More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2338 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  100 
 
 		 762 aa  1569    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  100 
 
 		 762 aa  1569    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  30.78 
 
 		 695 aa  250  7e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 1406 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  29.37 
 
 		 656 aa  221  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  27.05 
 
 		 1764 aa  219  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 685 aa  213  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  26.15 
 
 		 725 aa  210  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  27.74 
 
 		 652 aa  207  6e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  27.51 
 
 		 697 aa  203  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  30.67 
 
 		 542 aa  201  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  27.6 
 
 		 677 aa  200  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  29.16 
 
 		 700 aa  196  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  26.77 
 
 		 673 aa  191  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  28.72 
 
 		 663 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  28.62 
 
 		 573 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  24.65 
 
 		 669 aa  180  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  29.78 
 
 		 648 aa  176  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  30.57 
 
 		 549 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  28.95 
 
 		 634 aa  172  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  28.4 
 
 		 637 aa  168  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  24.52 
 
 		 594 aa  167  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  25.15 
 
 		 546 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.33 
 
 		 530 aa  164  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  29.64 
 
 		 530 aa  164  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  28.31 
 
 		 720 aa  163  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  27.88 
 
 		 531 aa  162  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  28.27 
 
 		 713 aa  160  9e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  27.16 
 
 		 542 aa  159  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  27.9 
 
 		 532 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  26.57 
 
 		 524 aa  157  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  27.38 
 
 		 604 aa  154  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  30.06 
 
 		 889 aa  154  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  26.49 
 
 		 529 aa  153  1e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  33.61 
 
 		 899 aa  152  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  27.67 
 
 		 717 aa  152  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  24.86 
 
 		 548 aa  145  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 		 505 aa  142  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  25.59 
 
 		 578 aa  141  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  33.06 
 
 		 525 aa  140  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  21.17 
 
 		 614 aa  139  2e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  25.96 
 
 		 519 aa  138  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  24.68 
 
 		 514 aa  138  4e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  25.81 
 
 		 527 aa  135  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3336  sulfotransferase  31.12 
 
 		 670 aa  135  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.850036 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  24.13 
 
 		 484 aa  133  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 		 878 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  26.43 
 
 		 624 aa  130  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  29.37 
 
 		 322 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  25.51 
 
 		 533 aa  127  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  31.69 
 
 		 536 aa  126  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.59 
 
 		 810 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  23.48 
 
 		 482 aa  124  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0167  sulfotransferase  27.79 
 
 		 488 aa  121  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  23.89 
 
 		 494 aa  120  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.25 
 
 		 725 aa  120  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 909 aa  120  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 		 543 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.56 
 
 		 1694 aa  119  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 		 714 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  25.45 
 
 		 714 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  27.38 
 
 		 625 aa  117  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  28.93 
 
 		 795 aa  115  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  21.82 
 
 		 502 aa  114  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.91 
 
 		 397 aa  114  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 4079 aa  114  7.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.08 
 
 		 632 aa  114  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 681 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  27.19 
 
 		 1077 aa  111  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  27.79 
 
 		 538 aa  110  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  24.53 
 
 		 636 aa  110  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  28.29 
 
 		 742 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.16 
 
 		 1979 aa  108  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.3 
 
 		 1276 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 718 aa  101  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.52 
 
 		 816 aa  100  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.64 
 
 		 1737 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  24.93 
 
 		 733 aa  99.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 3035 aa  99.4  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 362 aa  99  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 		 792 aa  99  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 		 827 aa  97.4  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  26.25 
 
 		 865 aa  97.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 653 aa  96.7  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  28.4 
 
 		 653 aa  96.7  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  25.53 
 
 		 622 aa  96.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  30.07 
 
 		 620 aa  96.3  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 620 aa  95.5  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  24.46 
 
 		 764 aa  94.4  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 566 aa  93.6  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  25.33 
 
 		 732 aa  91.7  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  27.53 
 
 		 864 aa  91.3  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 		 448 aa  90.9  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.45 
 
 		 927 aa  90.9  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 637 aa  90.5  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  23.06 
 
 		 1069 aa  90.5  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  27.22 
 
 		 955 aa  89.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.86 
 
 		 2240 aa  89.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 		 1094 aa  89  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1676 aa  88.6  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>