellulose synthase domain-containing protein  28.2 
 
 		 1324 aa  221  7e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0915294 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3525  TPR repeat-containing cellulose synthase operon C  32.71 
 
 		 1265 aa  219  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2252  cellulose synthase operon C-like protein  27.2 
 
 		 1267 aa  218  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0439618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0151  cellulose synthase subunit BcsC  28.86 
 
 		 1157 aa  186  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0631  cellulose synthase operon protein C  34.1 
 
 		 1548 aa  174  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1359  cellulose synthase domain-containing protein  28.49 
 
 		 1297 aa  173  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195561 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2009  cellulose synthase operon protein C  34.95 
 
 		 1574 aa  174  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175736  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2144  putative cellulose synthase operon protein C  34.95 
 
 		 1574 aa  173  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0687  cellulose synthase operon protein C  34.95 
 
 		 1580 aa  173  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.963088  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2139  cellulose synthase subunit BcsC  30.5 
 
 		 1172 aa  173  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2230  TPR repeat-containing protein  34.1 
 
 		 1544 aa  172  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56695  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3194  cellulose synthase subunit BcsC  29.92 
 
 		 1186 aa  172  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2638  cellulose synthase subunit BcsC  30.48 
 
 		 1172 aa  172  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1588  cellulose synthase operon protein C  34.95 
 
 		 1266 aa  171  7e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.502666  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0899  cellulose synthase operon C-like  28.37 
 
 		 1297 aa  171  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0140357  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1381  cellulose synthase domain-containing protein  28.37 
 
 		 1297 aa  171  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586419  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0070  cellulose synthase subunit BcsC  27.91 
 
 		 1159 aa  171  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.494386  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0793  cellulose synthase operon protein C  34.37 
 
 		 1471 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.567802  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1170  cellulose synthase domain-containing protein  30.59 
 
 		 1271 aa  169  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.456707  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4527  cellulose synthase operon C-like protein  33.25 
 
 		 1259 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279468  normal  0.779984 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3932  cellulose synthase subunit BcsC  28.86 
 
 		 1150 aa  167  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.903843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3824  cellulose synthase subunit BcsC  27.88 
 
 		 1150 aa  165  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4018  cellulose synthase subunit BcsC  29.97 
 
 		 1140 aa  164  8.000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3888  cellulose synthase subunit BcsC  28.61 
 
 		 1180 aa  164  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03378  cellulose synthase subunit  29.97 
 
 		 1157 aa  164  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0183  cellulose synthase operon C domain protein  29.97 
 
 		 1157 aa  164  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3839  cellulose synthase subunit BcsC  29.97 
 
 		 1157 aa  164  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.503197 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3811  cellulose synthase subunit BcsC  28.61 
 
 		 1172 aa  164  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.805678 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03331  hypothetical protein  29.97 
 
 		 1157 aa  164  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3992  cellulose synthase subunit BcsC  28.61 
 
 		 1180 aa  164  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.416047 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4895  cellulose synthase subunit BcsC  29.97 
 
 		 1157 aa  164  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0187  cellulose synthase subunit BcsC  29.97 
 
 		 1157 aa  164  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.865635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0073  cellulose synthase subunit BcsC  27.67 
 
 		 1164 aa  163  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1924  cellulose synthase domain-containing protein  30.15 
 
 		 1313 aa  160  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107111 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3927  cellulose synthase subunit BcsC  28.06 
 
 		 1160 aa  160  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1260  cellulose synthase domain-containing protein  30.99 
 
 		 1315 aa  160  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.00414022  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1293  cellulose synthase domain-containing protein  30.75 
 
 		 1315 aa  159  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140403  normal  0.0429961 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2072  cellulose synthase domain-containing protein  29.73 
 
 		 1244 aa  155  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00026145 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3734  cellulose synthase operon protein C, truncation  32.51 
 
 		 289 aa  136  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  24.55 
 
 		 729 aa  73.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00790  cellulose synthase operon protein C  28.7 
 
 		 815 aa  73.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.11 
 
 		 3172 aa  67.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  19.96 
 
 		 887 aa  67.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1676 aa  66.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.09 
 
 		 725 aa  65.9  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  33.63 
 
 		 1038 aa  63.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.89 
 
 		 632 aa  62.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  30.86 
 
 		 875 aa  62.4  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 		 878 aa  62.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  24.64 
 
 		 733 aa  59.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0419  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 		 917 aa  58.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  27.89 
 
 		 762 aa  58.2  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  27.89 
 
 		 762 aa  58.2  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 573 aa  57  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  23.03 
 
 		 505 aa  57  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0600  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 		 1112 aa  56.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272318  normal  0.386774 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.44 
 
 		 2240 aa  56.2  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3303  tetratricopeptide domain-containing protein  24.27 
 
 		 1098 aa  56.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  21.83 
 
 		 935 aa  55.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.74 
 
 		 553 aa  55.5  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  24.86 
 
 		 573 aa  55.5  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 573 aa  55.5  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  22.05 
 
 		 837 aa  55.5  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  26.09 
 
 		 620 aa  54.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  21.74 
 
 		 603 aa  55.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  23.24 
 
 		 676 aa  55.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 870 aa  55.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  32.34 
 
 		 602 aa  53.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  22.14 
 
 		 681 aa  54.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 620 aa  53.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  25.92 
 
 		 2262 aa  54.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 		 808 aa  53.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  24.02 
 
 		 929 aa  53.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  21.13 
 
 		 3301 aa  53.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.46 
 
 		 689 aa  53.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 313 aa  52.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2252  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 954 aa  53.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 2262 aa  52.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.18 
 
 		 810 aa  52.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  19.92 
 
 		 265 aa  52  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 573 aa  52  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 		 767 aa  51.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 697 aa  50.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0431  Tetratricopeptide TPR_4  27.35 
 
 		 615 aa  50.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.504045  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  30.53 
 
 		 682 aa  50.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.79 
 
 		 581 aa  50.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  25.73 
 
 		 587 aa  50.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  29.12 
 
 		 550 aa  49.7  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  21.51 
 
 		 934 aa  49.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  26.84 
 
 		 626 aa  50.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4191  zinc finger/thioredoxin putative  34.18 
 
 		 392 aa  50.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  18.29 
 
 		 2059 aa  49.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 567 aa  50.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>