273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0601 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  100 
 
 
525 aa  1049    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  38.92 
 
 
532 aa  364  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  42.94 
 
 
536 aa  361  2e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  34.61 
 
 
527 aa  329  9e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  33.82 
 
 
1764 aa  239  8e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  31.1 
 
 
1406 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  33.08 
 
 
533 aa  231  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  36.36 
 
 
725 aa  226  7e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  32.29 
 
 
669 aa  224  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  35.33 
 
 
717 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 
573 aa  213  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  33.14 
 
 
648 aa  211  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  36.81 
 
 
578 aa  210  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  32.25 
 
 
695 aa  209  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  32.66 
 
 
530 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  35.91 
 
 
720 aa  207  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  33.94 
 
 
634 aa  207  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  33.24 
 
 
652 aa  207  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  39.94 
 
 
697 aa  205  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  34.69 
 
 
700 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.11 
 
 
530 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  39.93 
 
 
322 aa  203  7e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  35.99 
 
 
663 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  31.18 
 
 
673 aa  201  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  31.6 
 
 
677 aa  197  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  29.37 
 
 
542 aa  186  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  31.72 
 
 
604 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  35.43 
 
 
542 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  31.6 
 
 
656 aa  179  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1699  hypothetical protein  36.79 
 
 
307 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.860301  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 
685 aa  169  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  31.83 
 
 
889 aa  164  5.0000000000000005e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 
713 aa  163  6e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  25.54 
 
 
546 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3336  sulfotransferase  33.24 
 
 
670 aa  156  8e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.850036 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 
502 aa  153  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  30.03 
 
 
637 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  25.35 
 
 
514 aa  151  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  24.85 
 
 
594 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  31.97 
 
 
899 aa  150  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  28.53 
 
 
524 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 
494 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  27.71 
 
 
762 aa  143  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  27.71 
 
 
762 aa  143  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  31.58 
 
 
625 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  27.19 
 
 
531 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  32.14 
 
 
742 aa  140  7.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  27.26 
 
 
636 aa  139  8.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  24.29 
 
 
484 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  34.73 
 
 
519 aa  137  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  30.75 
 
 
624 aa  137  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  23.89 
 
 
482 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  30.12 
 
 
549 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0167  sulfotransferase  37.78 
 
 
488 aa  135  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  34.54 
 
 
538 aa  132  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  23.21 
 
 
529 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  22.4 
 
 
614 aa  125  3e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  25.41 
 
 
548 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  31.66 
 
 
1037 aa  85.9  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1421  tetratricopeptide TPR_2  26.82 
 
 
471 aa  84  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0844206  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3552  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 
510 aa  77.4  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157607  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  39.6 
 
 
639 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  36.54 
 
 
503 aa  70.9  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0258  sulfotransferase  28.63 
 
 
626 aa  69.3  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4121  sulfotransferase  23.75 
 
 
281 aa  67  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 
636 aa  67  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9233  hypothetical protein  29.05 
 
 
290 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  36.91 
 
 
637 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  36.91 
 
 
612 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  36.91 
 
 
635 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.95 
 
 
2240 aa  64.3  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  36.91 
 
 
635 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  36.91 
 
 
611 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1897  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 
598 aa  63.5  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00502769  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  38.24 
 
 
2262 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1697  CurM  27.76 
 
 
358 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778957  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  26.07 
 
 
573 aa  60.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  26.54 
 
 
1138 aa  60.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 
416 aa  60.1  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 
626 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  33.56 
 
 
620 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  37.24 
 
 
626 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1176  SecC motif-containing protein  27.63 
 
 
359 aa  59.7  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1208  hypothetical protein  27.8 
 
 
347 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  33.56 
 
 
620 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  35.81 
 
 
626 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  35.81 
 
 
614 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  35.81 
 
 
614 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  35.81 
 
 
614 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  35.81 
 
 
614 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  35.81 
 
 
614 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  35.81 
 
 
626 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0641  sulfotransferase  29.03 
 
 
346 aa  57.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  23.71 
 
 
816 aa  57  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 
566 aa  57  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 
693 aa  56.2  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0031  TPR repeat-containing protein  31.89 
 
 
522 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.09 
 
 
810 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4211  TPR repeat-containing protein  31.35 
 
 
522 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.185796 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  32.9 
 
 
1005 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>