130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1262 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  100 
 
 		 546 aa  1141    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  52.35 
 
 		 531 aa  567  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  49.71 
 
 		 524 aa  526  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  31.57 
 
 		 652 aa  246  6e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  31.07 
 
 		 542 aa  239  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  31.4 
 
 		 669 aa  235  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  30.04 
 
 		 673 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  31.27 
 
 		 663 aa  231  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  29.67 
 
 		 634 aa  227  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  28.75 
 
 		 677 aa  208  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  28.4 
 
 		 604 aa  204  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 573 aa  203  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  27.56 
 
 		 695 aa  190  5e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  28.54 
 
 		 1764 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  27.69 
 
 		 725 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  26.39 
 
 		 637 aa  171  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 697 aa  166  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  26.91 
 
 		 656 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  25.15 
 
 		 762 aa  164  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  25.15 
 
 		 762 aa  164  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  31.3 
 
 		 594 aa  164  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  30.3 
 
 		 525 aa  160  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  26.65 
 
 		 527 aa  159  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  27.53 
 
 		 717 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  26.35 
 
 		 700 aa  159  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 1406 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  25.1 
 
 		 532 aa  157  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  29.84 
 
 		 542 aa  156  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  24.33 
 
 		 713 aa  152  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 685 aa  151  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  27.9 
 
 		 548 aa  151  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  28.24 
 
 		 720 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  28.9 
 
 		 322 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0167  sulfotransferase  31.35 
 
 		 488 aa  143  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  26.83 
 
 		 578 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  28.62 
 
 		 549 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  25.29 
 
 		 519 aa  136  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  29.35 
 
 		 899 aa  134  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  25.6 
 
 		 648 aa  134  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  26.45 
 
 		 530 aa  133  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  28.12 
 
 		 514 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.9 
 
 		 530 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  27.22 
 
 		 889 aa  131  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  29.18 
 
 		 614 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  26.88 
 
 		 482 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  26.44 
 
 		 484 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  31.36 
 
 		 624 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  23.5 
 
 		 536 aa  123  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 		 502 aa  121  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 538 aa  119  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  25.3 
 
 		 529 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3336  sulfotransferase  29.59 
 
 		 670 aa  118  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.850036 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 494 aa  117  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  28.74 
 
 		 742 aa  114  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  22.18 
 
 		 636 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3552  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 510 aa  104  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  23.39 
 
 		 533 aa  101  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1421  tetratricopeptide TPR_2  24.48 
 
 		 471 aa  101  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0844206  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  27.82 
 
 		 625 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1699  hypothetical protein  26.16 
 
 		 307 aa  96.3  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.860301  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0784  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 		 709 aa  85.9  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0799  sulfotransferase  24.68 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0670086  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1207  hypothetical protein  26.24 
 
 		 336 aa  73.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1208  hypothetical protein  27.19 
 
 		 347 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0641  sulfotransferase  24.65 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4121  sulfotransferase  21.4 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1264  SecC motif-containing protein  27.16 
 
 		 336 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00874366  hitchhiker  0.00404775 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1181  sulfotransferase  23.97 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.902134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  26.55 
 
 		 837 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 		 1037 aa  58.2  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4599  hypothetical protein  26.89 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1176  SecC motif-containing protein  25.75 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0258  sulfotransferase  21.74 
 
 		 626 aa  57.4  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3140  sulfotransferase  23.74 
 
 		 430 aa  57  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.615346  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1180  hypothetical protein  21.32 
 
 		 281 aa  56.6  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.771788 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3924  sulfotransferase  22.91 
 
 		 314 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0563915  normal  0.391317 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 3145 aa  54.7  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  21.7 
 
 		 681 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  25.66 
 
 		 3045 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1897  TPR repeat-containing protein  20.32 
 
 		 598 aa  50.8  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00502769  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2328  sulfotransferase  24.76 
 
 		 309 aa  50.8  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426443 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 		 505 aa  50.8  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0539  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 389 aa  48.9  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0059  tetratricopeptide repeat domain protein  26.36 
 
 		 656 aa  49.3  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  23.79 
 
 		 295 aa  48.5  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9233  hypothetical protein  24.26 
 
 		 290 aa  48.9  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2675  sulfotransferase  21.91 
 
 		 344 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.383164 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  23.79 
 
 		 301 aa  48.5  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 		 1714 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 1069 aa  48.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  23.79 
 
 		 295 aa  48.1  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 		 563 aa  47.4  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 		 3301 aa  47  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  24.04 
 
 		 815 aa  46.2  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 409 aa  46.6  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.14 
 
 		 632 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  23.95 
 
 		 574 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 		 3172 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0892  SecC motif-containing protein  26.57 
 
 		 342 aa  46.2  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.89 
 
 		 786 aa  45.8  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>