77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3525 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1359  cellulose synthase domain-containing protein  45.06 
 
 
1297 aa  876    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.195561 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0899  cellulose synthase operon C-like  45.14 
 
 
1297 aa  880    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0140357  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1293  cellulose synthase domain-containing protein  45.93 
 
 
1315 aa  873    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140403  normal  0.0429961 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1260  cellulose synthase domain-containing protein  45.83 
 
 
1315 aa  865    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.00414022  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2252  cellulose synthase operon C-like protein  68.89 
 
 
1267 aa  1691    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0439618  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1381  cellulose synthase domain-containing protein  45.14 
 
 
1297 aa  880    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586419  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1924  cellulose synthase domain-containing protein  45.7 
 
 
1313 aa  847    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.107111 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0793  cellulose synthase operon protein C  43.38 
 
 
1471 aa  739    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.567802  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2009  cellulose synthase operon protein C  42.61 
 
 
1574 aa  707    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175736  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4527  cellulose synthase operon C-like protein  45.66 
 
 
1259 aa  899    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279468  normal  0.779984 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2230  TPR repeat-containing protein  42.68 
 
 
1544 aa  706    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56695  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2144  putative cellulose synthase operon protein C  42.77 
 
 
1574 aa  708    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0631  cellulose synthase operon protein C  42.6 
 
 
1548 aa  706    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0687  cellulose synthase operon protein C  42.61 
 
 
1580 aa  708    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.963088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3525  TPR repeat-containing cellulose synthase operon C  100 
 
 
1265 aa  2523    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1588  cellulose synthase operon protein C  42.42 
 
 
1266 aa  698    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.502666  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1030  cellulose synthase operon protein C  27.72 
 
 
1230 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2072  cellulose synthase domain-containing protein  31.34 
 
 
1244 aa  293  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00026145 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1170  cellulose synthase domain-containing protein  27.68 
 
 
1271 aa  267  8e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.456707  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0151  cellulose synthase subunit BcsC  28.08 
 
 
1157 aa  244  6e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0070  cellulose synthase subunit BcsC  28.53 
 
 
1159 aa  231  6e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.494386  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5839  cellulose synthase operon C domain protein  27.2 
 
 
1569 aa  230  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0252988  normal  0.398453 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2043  putative cellulose synthase operon protein C  27.17 
 
 
1588 aa  228  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.360789 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3927  cellulose synthase subunit BcsC  29.15 
 
 
1160 aa  221  6e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3253  cellulose synthase domain-containing protein  32.71 
 
 
1542 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.706167  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3839  cellulose synthase subunit BcsC  28.81 
 
 
1157 aa  216  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.503197 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0187  cellulose synthase subunit BcsC  28.68 
 
 
1157 aa  214  7e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.865635  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03378  cellulose synthase subunit  28.68 
 
 
1157 aa  214  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03331  hypothetical protein  28.68 
 
 
1157 aa  214  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4018  cellulose synthase subunit BcsC  28.55 
 
 
1140 aa  214  9e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4895  cellulose synthase subunit BcsC  28.55 
 
 
1157 aa  211  5e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0183  cellulose synthase operon C domain protein  28.55 
 
 
1157 aa  211  8e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0073  cellulose synthase subunit BcsC  27.49 
 
 
1164 aa  211  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3824  cellulose synthase subunit BcsC  29.7 
 
 
1150 aa  208  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3811  cellulose synthase subunit BcsC  34.2 
 
 
1172 aa  207  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.805678 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3992  cellulose synthase subunit BcsC  29.56 
 
 
1180 aa  207  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.416047 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3888  cellulose synthase subunit BcsC  34.2 
 
 
1180 aa  207  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3932  cellulose synthase subunit BcsC  34.2 
 
 
1150 aa  207  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.903843  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2139  cellulose synthase subunit BcsC  29.44 
 
 
1172 aa  201  9e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3194  cellulose synthase subunit BcsC  26.83 
 
 
1186 aa  196  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2638  cellulose synthase subunit BcsC  29.16 
 
 
1172 aa  194  8e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3893  cellulose synthase operon C domain protein  24.76 
 
 
1331 aa  168  5.9999999999999996e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3734  cellulose synthase operon protein C, truncation  36.11 
 
 
289 aa  167  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05080  cellulose synthase subunit C  27.83 
 
 
1367 aa  166  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4081  cellulose synthase operon C domain protein  26.49 
 
 
1309 aa  160  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3938  cellulose synthase domain-containing protein  31.36 
 
 
1324 aa  137  9e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0915294 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 
221 aa  61.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2252  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 
954 aa  56.2  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  31.88 
 
 
935 aa  54.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 
673 aa  53.5  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1683  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 
942 aa  52.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.354598 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  31.25 
 
 
1979 aa  50.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0488  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 
485 aa  50.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  26.64 
 
 
545 aa  49.3  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 
1069 aa  48.9  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1125  TPR domain-containing protein  25.83 
 
 
457 aa  48.5  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  29.95 
 
 
520 aa  48.5  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.58 
 
 
771 aa  48.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  22.29 
 
 
1213 aa  48.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  26.62 
 
 
587 aa  47.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  27.66 
 
 
321 aa  47.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 
934 aa  48.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00790  cellulose synthase operon protein C  23.31 
 
 
815 aa  47.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.83 
 
 
810 aa  47.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0656  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 
639 aa  47  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329411  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  28.91 
 
 
574 aa  47.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 
601 aa  47  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 
2262 aa  46.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1660  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.48 
 
 
370 aa  46.6  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 
566 aa  46.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  20.68 
 
 
722 aa  46.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.23 
 
 
364 aa  45.8  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  27.11 
 
 
875 aa  45.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  32.45 
 
 
672 aa  45.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.14 
 
 
2240 aa  45.1  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.1 
 
 
1676 aa  45.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 
715 aa  45.1  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>