129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0151 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03378  cellulose synthase subunit  55.6 
 
 		 1157 aa  1259    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0183  cellulose synthase operon C domain protein  55.69 
 
 		 1157 aa  1262    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2638  cellulose synthase subunit BcsC  42.96 
 
 		 1172 aa  821    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03331  hypothetical protein  55.6 
 
 		 1157 aa  1259    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3927  cellulose synthase subunit BcsC  55.76 
 
 		 1160 aa  1233    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2139  cellulose synthase subunit BcsC  42.98 
 
 		 1172 aa  823    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4018  cellulose synthase subunit BcsC  55.87 
 
 		 1140 aa  1250    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0151  cellulose synthase subunit BcsC  100 
 
 		 1157 aa  2348    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3194  cellulose synthase subunit BcsC  41.77 
 
 		 1186 aa  825    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0187  cellulose synthase subunit BcsC  55.69 
 
 		 1157 aa  1261    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.865635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3839  cellulose synthase subunit BcsC  55.69 
 
 		 1157 aa  1261    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.503197 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0073  cellulose synthase subunit BcsC  68.38 
 
 		 1164 aa  1593    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0070  cellulose synthase subunit BcsC  67.73 
 
 		 1159 aa  1594    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.494386  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3888  cellulose synthase subunit BcsC  55.73 
 
 		 1180 aa  1221    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3932  cellulose synthase subunit BcsC  56.07 
 
 		 1150 aa  1232    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.903843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3811  cellulose synthase subunit BcsC  55.82 
 
 		 1172 aa  1228    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.805678 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3824  cellulose synthase subunit BcsC  55.82 
 
 		 1150 aa  1229    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3992  cellulose synthase subunit BcsC  55.39 
 
 		 1180 aa  1228    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.416047 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4895  cellulose synthase subunit BcsC  55.6 
 
 		 1157 aa  1260    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3734  cellulose synthase operon protein C, truncation  67.82 
 
 		 289 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1170  cellulose synthase domain-containing protein  35.73 
 
 		 1271 aa  237  8e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.456707  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3525  TPR repeat-containing cellulose synthase operon C  28.19 
 
 		 1265 aa  237  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1359  cellulose synthase domain-containing protein  33.62 
 
 		 1297 aa  234  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195561 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4527  cellulose synthase operon C-like protein  30.96 
 
 		 1259 aa  232  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279468  normal  0.779984 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1260  cellulose synthase domain-containing protein  33.33 
 
 		 1315 aa  232  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.00414022  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2252  cellulose synthase operon C-like protein  28.51 
 
 		 1267 aa  232  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0439618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0899  cellulose synthase operon C-like  33.45 
 
 		 1297 aa  232  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0140357  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1381  cellulose synthase domain-containing protein  33.45 
 
 		 1297 aa  232  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586419  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1293  cellulose synthase domain-containing protein  33.33 
 
 		 1315 aa  231  9e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140403  normal  0.0429961 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1924  cellulose synthase domain-containing protein  32.32 
 
 		 1313 aa  228  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107111 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0631  cellulose synthase operon protein C  35.66 
 
 		 1548 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2009  cellulose synthase operon protein C  35.48 
 
 		 1574 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175736  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2144  putative cellulose synthase operon protein C  35.48 
 
 		 1574 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0687  cellulose synthase operon protein C  35.48 
 
 		 1580 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.963088  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0793  cellulose synthase operon protein C  33.93 
 
 		 1471 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.567802  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2230  TPR repeat-containing protein  35.66 
 
 		 1544 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56695  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1588  cellulose synthase operon protein C  35.48 
 
 		 1266 aa  198  6e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.502666  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2043  putative cellulose synthase operon protein C  30.86 
 
 		 1588 aa  198  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.360789 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1030  cellulose synthase operon protein C  32.96 
 
 		 1230 aa  194  8e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2072  cellulose synthase domain-containing protein  31.5 
 
 		 1244 aa  191  9e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00026145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5839  cellulose synthase operon C domain protein  29.47 
 
 		 1569 aa  185  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0252988  normal  0.398453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3253  cellulose synthase domain-containing protein  28.9 
 
 		 1542 aa  184  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.706167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3938  cellulose synthase domain-containing protein  33.68 
 
 		 1324 aa  160  9e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0915294 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3893  cellulose synthase operon C domain protein  31.4 
 
 		 1331 aa  156  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05080  cellulose synthase subunit C  30.77 
 
 		 1367 aa  146  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4081  cellulose synthase operon C domain protein  28.01 
 
 		 1309 aa  103  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00790  cellulose synthase operon protein C  26.41 
 
 		 815 aa  65.5  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.16 
 
 		 364 aa  61.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.13 
 
 		 689 aa  59.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  23.2 
 
 		 1486 aa  58.9  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  22.15 
 
 		 597 aa  56.6  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  24.53 
 
 		 676 aa  56.2  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 827 aa  56.2  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.57 
 
 		 1737 aa  55.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.41 
 
 		 1056 aa  55.5  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.24 
 
 		 1056 aa  55.1  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.91 
 
 		 265 aa  54.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 1297 aa  53.9  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.42 
 
 		 810 aa  53.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  32.7 
 
 		 301 aa  53.1  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 265 aa  52.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  23.2 
 
 		 762 aa  52.4  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 592 aa  52.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 566 aa  52.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.74 
 
 		 297 aa  52.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 		 808 aa  52.4  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0781  TPR domain-containing protein  24.77 
 
 		 924 aa  52  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.55707  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.74 
 
 		 297 aa  52.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.41 
 
 		 878 aa  52  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 594 aa  51.6  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.06 
 
 		 818 aa  51.6  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 		 643 aa  51.6  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 		 792 aa  51.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.94 
 
 		 286 aa  50.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2021  TPR repeat-containing protein  45 
 
 		 426 aa  50.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  21.08 
 
 		 3301 aa  50.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 291 aa  50.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.57 
 
 		 624 aa  49.7  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  21.71 
 
 		 565 aa  49.3  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3303  tetratricopeptide domain-containing protein  22.73 
 
 		 1098 aa  49.3  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  24.56 
 
 		 750 aa  48.9  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0955  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.86 
 
 		 220 aa  48.9  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3982  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 305 aa  48.9  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.588459  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 		 265 aa  48.9  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 643 aa  48.5  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0045  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 451 aa  48.5  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  23.25 
 
 		 722 aa  48.5  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  21.05 
 
 		 632 aa  48.1  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.17 
 
 		 632 aa  48.5  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 754 aa  48.5  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0788  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 866 aa  47.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.940486  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  25.14 
 
 		 299 aa  47.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  30.14 
 
 		 632 aa  47.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 286 aa  47.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.41 
 
 		 286 aa  47  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 		 718 aa  47.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  25.2 
 
 		 832 aa  47  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.55 
 
 		 784 aa  47.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.82 
 
 		 576 aa  47.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 		 265 aa  46.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>