152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5839 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2043  putative cellulose synthase operon protein C  94.65 
 
 		 1588 aa  1970    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.360789 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3253  cellulose synthase domain-containing protein  59.3 
 
 		 1542 aa  1661    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.706167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5839  cellulose synthase operon C domain protein  100 
 
 		 1569 aa  3126    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0252988  normal  0.398453 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1030  cellulose synthase operon protein C  34.57 
 
 		 1230 aa  425  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05080  cellulose synthase subunit C  30.81 
 
 		 1367 aa  275  6e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4081  cellulose synthase operon C domain protein  31 
 
 		 1309 aa  273  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3938  cellulose synthase domain-containing protein  28.89 
 
 		 1324 aa  252  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0915294 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3893  cellulose synthase operon C domain protein  28.16 
 
 		 1331 aa  246  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3525  TPR repeat-containing cellulose synthase operon C  27.25 
 
 		 1265 aa  229  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2252  cellulose synthase operon C-like protein  27.16 
 
 		 1267 aa  217  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0439618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0151  cellulose synthase subunit BcsC  29.47 
 
 		 1157 aa  186  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2139  cellulose synthase subunit BcsC  30.67 
 
 		 1172 aa  179  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2638  cellulose synthase subunit BcsC  30.46 
 
 		 1172 aa  177  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1170  cellulose synthase domain-containing protein  33.51 
 
 		 1271 aa  175  6.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.456707  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0070  cellulose synthase subunit BcsC  28.13 
 
 		 1159 aa  173  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.494386  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3927  cellulose synthase subunit BcsC  28.04 
 
 		 1160 aa  172  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3932  cellulose synthase subunit BcsC  28.36 
 
 		 1150 aa  172  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.903843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3824  cellulose synthase subunit BcsC  27.61 
 
 		 1150 aa  170  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3811  cellulose synthase subunit BcsC  27.61 
 
 		 1172 aa  169  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.805678 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3888  cellulose synthase subunit BcsC  27.61 
 
 		 1180 aa  169  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3992  cellulose synthase subunit BcsC  27.61 
 
 		 1180 aa  169  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.416047 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4527  cellulose synthase operon C-like protein  27.8 
 
 		 1259 aa  169  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279468  normal  0.779984 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1359  cellulose synthase domain-containing protein  27.75 
 
 		 1297 aa  168  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195561 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3194  cellulose synthase subunit BcsC  29.27 
 
 		 1186 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0899  cellulose synthase operon C-like  27.51 
 
 		 1297 aa  166  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0140357  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1381  cellulose synthase domain-containing protein  27.51 
 
 		 1297 aa  166  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586419  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0073  cellulose synthase subunit BcsC  30.59 
 
 		 1164 aa  165  7e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03378  cellulose synthase subunit  28.11 
 
 		 1157 aa  160  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0183  cellulose synthase operon C domain protein  28.11 
 
 		 1157 aa  160  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03331  hypothetical protein  28.11 
 
 		 1157 aa  160  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4895  cellulose synthase subunit BcsC  28.11 
 
 		 1157 aa  160  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4018  cellulose synthase subunit BcsC  28.11 
 
 		 1140 aa  160  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0187  cellulose synthase subunit BcsC  28.11 
 
 		 1157 aa  160  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.865635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3839  cellulose synthase subunit BcsC  28.11 
 
 		 1157 aa  159  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.503197 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2009  cellulose synthase operon protein C  33.42 
 
 		 1574 aa  153  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175736  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0687  cellulose synthase operon protein C  33.42 
 
 		 1580 aa  153  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.963088  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2144  putative cellulose synthase operon protein C  33.16 
 
 		 1574 aa  152  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1588  cellulose synthase operon protein C  33.42 
 
 		 1266 aa  151  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.502666  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2072  cellulose synthase domain-containing protein  32.77 
 
 		 1244 aa  149  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00026145 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0631  cellulose synthase operon protein C  32.83 
 
 		 1548 aa  145  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2230  TPR repeat-containing protein  32.83 
 
 		 1544 aa  145  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56695  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0793  cellulose synthase operon protein C  32.49 
 
 		 1471 aa  145  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.567802  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1293  cellulose synthase domain-containing protein  28.64 
 
 		 1315 aa  144  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140403  normal  0.0429961 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1260  cellulose synthase domain-containing protein  30.66 
 
 		 1315 aa  140  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.00414022  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1924  cellulose synthase domain-containing protein  28.76 
 
 		 1313 aa  140  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107111 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3734  cellulose synthase operon protein C, truncation  31.23 
 
 		 289 aa  136  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.89 
 
 		 1676 aa  70.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 503 aa  68.9  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  19.58 
 
 		 887 aa  66.6  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  22.11 
 
 		 725 aa  65.9  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00790  cellulose synthase operon protein C  26.51 
 
 		 815 aa  65.5  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  22.51 
 
 		 934 aa  62.4  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  31.01 
 
 		 630 aa  61.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.43 
 
 		 935 aa  61.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.23 
 
 		 689 aa  60.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3385  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 427 aa  56.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.981404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0662  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.08 
 
 		 330 aa  56.6  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  28.38 
 
 		 1764 aa  55.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  21.88 
 
 		 3172 aa  54.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  24.15 
 
 		 762 aa  53.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  24.15 
 
 		 762 aa  53.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  30.57 
 
 		 602 aa  53.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.6 
 
 		 364 aa  54.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 870 aa  53.5  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  25.47 
 
 		 1406 aa  53.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  23.42 
 
 		 2262 aa  53.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0600  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 		 1112 aa  53.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272318  normal  0.386774 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  26.32 
 
 		 936 aa  53.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  33.85 
 
 		 682 aa  52.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 		 581 aa  52.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  22.97 
 
 		 444 aa  51.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.31 
 
 		 2240 aa  51.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.72 
 
 		 565 aa  51.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.41 
 
 		 645 aa  51.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 		 556 aa  51.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  23.32 
 
 		 573 aa  51.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  22.54 
 
 		 878 aa  50.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 		 566 aa  51.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 597 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 886 aa  50.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0025  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 445 aa  50.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 2262 aa  51.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 		 697 aa  50.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  25.85 
 
 		 574 aa  50.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2282  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.15 
 
 		 433 aa  50.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.883499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1154  TPR repeat-containing protein  22.03 
 
 		 511 aa  50.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  27.49 
 
 		 637 aa  50.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  36.71 
 
 		 545 aa  50.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3412  diguanylate cyclase with TPR repeats  29.88 
 
 		 816 aa  50.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  23.14 
 
 		 638 aa  49.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  39.77 
 
 		 884 aa  49.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3930  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 		 974 aa  50.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.45 
 
 		 916 aa  49.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 1451 aa  49.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  29.65 
 
 		 875 aa  49.7  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 1454 aa  49.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  34.9 
 
 		 1386 aa  49.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 		 827 aa  49.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  23.18 
 
 		 676 aa  49.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 		 1038 aa  49.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>