31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00790 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00790  cellulose synthase operon protein C  100 
 
 		 815 aa  1662    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3253  cellulose synthase domain-containing protein  28.7 
 
 		 1542 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.706167  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1030  cellulose synthase operon protein C  28.83 
 
 		 1230 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05080  cellulose synthase subunit C  29.06 
 
 		 1367 aa  71.2  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0073  cellulose synthase subunit BcsC  27.07 
 
 		 1164 aa  69.3  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2072  cellulose synthase domain-containing protein  26.24 
 
 		 1244 aa  68.9  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00026145 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2043  putative cellulose synthase operon protein C  26.28 
 
 		 1588 aa  67.8  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.360789 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0070  cellulose synthase subunit BcsC  25.76 
 
 		 1159 aa  66.2  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.494386  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3938  cellulose synthase domain-containing protein  25.61 
 
 		 1324 aa  66.2  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0915294 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3927  cellulose synthase subunit BcsC  24.6 
 
 		 1160 aa  66.6  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0151  cellulose synthase subunit BcsC  26.41 
 
 		 1157 aa  65.5  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5839  cellulose synthase operon C domain protein  26.51 
 
 		 1569 aa  64.7  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0252988  normal  0.398453 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3893  cellulose synthase operon C domain protein  30.95 
 
 		 1331 aa  61.2  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2139  cellulose synthase subunit BcsC  26.4 
 
 		 1172 aa  60.8  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3194  cellulose synthase subunit BcsC  26.05 
 
 		 1186 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2638  cellulose synthase subunit BcsC  26.4 
 
 		 1172 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2252  cellulose synthase operon C-like protein  21.21 
 
 		 1267 aa  59.3  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0439618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4018  cellulose synthase subunit BcsC  22.98 
 
 		 1140 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03331  hypothetical protein  22.98 
 
 		 1157 aa  48.5  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4895  cellulose synthase subunit BcsC  22.98 
 
 		 1157 aa  48.5  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3839  cellulose synthase subunit BcsC  22.98 
 
 		 1157 aa  48.5  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.503197 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03378  cellulose synthase subunit  22.98 
 
 		 1157 aa  48.5  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0187  cellulose synthase subunit BcsC  22.98 
 
 		 1157 aa  48.5  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.865635  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0183  cellulose synthase operon C domain protein  22.98 
 
 		 1157 aa  48.5  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3734  cellulose synthase operon protein C, truncation  22.77 
 
 		 289 aa  47.8  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3811  cellulose synthase subunit BcsC  27.56 
 
 		 1172 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.805678 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3824  cellulose synthase subunit BcsC  27.56 
 
 		 1150 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3992  cellulose synthase subunit BcsC  27.56 
 
 		 1180 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.416047 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3888  cellulose synthase subunit BcsC  27.56 
 
 		 1180 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3525  TPR repeat-containing cellulose synthase operon C  23.16 
 
 		 1265 aa  47.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3932  cellulose synthase subunit BcsC  24.81 
 
 		 1150 aa  45.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.903843  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>