More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0659 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0659  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 2651 aa  5238    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0532  tetratricopeptide TPR_4  80.94 
 
 		 2679 aa  4008    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2107  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.73 
 
 		 2492 aa  1648    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2538  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 		 2596 aa  1196    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0944  glycosyl transferase family 39  29.81 
 
 		 1391 aa  373  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2106  hypothetical protein  29.23 
 
 		 842 aa  197  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2874  hypothetical protein  30.8 
 
 		 794 aa  180  3e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.816639  normal  0.782461 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0504  hypothetical protein  27.85 
 
 		 729 aa  142  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2886  membrane protein-like protein  26.63 
 
 		 848 aa  134  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.690188  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0660  hypothetical protein  29.43 
 
 		 928 aa  127  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.506781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0945  membrane protein  27.81 
 
 		 743 aa  127  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2537  hypothetical protein  28.9 
 
 		 804 aa  126  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0531  uncharacterized membrane protein-like protein  27.99 
 
 		 939 aa  122  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0722  hypothetical protein  29.79 
 
 		 658 aa  118  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.257337  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0691  hypothetical protein  27.41 
 
 		 647 aa  114  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.723375  normal  0.166458 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0522  hypothetical protein  30 
 
 		 664 aa  112  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.427583 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1600  hypothetical protein  29.78 
 
 		 695 aa  112  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.496393  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2786  hypothetical protein  29.31 
 
 		 783 aa  102  9e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.520143  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1496  hypothetical protein  33.7 
 
 		 672 aa  97.1  5e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.702166  normal  0.0590672 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2672  hypothetical protein  30.81 
 
 		 697 aa  94  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 		 878 aa  87  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.64 
 
 		 810 aa  86.3  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2422  hypothetical protein  29.06 
 
 		 667 aa  80.9  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  31.85 
 
 		 676 aa  79.7  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  32.5 
 
 		 875 aa  77.4  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  32.7 
 
 		 681 aa  76.6  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 637 aa  75.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  35.54 
 
 		 465 aa  74.3  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  32.82 
 
 		 620 aa  74.3  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  32.06 
 
 		 620 aa  73.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 750 aa  73.6  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  31.1 
 
 		 816 aa  73.6  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  32.85 
 
 		 847 aa  73.6  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 		 685 aa  72  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  30.9 
 
 		 725 aa  72.4  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  37.17 
 
 		 612 aa  71.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 739 aa  71.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 909 aa  71.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  30 
 
 		 795 aa  71.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  29.45 
 
 		 622 aa  70.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  30.26 
 
 		 764 aa  70.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4645  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 349 aa  70.9  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.656867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 3172 aa  71.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 486 aa  70.9  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  37.17 
 
 		 636 aa  70.1  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.88 
 
 		 632 aa  70.1  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.37 
 
 		 626 aa  70.1  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  36.28 
 
 		 639 aa  69.3  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  33.6 
 
 		 864 aa  68.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 		 543 aa  68.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 362 aa  68.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  35.54 
 
 		 615 aa  68.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0815  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 		 235 aa  67  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0605859  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  32.7 
 
 		 614 aa  67  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  32.7 
 
 		 626 aa  67  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  32.7 
 
 		 614 aa  67  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 		 1737 aa  66.6  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  35.51 
 
 		 1085 aa  66.6  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.22 
 
 		 2240 aa  65.9  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  30.06 
 
 		 1486 aa  65.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  32.08 
 
 		 626 aa  65.1  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  32.08 
 
 		 614 aa  64.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  32.08 
 
 		 614 aa  64.7  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 265 aa  64.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 614 aa  64.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 3301 aa  64.7  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 265 aa  64.3  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 		 637 aa  64.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  29.66 
 
 		 603 aa  64.3  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 789 aa  64.3  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  38.52 
 
 		 686 aa  64.3  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 		 3145 aa  64.3  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  35.65 
 
 		 529 aa  64.3  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  30 
 
 		 887 aa  63.9  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 243 aa  63.9  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  37.74 
 
 		 530 aa  63.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  33.63 
 
 		 611 aa  63.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  35.09 
 
 		 340 aa  63.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.38 
 
 		 530 aa  63.2  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  29.41 
 
 		 745 aa  63.2  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 		 605 aa  62.8  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 		 927 aa  62.8  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 750 aa  62.8  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  33.97 
 
 		 2262 aa  62.8  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 366 aa  62.4  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  30.94 
 
 		 865 aa  62.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  27.95 
 
 		 266 aa  62  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0677  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 		 616 aa  61.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  30.43 
 
 		 560 aa  61.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  33.11 
 
 		 395 aa  61.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2423  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.79 
 
 		 415 aa  61.6  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  33.1 
 
 		 269 aa  61.6  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 280 aa  61.6  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 		 635 aa  61.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 		 635 aa  61.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 594 aa  61.6  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.68 
 
 		 265 aa  61.6  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.47 
 
 		 249 aa  61.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.47 
 
 		 249 aa  61.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 		 542 aa  61.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>