56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3893 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3938  cellulose synthase domain-containing protein  55.02 
 
 
1324 aa  1454    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0915294 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4081  cellulose synthase operon C domain protein  70.8 
 
 
1309 aa  1878    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3893  cellulose synthase operon C domain protein  100 
 
 
1331 aa  2696    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05080  cellulose synthase subunit C  33.19 
 
 
1367 aa  630  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1030  cellulose synthase operon protein C  27.16 
 
 
1230 aa  320  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2252  cellulose synthase operon C-like protein  23.48 
 
 
1267 aa  274  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0439618  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5839  cellulose synthase operon C domain protein  28.35 
 
 
1569 aa  244  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0252988  normal  0.398453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3253  cellulose synthase domain-containing protein  30.12 
 
 
1542 aa  242  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.706167  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2043  putative cellulose synthase operon protein C  28.82 
 
 
1588 aa  241  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.360789 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3525  TPR repeat-containing cellulose synthase operon C  25.06 
 
 
1265 aa  169  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3992  cellulose synthase subunit BcsC  33.79 
 
 
1180 aa  156  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.416047 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3824  cellulose synthase subunit BcsC  33.79 
 
 
1150 aa  156  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0151  cellulose synthase subunit BcsC  31.4 
 
 
1157 aa  156  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3811  cellulose synthase subunit BcsC  33.79 
 
 
1172 aa  156  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.805678 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3888  cellulose synthase subunit BcsC  33.79 
 
 
1180 aa  156  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3932  cellulose synthase subunit BcsC  33.45 
 
 
1150 aa  155  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.903843  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3927  cellulose synthase subunit BcsC  31.83 
 
 
1160 aa  148  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0073  cellulose synthase subunit BcsC  32.75 
 
 
1164 aa  146  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0070  cellulose synthase subunit BcsC  32.75 
 
 
1159 aa  145  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.494386  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3839  cellulose synthase subunit BcsC  31.55 
 
 
1157 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.503197 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0187  cellulose synthase subunit BcsC  31.55 
 
 
1157 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.865635  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4895  cellulose synthase subunit BcsC  31.55 
 
 
1157 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03331  hypothetical protein  31.55 
 
 
1157 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0183  cellulose synthase operon C domain protein  31.55 
 
 
1157 aa  144  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4018  cellulose synthase subunit BcsC  31.55 
 
 
1140 aa  144  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03378  cellulose synthase subunit  31.55 
 
 
1157 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1170  cellulose synthase domain-containing protein  32.57 
 
 
1271 aa  142  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.456707  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0899  cellulose synthase operon C-like  34.39 
 
 
1297 aa  136  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0140357  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1381  cellulose synthase domain-containing protein  34.39 
 
 
1297 aa  136  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586419  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1359  cellulose synthase domain-containing protein  34.39 
 
 
1297 aa  136  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.195561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2139  cellulose synthase subunit BcsC  31.53 
 
 
1172 aa  135  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2638  cellulose synthase subunit BcsC  31.53 
 
 
1172 aa  135  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4527  cellulose synthase operon C-like protein  34.26 
 
 
1259 aa  131  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279468  normal  0.779984 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3194  cellulose synthase subunit BcsC  31.8 
 
 
1186 aa  131  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1924  cellulose synthase domain-containing protein  34.04 
 
 
1313 aa  128  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.107111 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3734  cellulose synthase operon protein C, truncation  32.73 
 
 
289 aa  126  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1260  cellulose synthase domain-containing protein  31.02 
 
 
1315 aa  124  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.00414022  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1293  cellulose synthase domain-containing protein  32.99 
 
 
1315 aa  123  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140403  normal  0.0429961 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0631  cellulose synthase operon protein C  31.85 
 
 
1548 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2144  putative cellulose synthase operon protein C  31.85 
 
 
1574 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2009  cellulose synthase operon protein C  31.85 
 
 
1574 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175736  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0687  cellulose synthase operon protein C  31.85 
 
 
1580 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.963088  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2230  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 
1544 aa  116  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56695  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0793  cellulose synthase operon protein C  33.09 
 
 
1471 aa  115  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.567802  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1588  cellulose synthase operon protein C  31.85 
 
 
1266 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.502666  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2072  cellulose synthase domain-containing protein  28.47 
 
 
1244 aa  94  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00026145 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00790  cellulose synthase operon protein C  30.95 
 
 
815 aa  60.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  23.61 
 
 
729 aa  59.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  25.3 
 
 
1073 aa  52.4  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  25.17 
 
 
603 aa  48.5  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  34.69 
 
 
287 aa  48.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  37.66 
 
 
287 aa  48.5  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.17 
 
 
553 aa  47.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 
575 aa  47.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0061  glycosyl transferase group 1  43.4 
 
 
478 aa  47  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 
767 aa  45.1  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>