100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3992 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0183  cellulose synthase operon C domain protein  80.1 
 
 		 1157 aa  1923    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4895  cellulose synthase subunit BcsC  79.93 
 
 		 1157 aa  1918    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3992  cellulose synthase subunit BcsC  100 
 
 		 1180 aa  2399    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.416047 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3824  cellulose synthase subunit BcsC  99.48 
 
 		 1150 aa  2323    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3811  cellulose synthase subunit BcsC  99.4 
 
 		 1172 aa  2367    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.805678 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3932  cellulose synthase subunit BcsC  99.13 
 
 		 1150 aa  2315    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.903843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3888  cellulose synthase subunit BcsC  99.32 
 
 		 1180 aa  2377    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3927  cellulose synthase subunit BcsC  74.67 
 
 		 1160 aa  1749    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03331  hypothetical protein  80.19 
 
 		 1157 aa  1926    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2139  cellulose synthase subunit BcsC  39.86 
 
 		 1172 aa  747    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4018  cellulose synthase subunit BcsC  80.86 
 
 		 1140 aa  1915    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0151  cellulose synthase subunit BcsC  55.39 
 
 		 1157 aa  1240    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03378  cellulose synthase subunit  80.19 
 
 		 1157 aa  1926    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3194  cellulose synthase subunit BcsC  39.5 
 
 		 1186 aa  767    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0073  cellulose synthase subunit BcsC  51.17 
 
 		 1164 aa  1114    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0187  cellulose synthase subunit BcsC  80.19 
 
 		 1157 aa  1925    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.865635  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2638  cellulose synthase subunit BcsC  39.95 
 
 		 1172 aa  746    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3839  cellulose synthase subunit BcsC  79.84 
 
 		 1157 aa  1918    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.503197 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0070  cellulose synthase subunit BcsC  50.22 
 
 		 1159 aa  1114    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.494386  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3734  cellulose synthase operon protein C, truncation  87.89 
 
 		 289 aa  556  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1170  cellulose synthase domain-containing protein  28.09 
 
 		 1271 aa  243  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.456707  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3525  TPR repeat-containing cellulose synthase operon C  28.63 
 
 		 1265 aa  215  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2252  cellulose synthase operon C-like protein  33.33 
 
 		 1267 aa  205  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0439618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1359  cellulose synthase domain-containing protein  30.09 
 
 		 1297 aa  205  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195561 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4527  cellulose synthase operon C-like protein  30.03 
 
 		 1259 aa  204  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279468  normal  0.779984 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1381  cellulose synthase domain-containing protein  30.51 
 
 		 1297 aa  202  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586419  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0899  cellulose synthase operon C-like  30.51 
 
 		 1297 aa  202  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0140357  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1260  cellulose synthase domain-containing protein  30.96 
 
 		 1315 aa  199  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.00414022  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1924  cellulose synthase domain-containing protein  30.53 
 
 		 1313 aa  197  8.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107111 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1293  cellulose synthase domain-containing protein  30.8 
 
 		 1315 aa  197  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140403  normal  0.0429961 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1030  cellulose synthase operon protein C  34.71 
 
 		 1230 aa  193  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2144  putative cellulose synthase operon protein C  34.65 
 
 		 1574 aa  184  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2009  cellulose synthase operon protein C  34.65 
 
 		 1574 aa  183  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175736  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0793  cellulose synthase operon protein C  34.75 
 
 		 1471 aa  183  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.567802  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0687  cellulose synthase operon protein C  34.65 
 
 		 1580 aa  183  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.963088  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0631  cellulose synthase operon protein C  35.47 
 
 		 1548 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2230  TPR repeat-containing protein  35.47 
 
 		 1544 aa  182  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56695  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1588  cellulose synthase operon protein C  34.64 
 
 		 1266 aa  181  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.502666  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2072  cellulose synthase domain-containing protein  25.49 
 
 		 1244 aa  178  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00026145 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2043  putative cellulose synthase operon protein C  28.99 
 
 		 1588 aa  171  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.360789 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5839  cellulose synthase operon C domain protein  27.61 
 
 		 1569 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0252988  normal  0.398453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3253  cellulose synthase domain-containing protein  28.61 
 
 		 1542 aa  164  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.706167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3893  cellulose synthase operon C domain protein  33.79 
 
 		 1331 aa  156  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3938  cellulose synthase domain-containing protein  33.45 
 
 		 1324 aa  151  8e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0915294 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05080  cellulose synthase subunit C  33.81 
 
 		 1367 aa  139  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4081  cellulose synthase operon C domain protein  32.11 
 
 		 1309 aa  120  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.91 
 
 		 364 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 808 aa  66.6  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 643 aa  58.5  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  27.27 
 
 		 267 aa  54.3  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  22.54 
 
 		 597 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.3 
 
 		 878 aa  53.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.95 
 
 		 3145 aa  53.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.19 
 
 		 887 aa  53.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 265 aa  53.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1186  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.22 
 
 		 612 aa  53.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  28.29 
 
 		 456 aa  52.4  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  23.5 
 
 		 827 aa  52.4  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.95 
 
 		 265 aa  51.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1932  peptidase M, neutral zinc metallopeptidase, zinc-binding site  26.63 
 
 		 426 aa  50.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000295062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  20.73 
 
 		 3172 aa  50.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  23.19 
 
 		 366 aa  50.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3527  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 		 235 aa  50.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 782 aa  49.7  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  26.53 
 
 		 417 aa  49.3  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.77 
 
 		 624 aa  49.3  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0195  TPR domain protein  31.4 
 
 		 379 aa  48.9  0.0006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.315867  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.18 
 
 		 810 aa  48.9  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  17.31 
 
 		 409 aa  48.9  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  19.89 
 
 		 632 aa  48.9  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.8 
 
 		 576 aa  48.5  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  26.82 
 
 		 883 aa  48.1  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.83 
 
 		 689 aa  48.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 		 602 aa  48.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0600  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 1112 aa  47.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272318  normal  0.386774 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.43 
 
 		 293 aa  47.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0911  TPR repeat-containing protein  22.9 
 
 		 515 aa  47  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19098  hitchhiker  0.00518464 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  24 
 
 		 399 aa  47.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0955  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.55 
 
 		 220 aa  47.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  23.89 
 
 		 762 aa  47  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.33 
 
 		 1737 aa  47  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 		 405 aa  47.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00790  cellulose synthase operon protein C  27.56 
 
 		 815 aa  47  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0599  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 		 748 aa  47.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14940  predicted protein  44.44 
 
 		 1059 aa  46.6  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0306125  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  27.22 
 
 		 266 aa  46.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 		 265 aa  46.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  23.3 
 
 		 2401 aa  46.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.71 
 
 		 784 aa  46.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.23 
 
 		 818 aa  46.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 		 789 aa  46.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.79 
 
 		 725 aa  46.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1931  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.52 
 
 		 695 aa  46.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00441164  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  32.38 
 
 		 586 aa  45.8  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40924  predicted protein  24.26 
 
 		 375 aa  45.8  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.458934  normal  0.213634 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1963  TPR repeat-containing protein  20.73 
 
 		 602 aa  45.4  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.878392  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  21.93 
 
 		 792 aa  45.4  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 		 1121 aa  45.1  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  22.94 
 
 		 1073 aa  45.1  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 		 828 aa  44.7  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>