More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4009 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 1386 aa  2744    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  42.75 
 
 		 1044 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3633  glycosyl transferase, group 1  43.82 
 
 		 510 aa  332  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.015452  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  38.71 
 
 		 1366 aa  174  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2484  glycosyl transferase, group 1  32.44 
 
 		 856 aa  170  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.672737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4003  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 		 545 aa  165  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.351709  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.45 
 
 		 610 aa  161  7e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  34.42 
 
 		 710 aa  159  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4941  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 		 414 aa  156  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 		 1509 aa  154  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  33.57 
 
 		 717 aa  153  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  30.79 
 
 		 632 aa  152  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  33.73 
 
 		 717 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  33.21 
 
 		 3301 aa  150  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 		 832 aa  150  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  25.93 
 
 		 731 aa  147  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  32.05 
 
 		 684 aa  146  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 		 1486 aa  147  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  32.66 
 
 		 635 aa  145  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0491  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 		 867 aa  144  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  30.68 
 
 		 729 aa  144  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 		 1275 aa  143  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5190  glycosyl transferase group 1  30.98 
 
 		 671 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00612346  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 		 602 aa  141  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  34.18 
 
 		 617 aa  141  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  30.89 
 
 		 732 aa  140  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 		 1991 aa  140  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  32.66 
 
 		 652 aa  140  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0763  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 		 725 aa  140  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  35.92 
 
 		 670 aa  140  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 		 531 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  31.32 
 
 		 684 aa  139  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 		 742 aa  139  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  37.14 
 
 		 725 aa  139  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00770  glycosyltransferase  35.52 
 
 		 916 aa  139  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 		 1759 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 		 1334 aa  137  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  25.68 
 
 		 746 aa  137  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 		 958 aa  135  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 		 1297 aa  135  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2364  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 		 774 aa  135  6.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.869085  normal  0.0140446 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  32.49 
 
 		 653 aa  135  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  33.09 
 
 		 1359 aa  134  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  36.07 
 
 		 725 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  28.88 
 
 		 733 aa  134  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0057  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 		 791 aa  133  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169678  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  29.85 
 
 		 709 aa  132  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  29.64 
 
 		 1644 aa  132  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  29.85 
 
 		 709 aa  132  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  29.64 
 
 		 1644 aa  132  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 		 783 aa  132  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  34.12 
 
 		 728 aa  132  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  36.88 
 
 		 662 aa  132  7.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 		 742 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4279  glycosyl transferase, group 1  32.43 
 
 		 389 aa  130  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1074  glycosyl transferase group 1  39.5 
 
 		 404 aa  129  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 		 748 aa  128  9e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 		 551 aa  127  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.4 
 
 		 809 aa  127  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  25.35 
 
 		 794 aa  126  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 		 658 aa  127  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  29.87 
 
 		 723 aa  126  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 		 775 aa  125  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 		 808 aa  125  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  35.19 
 
 		 305 aa  125  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  34.66 
 
 		 721 aa  124  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.11 
 
 		 1561 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 		 742 aa  124  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  33.43 
 
 		 632 aa  124  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2454  LpsE protein  29.02 
 
 		 383 aa  124  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  25.27 
 
 		 1067 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  32.27 
 
 		 526 aa  124  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  32.98 
 
 		 880 aa  124  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  34.07 
 
 		 796 aa  123  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  32.75 
 
 		 625 aa  123  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  25.94 
 
 		 810 aa  122  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 		 625 aa  121  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 		 625 aa  121  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  28.01 
 
 		 988 aa  121  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 		 765 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 		 1152 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 		 1152 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 		 555 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0548  glycosyl transferase family protein  31.83 
 
 		 784 aa  119  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2706  glycosyl transferase group 1  34.35 
 
 		 373 aa  118  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0324708 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3791  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 		 392 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.242824  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 		 551 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00740  glycosyltransferase  30.93 
 
 		 787 aa  116  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.456388 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2908  glycosyl transferase, group 1  31.7 
 
 		 401 aa  116  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 		 539 aa  114  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4195  glycosyl transferase, group 1  32.38 
 
 		 873 aa  113  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  27.4 
 
 		 586 aa  111  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4120  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 		 392 aa  110  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  24.64 
 
 		 996 aa  109  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  25.4 
 
 		 1182 aa  105  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 1084 aa  103  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3434  glycosyl transferase family protein  38.42 
 
 		 753 aa  103  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  29.5 
 
 		 1694 aa  102  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 		 576 aa  102  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 		 525 aa  102  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>