More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2282 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_2282  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 433 aa  885    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.883499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.08 
 
 		 1694 aa  90.1  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  22.73 
 
 		 397 aa  86.3  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.48 
 
 		 810 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 878 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.65 
 
 		 1737 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.27 
 
 		 632 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 486 aa  77.4  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 681 aa  77.4  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 562 aa  76.3  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 1276 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.66 
 
 		 725 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24 
 
 		 927 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  24.76 
 
 		 887 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.59 
 
 		 1979 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 		 311 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.67 
 
 		 586 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 		 748 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 3145 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  24.36 
 
 		 622 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 		 505 aa  70.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 313 aa  69.7  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0523  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 		 631 aa  69.7  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0179552  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  27.2 
 
 		 764 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 566 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 4489 aa  68.6  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.11 
 
 		 739 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 		 713 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  26.11 
 
 		 252 aa  68.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  28.63 
 
 		 646 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 		 448 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.96 
 
 		 3172 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.47 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 637 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 827 aa  68.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  20.44 
 
 		 568 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.47 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  19.82 
 
 		 573 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  28.63 
 
 		 649 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  28.63 
 
 		 649 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  27.9 
 
 		 512 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.87 
 
 		 2240 aa  67  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2077  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 314 aa  67  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  23.77 
 
 		 573 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 909 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.81 
 
 		 739 aa  66.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 615 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 808 aa  66.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2041  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.71 
 
 		 884 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.443497 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  25.88 
 
 		 587 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  24.92 
 
 		 603 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 		 289 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 		 602 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 		 711 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.73 
 
 		 4079 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  24.91 
 
 		 733 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  25.45 
 
 		 875 aa  65.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 597 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 		 3560 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  24.52 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  23.89 
 
 		 1154 aa  64.3  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 		 750 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  28.98 
 
 		 780 aa  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3412  diguanylate cyclase with TPR repeats  31.29 
 
 		 816 aa  63.5  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.91 
 
 		 883 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 		 3035 aa  63.2  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 1069 aa  63.2  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  22.6 
 
 		 573 aa  63.2  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 685 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1138 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  23.62 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  29.55 
 
 		 656 aa  62.8  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 		 2262 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 		 543 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  23.26 
 
 		 3301 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  28.06 
 
 		 545 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  23.97 
 
 		 730 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  24.74 
 
 		 437 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 1178 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 		 280 aa  62  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1461  tetratricopeptide TPR_2  27.22 
 
 		 194 aa  62  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 		 1192 aa  62  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  22.7 
 
 		 564 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  22.73 
 
 		 661 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  24.53 
 
 		 677 aa  61.6  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  26.99 
 
 		 632 aa  61.6  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 		 1094 aa  61.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  26.29 
 
 		 566 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1345  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.14 
 
 		 707 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  31.51 
 
 		 817 aa  60.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 634 aa  60.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 636 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.79 
 
 		 689 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>