85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2638 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3932  cellulose synthase subunit BcsC  39.44 
 
 		 1150 aa  749    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.903843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3927  cellulose synthase subunit BcsC  38.14 
 
 		 1160 aa  733    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2139  cellulose synthase subunit BcsC  98.63 
 
 		 1172 aa  2298    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4018  cellulose synthase subunit BcsC  37.86 
 
 		 1140 aa  736    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0151  cellulose synthase subunit BcsC  42.96 
 
 		 1157 aa  839    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3194  cellulose synthase subunit BcsC  88.28 
 
 		 1186 aa  2070    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0187  cellulose synthase subunit BcsC  37.94 
 
 		 1157 aa  736    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.865635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3839  cellulose synthase subunit BcsC  37.86 
 
 		 1157 aa  734    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.503197 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3888  cellulose synthase subunit BcsC  39.74 
 
 		 1180 aa  745    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0183  cellulose synthase operon C domain protein  37.86 
 
 		 1157 aa  734    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3811  cellulose synthase subunit BcsC  39.74 
 
 		 1172 aa  745    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.805678 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3824  cellulose synthase subunit BcsC  39.44 
 
 		 1150 aa  748    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3992  cellulose synthase subunit BcsC  39.74 
 
 		 1180 aa  745    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.416047 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4895  cellulose synthase subunit BcsC  37.94 
 
 		 1157 aa  736    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03331  hypothetical protein  37.94 
 
 		 1157 aa  737    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0073  cellulose synthase subunit BcsC  40.98 
 
 		 1164 aa  801    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0070  cellulose synthase subunit BcsC  40.69 
 
 		 1159 aa  794    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.494386  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03378  cellulose synthase subunit  37.94 
 
 		 1157 aa  737    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2638  cellulose synthase subunit BcsC  100 
 
 		 1172 aa  2327    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2252  cellulose synthase operon C-like protein  27.34 
 
 		 1267 aa  317  8e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0439618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3734  cellulose synthase operon protein C, truncation  43.24 
 
 		 289 aa  238  7e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3525  TPR repeat-containing cellulose synthase operon C  29.2 
 
 		 1265 aa  194  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4527  cellulose synthase operon C-like protein  29.87 
 
 		 1259 aa  192  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279468  normal  0.779984 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2072  cellulose synthase domain-containing protein  26.83 
 
 		 1244 aa  187  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00026145 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1170  cellulose synthase domain-containing protein  32.45 
 
 		 1271 aa  182  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.456707  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5839  cellulose synthase operon C domain protein  30.46 
 
 		 1569 aa  175  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0252988  normal  0.398453 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2043  putative cellulose synthase operon protein C  32.34 
 
 		 1588 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.360789 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3253  cellulose synthase domain-containing protein  30.48 
 
 		 1542 aa  170  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.706167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1359  cellulose synthase domain-containing protein  29.23 
 
 		 1297 aa  169  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195561 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1030  cellulose synthase operon protein C  27.17 
 
 		 1230 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0899  cellulose synthase operon C-like  29.23 
 
 		 1297 aa  164  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0140357  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1381  cellulose synthase domain-containing protein  29.23 
 
 		 1297 aa  164  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586419  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3938  cellulose synthase domain-containing protein  29.18 
 
 		 1324 aa  160  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0915294 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0793  cellulose synthase operon protein C  32.58 
 
 		 1471 aa  152  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.567802  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1293  cellulose synthase domain-containing protein  27.89 
 
 		 1315 aa  150  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140403  normal  0.0429961 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1260  cellulose synthase domain-containing protein  31.71 
 
 		 1315 aa  149  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.00414022  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1924  cellulose synthase domain-containing protein  29.89 
 
 		 1313 aa  148  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107111 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2144  putative cellulose synthase operon protein C  30.13 
 
 		 1574 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0687  cellulose synthase operon protein C  30.13 
 
 		 1580 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.963088  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2009  cellulose synthase operon protein C  30.13 
 
 		 1574 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175736  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0631  cellulose synthase operon protein C  29.49 
 
 		 1548 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2230  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 1544 aa  142  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56695  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1588  cellulose synthase operon protein C  29.87 
 
 		 1266 aa  140  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.502666  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3893  cellulose synthase operon C domain protein  31.53 
 
 		 1331 aa  135  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05080  cellulose synthase subunit C  29.43 
 
 		 1367 aa  130  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4081  cellulose synthase operon C domain protein  32.62 
 
 		 1309 aa  105  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00790  cellulose synthase operon protein C  26.4 
 
 		 815 aa  60.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.67 
 
 		 632 aa  55.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.86 
 
 		 810 aa  55.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 		 643 aa  55.1  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 		 808 aa  53.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.69 
 
 		 620 aa  53.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 		 878 aa  53.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 789 aa  52.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1186  TPR repeat-containing protein  30.98 
 
 		 1197 aa  51.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  25.06 
 
 		 936 aa  50.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 		 567 aa  50.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6145  TPR repeat-containing protein  38 
 
 		 477 aa  49.7  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513093 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 		 1096 aa  50.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.46 
 
 		 639 aa  49.7  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  21.86 
 
 		 676 aa  49.3  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 448 aa  49.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  30.04 
 
 		 615 aa  49.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0492  TPR repeat-containing protein  40.86 
 
 		 477 aa  48.5  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2118  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 504 aa  47.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.03 
 
 		 358 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4031  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.04 
 
 		 477 aa  47  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.636683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1859  thioredoxin domain-containing protein  28.08 
 
 		 283 aa  46.6  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.145875  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  24.4 
 
 		 638 aa  46.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.11 
 
 		 624 aa  46.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.2 
 
 		 1034 aa  46.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  31.58 
 
 		 587 aa  46.2  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.72 
 
 		 557 aa  46.2  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  20.65 
 
 		 725 aa  46.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.9 
 
 		 689 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3461  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 		 154 aa  45.8  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  30 
 
 		 626 aa  45.8  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0378  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.29 
 
 		 545 aa  45.8  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.579733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2528  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 535 aa  45.8  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.81 
 
 		 401 aa  45.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871786  normal  0.459695 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  26.53 
 
 		 883 aa  45.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1846  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.72 
 
 		 695 aa  45.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.112303  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 847 aa  45.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  21.58 
 
 		 1069 aa  45.4  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.3 
 
 		 1737 aa  45.1  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>