65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1421 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1421  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 471 aa  974    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0844206  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  24.48 
 
 		 546 aa  101  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  23.73 
 
 		 673 aa  99.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  24.09 
 
 		 652 aa  97.1  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 		 1406 aa  92  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  24.62 
 
 		 1764 aa  90.1  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  24.37 
 
 		 527 aa  89.7  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  29.51 
 
 		 542 aa  88.6  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  23.67 
 
 		 530 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  23.89 
 
 		 531 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  25.3 
 
 		 695 aa  84.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  24.74 
 
 		 637 aa  84.3  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  22.17 
 
 		 663 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  22.74 
 
 		 669 aa  81.6  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.07 
 
 		 530 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  22.39 
 
 		 762 aa  80.9  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  22.39 
 
 		 762 aa  80.9  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  25.47 
 
 		 578 aa  80.1  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  27.59 
 
 		 532 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  21.23 
 
 		 677 aa  79  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  25.58 
 
 		 524 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  21.63 
 
 		 685 aa  77.4  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  23.82 
 
 		 625 aa  77  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  24.67 
 
 		 725 aa  76.6  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  25.11 
 
 		 525 aa  76.6  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 573 aa  76.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  21.5 
 
 		 634 aa  75.5  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  24.34 
 
 		 604 aa  75.1  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3552  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 		 510 aa  73.9  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  21.39 
 
 		 542 aa  73.6  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  22.25 
 
 		 697 aa  73.6  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  24.44 
 
 		 648 aa  72.8  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  25.47 
 
 		 700 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  22.44 
 
 		 899 aa  71.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  26.5 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  23.53 
 
 		 536 aa  70.1  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  25.19 
 
 		 717 aa  70.1  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  22.89 
 
 		 889 aa  68.2  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  25.2 
 
 		 624 aa  68.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  22.85 
 
 		 713 aa  65.5  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  27.27 
 
 		 636 aa  63.9  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  22.28 
 
 		 484 aa  63.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  19.65 
 
 		 529 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  20 
 
 		 482 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3336  sulfotransferase  24.28 
 
 		 670 aa  61.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.850036 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  22.56 
 
 		 549 aa  60.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  23.57 
 
 		 656 aa  60.5  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  22.79 
 
 		 548 aa  59.3  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  25.7 
 
 		 519 aa  58.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  20 
 
 		 502 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  25.07 
 
 		 720 aa  57.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  19 
 
 		 614 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  19.6 
 
 		 514 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  20.36 
 
 		 594 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1699  hypothetical protein  24.75 
 
 		 307 aa  55.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.860301  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  19.47 
 
 		 494 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  20.4 
 
 		 742 aa  51.2  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  21.15 
 
 		 538 aa  50.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  20.14 
 
 		 533 aa  50.1  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0167  sulfotransferase  23.23 
 
 		 488 aa  49.3  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0258  sulfotransferase  27.16 
 
 		 626 aa  46.2  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  25.15 
 
 		 714 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0341  TPR repeat-containing protein  23.57 
 
 		 752 aa  44.7  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.132358  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  34.48 
 
 		 1013 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3976  hypothetical protein  40.68 
 
 		 308 aa  44.3  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.737818 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>