150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_03331 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03378  cellulose synthase subunit  100 
 
 
1157 aa  2360    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0183  cellulose synthase operon C domain protein  99.74 
 
 
1157 aa  2353    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2638  cellulose synthase subunit BcsC  37.94 
 
 
1172 aa  726    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0073  cellulose synthase subunit BcsC  50.68 
 
 
1164 aa  1103    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03331  hypothetical protein  100 
 
 
1157 aa  2360    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3811  cellulose synthase subunit BcsC  80.36 
 
 
1172 aa  1893    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.805678 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4895  cellulose synthase subunit BcsC  99.22 
 
 
1157 aa  2341    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3888  cellulose synthase subunit BcsC  80.1 
 
 
1180 aa  1887    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3992  cellulose synthase subunit BcsC  80.19 
 
 
1180 aa  1892    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.416047 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3932  cellulose synthase subunit BcsC  80.78 
 
 
1150 aa  1897    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.903843  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3927  cellulose synthase subunit BcsC  73.95 
 
 
1160 aa  1738    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2139  cellulose synthase subunit BcsC  37.82 
 
 
1172 aa  723    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4018  cellulose synthase subunit BcsC  99.47 
 
 
1140 aa  2313    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0151  cellulose synthase subunit BcsC  55.6 
 
 
1157 aa  1259    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3824  cellulose synthase subunit BcsC  80.61 
 
 
1150 aa  1894    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3194  cellulose synthase subunit BcsC  37.42 
 
 
1186 aa  737    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0187  cellulose synthase subunit BcsC  99.91 
 
 
1157 aa  2358    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.865635  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3839  cellulose synthase subunit BcsC  99.48 
 
 
1157 aa  2349    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.503197 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0070  cellulose synthase subunit BcsC  50.96 
 
 
1159 aa  1118    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.494386  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3734  cellulose synthase operon protein C, truncation  99.65 
 
 
289 aa  612  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1359  cellulose synthase domain-containing protein  32.59 
 
 
1297 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.195561 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0899  cellulose synthase operon C-like  32.41 
 
 
1297 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0140357  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1381  cellulose synthase domain-containing protein  32.41 
 
 
1297 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586419  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4527  cellulose synthase operon C-like protein  30.88 
 
 
1259 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279468  normal  0.779984 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1170  cellulose synthase domain-containing protein  35.26 
 
 
1271 aa  214  5.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.456707  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3525  TPR repeat-containing cellulose synthase operon C  29.72 
 
 
1265 aa  213  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2252  cellulose synthase operon C-like protein  34.42 
 
 
1267 aa  213  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0439618  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1260  cellulose synthase domain-containing protein  31.65 
 
 
1315 aa  211  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.00414022  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1293  cellulose synthase domain-containing protein  31.31 
 
 
1315 aa  208  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140403  normal  0.0429961 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1924  cellulose synthase domain-containing protein  31 
 
 
1313 aa  207  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.107111 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2072  cellulose synthase domain-containing protein  26.09 
 
 
1244 aa  199  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00026145 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0793  cellulose synthase operon protein C  36 
 
 
1471 aa  194  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.567802  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2144  putative cellulose synthase operon protein C  36.53 
 
 
1574 aa  191  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0687  cellulose synthase operon protein C  36.53 
 
 
1580 aa  191  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.963088  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2009  cellulose synthase operon protein C  36.53 
 
 
1574 aa  191  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175736  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0631  cellulose synthase operon protein C  35.9 
 
 
1548 aa  189  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2230  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 
1544 aa  189  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56695  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1588  cellulose synthase operon protein C  36.53 
 
 
1266 aa  187  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.502666  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1030  cellulose synthase operon protein C  33.33 
 
 
1230 aa  182  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3253  cellulose synthase domain-containing protein  29.97 
 
 
1542 aa  163  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.706167  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5839  cellulose synthase operon C domain protein  28.11 
 
 
1569 aa  159  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0252988  normal  0.398453 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2043  putative cellulose synthase operon protein C  27.83 
 
 
1588 aa  158  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.360789 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3893  cellulose synthase operon C domain protein  31.55 
 
 
1331 aa  143  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05080  cellulose synthase subunit C  29.57 
 
 
1367 aa  143  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3938  cellulose synthase domain-containing protein  30.99 
 
 
1324 aa  134  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0915294 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4081  cellulose synthase operon C domain protein  31.94 
 
 
1309 aa  110  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.48 
 
 
818 aa  65.1  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 
827 aa  63.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.13 
 
 
784 aa  62  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.36 
 
 
364 aa  60.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 
399 aa  60.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 
3145 aa  59.7  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 
878 aa  58.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  23.08 
 
 
924 aa  58.2  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 
405 aa  57.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  21.87 
 
 
1073 aa  57.4  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.67 
 
 
1056 aa  57.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.41 
 
 
810 aa  56.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.16 
 
 
1056 aa  56.2  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  23.22 
 
 
808 aa  55.1  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 
597 aa  54.7  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 
1737 aa  53.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.38 
 
 
689 aa  53.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.81 
 
 
988 aa  53.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 
265 aa  52.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
1049 aa  52.4  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 
828 aa  52  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.22 
 
 
237 aa  52  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  22.3 
 
 
750 aa  51.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  20.87 
 
 
1069 aa  50.8  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 
265 aa  50.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 
828 aa  51.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 
288 aa  50.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 
594 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.34 
 
 
1022 aa  50.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 
729 aa  50.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.34 
 
 
4079 aa  50.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 
543 aa  50.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  24.2 
 
 
344 aa  50.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  23.13 
 
 
729 aa  49.7  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.2 
 
 
344 aa  50.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0195  TPR domain protein  34.67 
 
 
379 aa  50.1  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.315867  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  21.55 
 
 
725 aa  49.7  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 
562 aa  50.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 
792 aa  49.7  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.32 
 
 
265 aa  49.7  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.43 
 
 
293 aa  49.3  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1829  TPR repeat-containing protein  44.44 
 
 
322 aa  49.3  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725463  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  20.12 
 
 
676 aa  49.3  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  25.42 
 
 
456 aa  49.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  32 
 
 
417 aa  49.3  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0915  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 
324 aa  49.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0051049 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 
649 aa  48.9  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40924  predicted protein  25.26 
 
 
375 aa  48.9  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.458934  normal  0.213634 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  23.55 
 
 
762 aa  48.5  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  23.55 
 
 
762 aa  48.5  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1186  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.24 
 
 
612 aa  48.9  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0419  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 
224 aa  48.5  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.338331  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  24 
 
 
267 aa  48.5  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00790  cellulose synthase operon protein C  22.98 
 
 
815 aa  48.5  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>