142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1174 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  100 
 
 		 531 aa  1101    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  52.34 
 
 		 546 aa  569  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  46.89 
 
 		 524 aa  489  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  33.46 
 
 		 673 aa  239  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  31.54 
 
 		 652 aa  226  9e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  31.16 
 
 		 669 aa  222  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  32.5 
 
 		 677 aa  221  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  29.86 
 
 		 542 aa  216  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  30.74 
 
 		 663 aa  210  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 573 aa  203  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  26.88 
 
 		 1764 aa  192  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  29.43 
 
 		 634 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  29.06 
 
 		 604 aa  181  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 		 1406 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  31.11 
 
 		 725 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 713 aa  168  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  27.61 
 
 		 695 aa  166  9e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  27.88 
 
 		 762 aa  164  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  27.88 
 
 		 762 aa  164  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 685 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  31.9 
 
 		 542 aa  157  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  28.87 
 
 		 717 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  26.1 
 
 		 637 aa  156  8e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  26.8 
 
 		 656 aa  153  7e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  27.56 
 
 		 532 aa  152  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 		 697 aa  151  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  26.95 
 
 		 548 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  30.59 
 
 		 889 aa  148  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  26.04 
 
 		 594 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  30.4 
 
 		 700 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  31.25 
 
 		 322 aa  146  9e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  28.88 
 
 		 720 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0167  sulfotransferase  31.39 
 
 		 488 aa  143  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  33.12 
 
 		 899 aa  140  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  26.74 
 
 		 514 aa  138  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  29.23 
 
 		 530 aa  137  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  29.63 
 
 		 578 aa  137  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  27.19 
 
 		 525 aa  137  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.74 
 
 		 530 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  29.18 
 
 		 519 aa  132  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  24.67 
 
 		 614 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  29.61 
 
 		 648 aa  130  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  26.78 
 
 		 549 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  23.98 
 
 		 529 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3336  sulfotransferase  30.77 
 
 		 670 aa  123  9e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.850036 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  26.68 
 
 		 536 aa  122  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  24.75 
 
 		 482 aa  120  6e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  32.33 
 
 		 624 aa  120  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  24.06 
 
 		 636 aa  116  8.999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  25 
 
 		 527 aa  116  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  22.54 
 
 		 502 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  31.38 
 
 		 742 aa  115  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  24.28 
 
 		 484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  28.16 
 
 		 533 aa  103  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 		 538 aa  100  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  22.47 
 
 		 494 aa  99.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3552  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 		 510 aa  92.8  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1699  hypothetical protein  27.04 
 
 		 307 aa  90.9  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.860301  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1421  tetratricopeptide TPR_2  23.54 
 
 		 471 aa  86.3  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0844206  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0784  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 		 709 aa  82.8  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  24.9 
 
 		 625 aa  79.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1207  hypothetical protein  24.66 
 
 		 336 aa  73.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0799  sulfotransferase  24.6 
 
 		 341 aa  72.4  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0670086  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1208  hypothetical protein  26.48 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0641  sulfotransferase  25.45 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4121  sulfotransferase  21.32 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0258  sulfotransferase  24.8 
 
 		 626 aa  66.6  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1181  sulfotransferase  24.05 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.902134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 		 597 aa  58.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3924  sulfotransferase  24.17 
 
 		 314 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0563915  normal  0.391317 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 563 aa  55.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2328  sulfotransferase  26.29 
 
 		 309 aa  54.3  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426443 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  23.98 
 
 		 864 aa  53.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 		 1037 aa  53.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 878 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 		 3145 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 		 542 aa  51.2  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  22.39 
 
 		 676 aa  51.2  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1176  SecC motif-containing protein  27.72 
 
 		 359 aa  51.2  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3251  hypothetical protein  30.4 
 
 		 320 aa  50.8  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 		 265 aa  50.8  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3108  sulfotransferase  24.2 
 
 		 370 aa  50.4  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 612 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 		 3301 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1180  hypothetical protein  20.09 
 
 		 281 aa  50.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.771788 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2481  hypothetical protein  25.11 
 
 		 269 aa  49.7  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  27.5 
 
 		 764 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 		 1252 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.63 
 
 		 602 aa  50.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 		 637 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 		 1252 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0738  hypothetical protein  22.49 
 
 		 318 aa  49.3  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2282  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.33 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.883499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.52 
 
 		 358 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.01 
 
 		 689 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3518  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.97 
 
 		 320 aa  48.5  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4599  hypothetical protein  25.3 
 
 		 362 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  25.34 
 
 		 1178 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  27.65 
 
 		 875 aa  47.8  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 968 aa  47.8  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>