52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4081 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_3938  cellulose synthase domain-containing protein  55.97 
 
 		 1324 aa  1460    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0915294 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4081  cellulose synthase operon C domain protein  100 
 
 		 1309 aa  2648    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3893  cellulose synthase operon C domain protein  70.87 
 
 		 1331 aa  1927    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05080  cellulose synthase subunit C  33.41 
 
 		 1367 aa  628  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2252  cellulose synthase operon C-like protein  25.6 
 
 		 1267 aa  299  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0439618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5839  cellulose synthase operon C domain protein  30.57 
 
 		 1569 aa  271  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0252988  normal  0.398453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3253  cellulose synthase domain-containing protein  30.72 
 
 		 1542 aa  258  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.706167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2043  putative cellulose synthase operon protein C  30.04 
 
 		 1588 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.360789 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1030  cellulose synthase operon protein C  27.45 
 
 		 1230 aa  227  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0899  cellulose synthase operon C-like  26.02 
 
 		 1297 aa  224  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0140357  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1381  cellulose synthase domain-containing protein  26.02 
 
 		 1297 aa  224  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586419  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1359  cellulose synthase domain-containing protein  25.74 
 
 		 1297 aa  220  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195561 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4527  cellulose synthase operon C-like protein  25.43 
 
 		 1259 aa  209  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279468  normal  0.779984 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1924  cellulose synthase domain-containing protein  26.24 
 
 		 1313 aa  188  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107111 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1260  cellulose synthase domain-containing protein  25.83 
 
 		 1315 aa  176  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.00414022  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3525  TPR repeat-containing cellulose synthase operon C  26.49 
 
 		 1265 aa  160  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1170  cellulose synthase domain-containing protein  30.25 
 
 		 1271 aa  155  5.9999999999999996e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.456707  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2139  cellulose synthase subunit BcsC  26.05 
 
 		 1172 aa  146  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3992  cellulose synthase subunit BcsC  32.11 
 
 		 1180 aa  143  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.416047 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3824  cellulose synthase subunit BcsC  32.11 
 
 		 1150 aa  143  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3811  cellulose synthase subunit BcsC  32.11 
 
 		 1172 aa  144  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.805678 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3932  cellulose synthase subunit BcsC  31.77 
 
 		 1150 aa  143  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.903843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3888  cellulose synthase subunit BcsC  32.11 
 
 		 1180 aa  143  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3927  cellulose synthase subunit BcsC  32.62 
 
 		 1160 aa  137  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4895  cellulose synthase subunit BcsC  31.94 
 
 		 1157 aa  134  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0187  cellulose synthase subunit BcsC  31.94 
 
 		 1157 aa  134  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.865635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3839  cellulose synthase subunit BcsC  31.94 
 
 		 1157 aa  134  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.503197 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4018  cellulose synthase subunit BcsC  31.94 
 
 		 1140 aa  134  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03331  hypothetical protein  31.94 
 
 		 1157 aa  134  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03378  cellulose synthase subunit  31.94 
 
 		 1157 aa  134  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0183  cellulose synthase operon C domain protein  31.94 
 
 		 1157 aa  134  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2638  cellulose synthase subunit BcsC  33.33 
 
 		 1172 aa  132  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0070  cellulose synthase subunit BcsC  29.79 
 
 		 1159 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.494386  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0151  cellulose synthase subunit BcsC  28.37 
 
 		 1157 aa  129  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0073  cellulose synthase subunit BcsC  29.43 
 
 		 1164 aa  129  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3194  cellulose synthase subunit BcsC  30.17 
 
 		 1186 aa  127  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1293  cellulose synthase domain-containing protein  34.43 
 
 		 1315 aa  126  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140403  normal  0.0429961 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0687  cellulose synthase operon protein C  33.11 
 
 		 1580 aa  121  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.963088  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2144  putative cellulose synthase operon protein C  33.11 
 
 		 1574 aa  121  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2009  cellulose synthase operon protein C  33.11 
 
 		 1574 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175736  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1588  cellulose synthase operon protein C  33.11 
 
 		 1266 aa  119  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.502666  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3734  cellulose synthase operon protein C, truncation  31.72 
 
 		 289 aa  119  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0631  cellulose synthase operon protein C  33.82 
 
 		 1548 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2230  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 		 1544 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56695  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0793  cellulose synthase operon protein C  33.21 
 
 		 1471 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.567802  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2072  cellulose synthase domain-containing protein  29.58 
 
 		 1244 aa  93.2  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00026145 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  22.59 
 
 		 729 aa  57.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00790  cellulose synthase operon protein C  29.24 
 
 		 815 aa  54.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.18 
 
 		 364 aa  49.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  21.54 
 
 		 417 aa  47  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 575 aa  45.4  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  28.95 
 
 		 889 aa  45.1  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>