More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3169 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 
604 aa  1201    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  58.91 
 
 
542 aa  620  1e-176  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  56.09 
 
 
673 aa  610  1e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  47.91 
 
 
677 aa  512  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  53.11 
 
 
573 aa  507  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  41.37 
 
 
669 aa  403  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  42.17 
 
 
663 aa  397  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  40.47 
 
 
652 aa  380  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  39.83 
 
 
634 aa  355  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  34.22 
 
 
1764 aa  260  6e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  35.24 
 
 
700 aa  259  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 
1406 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  32.3 
 
 
697 aa  238  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  34.3 
 
 
530 aa  229  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  30.6 
 
 
695 aa  227  5.0000000000000005e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  32.3 
 
 
725 aa  223  6e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.17 
 
 
530 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  28.63 
 
 
546 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  31.65 
 
 
648 aa  209  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  33.46 
 
 
542 aa  200  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  28.9 
 
 
532 aa  196  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  29.06 
 
 
531 aa  194  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  27.38 
 
 
637 aa  183  6e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  31.39 
 
 
578 aa  181  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  27.36 
 
 
527 aa  180  8e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  30.66 
 
 
717 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  26.2 
 
 
524 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  31.9 
 
 
525 aa  174  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  30.88 
 
 
656 aa  173  7.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 
685 aa  173  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  27.25 
 
 
762 aa  167  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  27.25 
 
 
762 aa  167  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  30.89 
 
 
720 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  32.62 
 
 
536 aa  162  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  27.16 
 
 
899 aa  160  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  29.96 
 
 
713 aa  159  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  30.02 
 
 
533 aa  159  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  29.28 
 
 
889 aa  159  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  34.15 
 
 
322 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0167  sulfotransferase  30.24 
 
 
488 aa  147  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  24.74 
 
 
529 aa  147  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  25.49 
 
 
484 aa  145  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 
502 aa  140  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  28.4 
 
 
549 aa  138  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  21.34 
 
 
614 aa  133  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  22.38 
 
 
514 aa  131  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  25.69 
 
 
519 aa  130  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  24.41 
 
 
594 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  22.8 
 
 
494 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  31.92 
 
 
624 aa  123  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3336  sulfotransferase  33.42 
 
 
670 aa  121  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.850036 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  26.54 
 
 
742 aa  120  7.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  22.74 
 
 
548 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  26.01 
 
 
636 aa  117  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  23.21 
 
 
482 aa  116  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  24.95 
 
 
538 aa  105  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  27.29 
 
 
625 aa  99  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3552  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 
510 aa  94.7  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157607  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1897  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 
598 aa  94  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00502769  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 
1276 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1699  hypothetical protein  27.85 
 
 
307 aa  88.2  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.860301  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 
878 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.12 
 
 
810 aa  80.9  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  31.16 
 
 
1694 aa  79.7  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 
4079 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1421  tetratricopeptide TPR_2  24.52 
 
 
471 aa  76.6  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0844206  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 
636 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0258  sulfotransferase  27.38 
 
 
626 aa  75.1  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 
637 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  33.76 
 
 
612 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 
639 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 
543 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.46 
 
 
632 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 
1094 aa  72.8  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 
4489 aa  71.2  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  23.73 
 
 
573 aa  71.2  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  32.9 
 
 
626 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  32.9 
 
 
626 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  32.9 
 
 
614 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  32.9 
 
 
614 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  32.9 
 
 
614 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  32.9 
 
 
614 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 
3145 aa  70.1  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 
620 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  25.54 
 
 
764 aa  68.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 
927 aa  68.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 
635 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  33.54 
 
 
713 aa  68.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 
635 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 
611 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.23 
 
 
401 aa  67.4  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871786  normal  0.459695 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  26.14 
 
 
622 aa  67  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 
1069 aa  66.6  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 
221 aa  66.6  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  31.85 
 
 
620 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  27.27 
 
 
795 aa  65.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 
747 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 
681 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  33.33 
 
 
1677 aa  65.1  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>