263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3552 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3552  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
510 aa  1028    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157607  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  25.05 
 
 
1764 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  24.66 
 
 
636 aa  133  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  29.79 
 
 
625 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  25.4 
 
 
530 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 
713 aa  114  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  26.63 
 
 
700 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 
1406 aa  110  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  23.61 
 
 
648 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 
538 aa  105  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  28.29 
 
 
624 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  25.36 
 
 
673 aa  105  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  25 
 
 
546 aa  104  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  26.79 
 
 
725 aa  103  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
697 aa  103  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  24.12 
 
 
637 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  23.92 
 
 
656 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.9 
 
 
530 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  22.13 
 
 
685 aa  100  7e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  22.45 
 
 
652 aa  100  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  24.04 
 
 
542 aa  99  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  25.24 
 
 
669 aa  98.2  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  26.34 
 
 
542 aa  97.8  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  23 
 
 
573 aa  92.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  24.67 
 
 
695 aa  92  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1897  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 
598 aa  91.7  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00502769  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  24.27 
 
 
531 aa  90.1  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  19.59 
 
 
514 aa  90.1  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  24.91 
 
 
604 aa  89.7  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  25.42 
 
 
578 aa  88.2  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  27.44 
 
 
549 aa  88.2  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  24.45 
 
 
663 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  24.45 
 
 
742 aa  85.1  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  20 
 
 
594 aa  84  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  20.13 
 
 
529 aa  83.2  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  23.66 
 
 
524 aa  82  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  23.64 
 
 
677 aa  81.3  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  22.55 
 
 
532 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  19.38 
 
 
484 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  24.22 
 
 
536 aa  77.4  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  21.62 
 
 
762 aa  75.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  21.62 
 
 
762 aa  75.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  24.62 
 
 
548 aa  74.3  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  19.87 
 
 
889 aa  73.9  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  20.92 
 
 
899 aa  73.9  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1421  tetratricopeptide TPR_2  25.75 
 
 
471 aa  73.9  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0844206  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  22.67 
 
 
720 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  23.96 
 
 
717 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  21.99 
 
 
527 aa  69.3  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  27.97 
 
 
3045 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  22.68 
 
 
634 aa  67.8  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0258  sulfotransferase  25.71 
 
 
626 aa  67  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  23.46 
 
 
533 aa  66.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  25.61 
 
 
525 aa  66.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 
808 aa  66.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  24.73 
 
 
322 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3336  sulfotransferase  26.56 
 
 
670 aa  62  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.850036 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
718 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 
472 aa  57.4  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  18.69 
 
 
502 aa  57.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 
827 aa  57.4  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 
653 aa  57  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  34.82 
 
 
520 aa  57.4  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  35.16 
 
 
653 aa  57  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0659  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 
2651 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  32 
 
 
436 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  19.08 
 
 
482 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.17 
 
 
565 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  19.35 
 
 
614 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 
4489 aa  55.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 
635 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  18.22 
 
 
494 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 
611 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0532  tetratricopeptide TPR_4  28.77 
 
 
2679 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 
635 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 
732 aa  54.7  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 
637 aa  54.3  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1699  hypothetical protein  23.83 
 
 
307 aa  54.3  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.860301  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 
767 aa  54.3  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 
505 aa  54.3  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 
542 aa  53.5  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  23.08 
 
 
875 aa  53.9  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  31.47 
 
 
587 aa  53.9  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 
556 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  31.67 
 
 
795 aa  53.5  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  30.97 
 
 
864 aa  52.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 
700 aa  52.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4121  sulfotransferase  23.18 
 
 
281 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0666  Tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 
575 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 
639 aa  51.6  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 
465 aa  51.6  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 
643 aa  51.2  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  24.29 
 
 
519 aa  51.2  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1865  amino acid adenylation domain protein  26.05 
 
 
1470 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1839  amino acid adenylation domain protein  26.05 
 
 
1470 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 
3560 aa  51.2  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 
602 aa  50.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2413  tetratricopeptide TPR_2  32.14 
 
 
307 aa  51.2  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 
689 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  31.15 
 
 
575 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>