235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4275 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  100 
 
 		 527 aa  1086    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  47.47 
 
 		 532 aa  463  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  38.06 
 
 		 536 aa  360  3e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  34.61 
 
 		 525 aa  313  6.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 		 1406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  27.87 
 
 		 533 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  27.66 
 
 		 652 aa  209  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  26.8 
 
 		 669 aa  199  9e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  28.66 
 
 		 1764 aa  197  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  28.03 
 
 		 663 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  30.04 
 
 		 725 aa  196  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  28.13 
 
 		 673 aa  193  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  27.26 
 
 		 542 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  31.84 
 
 		 720 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  32.22 
 
 		 578 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  28.78 
 
 		 695 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  27.77 
 
 		 677 aa  186  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  31.68 
 
 		 717 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  28.74 
 
 		 700 aa  184  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 		 697 aa  183  6e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  28.44 
 
 		 637 aa  183  8.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  31.83 
 
 		 322 aa  177  5e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 		 573 aa  173  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  27.03 
 
 		 604 aa  173  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  28.88 
 
 		 530 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  26.65 
 
 		 546 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.84 
 
 		 530 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 685 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  24.4 
 
 		 634 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  31.03 
 
 		 542 aa  155  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3336  sulfotransferase  29.22 
 
 		 670 aa  156  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.850036 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  29.23 
 
 		 548 aa  152  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  28.78 
 
 		 514 aa  150  8e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  27.41 
 
 		 656 aa  149  9e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  28.98 
 
 		 889 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  26.52 
 
 		 648 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  29.45 
 
 		 594 aa  147  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  31.08 
 
 		 899 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  28.04 
 
 		 529 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  28.19 
 
 		 524 aa  143  9e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 502 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  25.81 
 
 		 762 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  25.81 
 
 		 762 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  29.72 
 
 		 482 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0167  sulfotransferase  32.07 
 
 		 488 aa  133  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  26.93 
 
 		 484 aa  130  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 494 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1699  hypothetical protein  27.87 
 
 		 307 aa  129  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.860301  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  27.23 
 
 		 519 aa  127  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 		 713 aa  126  9e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  26.64 
 
 		 549 aa  120  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  27.16 
 
 		 742 aa  114  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  25 
 
 		 531 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  32.62 
 
 		 614 aa  111  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  29.71 
 
 		 636 aa  110  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 538 aa  110  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  23.33 
 
 		 624 aa  108  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  27.94 
 
 		 625 aa  108  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1421  tetratricopeptide TPR_2  24.37 
 
 		 471 aa  89.7  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0844206  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1897  TPR repeat-containing protein  23.09 
 
 		 598 aa  80.9  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00502769  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0784  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 		 709 aa  70.9  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 		 1037 aa  69.7  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3552  TPR repeat-containing protein  21.99 
 
 		 510 aa  69.3  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0258  sulfotransferase  22.43 
 
 		 626 aa  65.1  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.89 
 
 		 810 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4599  hypothetical protein  22.06 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 		 878 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 		 697 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4121  sulfotransferase  24.12 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1176  SecC motif-containing protein  22.92 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0641  sulfotransferase  24.65 
 
 		 346 aa  60.1  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 732 aa  59.7  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.32 
 
 		 2240 aa  59.3  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0799  sulfotransferase  24.09 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0670086  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3140  sulfotransferase  22.66 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.615346  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.41 
 
 		 632 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_1550  predicted protein  26.47 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.058598  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1364  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.73 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000696413  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  22.61 
 
 		 992 aa  55.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  30.87 
 
 		 733 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  22.67 
 
 		 1415 aa  55.5  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  30.26 
 
 		 816 aa  54.3  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.28 
 
 		 758 aa  54.3  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1177  sulfotransferase  22.54 
 
 		 325 aa  54.3  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1207  hypothetical protein  21.76 
 
 		 336 aa  53.5  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 		 465 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0115  Tetratricopeptide domain protein  26.04 
 
 		 409 aa  53.1  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 		 927 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1006  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 359 aa  53.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.476893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  31.69 
 
 		 3145 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 		 527 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  25.43 
 
 		 864 aa  52.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  25 
 
 		 503 aa  52.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 		 581 aa  52.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1208  hypothetical protein  23.96 
 
 		 347 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 		 739 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2201  Tfp pilus assembly protein PilF-like  24.72 
 
 		 542 aa  51.6  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 		 968 aa  51.6  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 		 326 aa  50.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 2262 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>