More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3035 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  100 
 
 
677 aa  1357    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  50.15 
 
 
673 aa  609  1e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  53.93 
 
 
542 aa  540  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  50.39 
 
 
604 aa  492  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  42.79 
 
 
669 aa  476  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  49.81 
 
 
573 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  39.84 
 
 
663 aa  427  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  38.57 
 
 
652 aa  410  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  39.91 
 
 
634 aa  397  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  30.58 
 
 
1764 aa  278  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
697 aa  263  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 
1406 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  31.35 
 
 
725 aa  243  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  33.71 
 
 
695 aa  240  5e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  33.33 
 
 
700 aa  238  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  34.77 
 
 
530 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.64 
 
 
530 aa  234  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  32.5 
 
 
531 aa  221  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  31.23 
 
 
648 aa  221  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  31.97 
 
 
656 aa  211  5e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  35.24 
 
 
542 aa  209  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  28.75 
 
 
546 aa  208  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  27.37 
 
 
762 aa  201  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  27.37 
 
 
762 aa  201  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  30.04 
 
 
524 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  27.95 
 
 
527 aa  191  5e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  31.12 
 
 
889 aa  189  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  32.45 
 
 
525 aa  188  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  32.53 
 
 
578 aa  184  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  30.16 
 
 
637 aa  183  7e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  29.31 
 
 
536 aa  180  8e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 
685 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 
713 aa  176  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  32.35 
 
 
717 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  31.74 
 
 
533 aa  171  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  33 
 
 
720 aa  170  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  28.64 
 
 
532 aa  167  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  30 
 
 
899 aa  163  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  25.86 
 
 
519 aa  151  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  33.23 
 
 
549 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  33.75 
 
 
322 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  30.54 
 
 
742 aa  146  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0167  sulfotransferase  29.41 
 
 
488 aa  145  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  24.31 
 
 
484 aa  140  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  34.25 
 
 
624 aa  138  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  24.76 
 
 
548 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  26.31 
 
 
636 aa  135  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3336  sulfotransferase  32.15 
 
 
670 aa  132  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.850036 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  24.45 
 
 
502 aa  131  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  25 
 
 
482 aa  131  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  23.64 
 
 
529 aa  131  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 
494 aa  128  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  24.02 
 
 
594 aa  125  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  20.37 
 
 
614 aa  123  9e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  33.76 
 
 
538 aa  118  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  23.12 
 
 
514 aa  117  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  29.01 
 
 
625 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1699  hypothetical protein  29.03 
 
 
307 aa  99.4  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.860301  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.83 
 
 
725 aa  99  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3552  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 
510 aa  87  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157607  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  28.52 
 
 
587 aa  87  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.6 
 
 
810 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0258  sulfotransferase  28.1 
 
 
626 aa  85.1  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1421  tetratricopeptide TPR_2  21.66 
 
 
471 aa  80.5  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0844206  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 
681 aa  79.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  23.74 
 
 
764 aa  77.4  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 
878 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 
909 aa  76.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 
955 aa  76.6  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.35 
 
 
632 aa  74.3  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1897  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 
598 aa  73.2  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00502769  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0784  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 
709 aa  72.4  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.82 
 
 
3145 aa  72.4  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  23.42 
 
 
637 aa  72  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  23.18 
 
 
816 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  27.96 
 
 
545 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.14 
 
 
1676 aa  68.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  24.93 
 
 
935 aa  68.6  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.91 
 
 
927 aa  68.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  26.84 
 
 
622 aa  68.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.31 
 
 
466 aa  67.4  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 
3035 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  21.43 
 
 
1486 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  22.96 
 
 
448 aa  65.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.71 
 
 
1694 aa  65.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  23.16 
 
 
733 aa  65.1  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.85 
 
 
1979 aa  64.3  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 
265 aa  64.3  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  22.07 
 
 
979 aa  64.3  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 
808 aa  63.5  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  24.64 
 
 
865 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  27.8 
 
 
837 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 
634 aa  63.5  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  22.22 
 
 
1013 aa  63.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 
620 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  20.5 
 
 
436 aa  62.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 
636 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  22.76 
 
 
543 aa  63.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 
1085 aa  62.4  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 
639 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>