143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1030 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1030  cellulose synthase operon protein C  100 
 
 		 1230 aa  2476    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2043  putative cellulose synthase operon protein C  35.01 
 
 		 1588 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.360789 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5839  cellulose synthase operon C domain protein  34.57 
 
 		 1569 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0252988  normal  0.398453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3253  cellulose synthase domain-containing protein  33.83 
 
 		 1542 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.706167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2252  cellulose synthase operon C-like protein  28.5 
 
 		 1267 aa  385  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0439618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3525  TPR repeat-containing cellulose synthase operon C  28.04 
 
 		 1265 aa  350  8e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3893  cellulose synthase operon C domain protein  27.06 
 
 		 1331 aa  325  3e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4081  cellulose synthase operon C domain protein  27.16 
 
 		 1309 aa  315  2.9999999999999996e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0899  cellulose synthase operon C-like  28.25 
 
 		 1297 aa  247  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0140357  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1381  cellulose synthase domain-containing protein  28.25 
 
 		 1297 aa  247  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586419  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1359  cellulose synthase domain-containing protein  28.23 
 
 		 1297 aa  244  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195561 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1924  cellulose synthase domain-containing protein  27.96 
 
 		 1313 aa  243  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107111 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3938  cellulose synthase domain-containing protein  27.7 
 
 		 1324 aa  228  5.0000000000000005e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0915294 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1293  cellulose synthase domain-containing protein  27.01 
 
 		 1315 aa  220  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140403  normal  0.0429961 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1260  cellulose synthase domain-containing protein  26.78 
 
 		 1315 aa  212  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.00414022  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05080  cellulose synthase subunit C  26.74 
 
 		 1367 aa  210  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0151  cellulose synthase subunit BcsC  29.52 
 
 		 1157 aa  209  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3927  cellulose synthase subunit BcsC  26.71 
 
 		 1160 aa  202  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1170  cellulose synthase domain-containing protein  34.39 
 
 		 1271 aa  199  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.456707  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0070  cellulose synthase subunit BcsC  34.51 
 
 		 1159 aa  197  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.494386  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3932  cellulose synthase subunit BcsC  35.18 
 
 		 1150 aa  195  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.903843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3824  cellulose synthase subunit BcsC  35.18 
 
 		 1150 aa  195  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3811  cellulose synthase subunit BcsC  35.18 
 
 		 1172 aa  194  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.805678 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3992  cellulose synthase subunit BcsC  35.18 
 
 		 1180 aa  194  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.416047 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3888  cellulose synthase subunit BcsC  35.18 
 
 		 1180 aa  194  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0183  cellulose synthase operon C domain protein  27.24 
 
 		 1157 aa  190  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4018  cellulose synthase subunit BcsC  27.13 
 
 		 1140 aa  190  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4895  cellulose synthase subunit BcsC  27.53 
 
 		 1157 aa  189  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3839  cellulose synthase subunit BcsC  27.13 
 
 		 1157 aa  189  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.503197 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0187  cellulose synthase subunit BcsC  27.13 
 
 		 1157 aa  188  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.865635  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03378  cellulose synthase subunit  27.13 
 
 		 1157 aa  188  6e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03331  hypothetical protein  27.13 
 
 		 1157 aa  188  6e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0073  cellulose synthase subunit BcsC  33.52 
 
 		 1164 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4527  cellulose synthase operon C-like protein  26.58 
 
 		 1259 aa  186  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279468  normal  0.779984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2638  cellulose synthase subunit BcsC  27.5 
 
 		 1172 aa  179  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2139  cellulose synthase subunit BcsC  27.27 
 
 		 1172 aa  178  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3194  cellulose synthase subunit BcsC  30.33 
 
 		 1186 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3734  cellulose synthase operon protein C, truncation  35.38 
 
 		 289 aa  145  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2072  cellulose synthase domain-containing protein  29.44 
 
 		 1244 aa  139  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00026145 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2009  cellulose synthase operon protein C  27.34 
 
 		 1574 aa  122  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175736  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0687  cellulose synthase operon protein C  27.34 
 
 		 1580 aa  121  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.963088  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1588  cellulose synthase operon protein C  27.61 
 
 		 1266 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.502666  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2144  putative cellulose synthase operon protein C  27.61 
 
 		 1574 aa  121  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0793  cellulose synthase operon protein C  28.17 
 
 		 1471 aa  118  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.567802  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0631  cellulose synthase operon protein C  27.01 
 
 		 1548 aa  116  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2230  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 1544 aa  116  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56695  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00790  cellulose synthase operon protein C  28.83 
 
 		 815 aa  72  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.76 
 
 		 887 aa  59.7  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  22.71 
 
 		 762 aa  59.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  22.71 
 
 		 762 aa  59.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  23.28 
 
 		 729 aa  58.5  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  21.49 
 
 		 614 aa  57.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1609  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 194 aa  57.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.994867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 589 aa  57  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2575  TPR domain-containing protein  31.97 
 
 		 451 aa  55.8  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000631564  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  21.96 
 
 		 935 aa  55.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 		 886 aa  55.8  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1820  Tetratricopeptide TPR_4  36.59 
 
 		 106 aa  55.1  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.452931  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  22.72 
 
 		 725 aa  54.3  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  26.6 
 
 		 638 aa  54.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0781  TPR domain-containing protein  23.99 
 
 		 924 aa  53.5  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.55707  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1875  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 201 aa  54.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 		 931 aa  53.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  25.64 
 
 		 584 aa  53.5  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 		 884 aa  52.8  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  23.55 
 
 		 643 aa  52.4  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 265 aa  52.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  28.85 
 
 		 321 aa  51.6  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 2240 aa  51.6  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  25 
 
 		 586 aa  51.2  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 		 923 aa  50.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  25.79 
 
 		 444 aa  51.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2321  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 		 475 aa  51.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.084712  decreased coverage  0.00212856 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 		 808 aa  51.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  26.15 
 
 		 864 aa  50.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.96 
 
 		 557 aa  50.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2838  tetratricopeptide TPR_2  21.43 
 
 		 940 aa  50.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  23.64 
 
 		 804 aa  50.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 423 aa  50.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4313  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 441 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  20.61 
 
 		 1069 aa  50.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  26.17 
 
 		 1764 aa  50.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3194  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  24.12 
 
 		 349 aa  50.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.756541  hitchhiker  0.0088423 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  29.96 
 
 		 677 aa  49.7  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4211  TPR repeat-containing protein  21.17 
 
 		 522 aa  50.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.185796 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1186  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 		 1197 aa  50.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 		 594 aa  49.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0431  Tetratricopeptide TPR_4  26.43 
 
 		 615 aa  49.7  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.504045  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  23.17 
 
 		 883 aa  48.9  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.34 
 
 		 574 aa  48.9  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3469  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 		 1161 aa  48.9  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1698  TPR domain-containing protein  30.29 
 
 		 626 aa  47.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2970  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 364 aa  47.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47174  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  23.73 
 
 		 934 aa  48.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0662  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.46 
 
 		 330 aa  47.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  20.08 
 
 		 1676 aa  48.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 		 827 aa  47.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1154  TPR repeat-containing protein  21.7 
 
 		 511 aa  48.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 646 aa  47.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  24.52 
 
 		 591 aa  47.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>