More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3470 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  100 
 
 		 532 aa  1109    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  47.47 
 
 		 527 aa  463  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  38.92 
 
 		 525 aa  348  2e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  35.2 
 
 		 536 aa  313  3.9999999999999997e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 1406 aa  242  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  30.95 
 
 		 533 aa  232  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  29.65 
 
 		 652 aa  219  8.999999999999998e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  33.41 
 
 		 1764 aa  219  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  30.45 
 
 		 695 aa  204  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  28.46 
 
 		 542 aa  195  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  27.65 
 
 		 663 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  28.08 
 
 		 669 aa  191  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  31.5 
 
 		 720 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  28.85 
 
 		 604 aa  191  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  28.83 
 
 		 530 aa  189  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  27.78 
 
 		 673 aa  187  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  32.71 
 
 		 725 aa  186  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  33.25 
 
 		 697 aa  184  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  30.94 
 
 		 717 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  29.49 
 
 		 648 aa  181  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  28.09 
 
 		 634 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29 
 
 		 530 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 		 573 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  32.63 
 
 		 889 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  34.59 
 
 		 322 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  29.27 
 
 		 542 aa  169  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  28.31 
 
 		 578 aa  168  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  32.37 
 
 		 899 aa  168  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  29.27 
 
 		 677 aa  167  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  31.08 
 
 		 700 aa  162  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  27.9 
 
 		 762 aa  159  8e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  27.9 
 
 		 762 aa  159  8e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  25.1 
 
 		 546 aa  157  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 685 aa  157  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3336  sulfotransferase  28.6 
 
 		 670 aa  152  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.850036 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  27.36 
 
 		 637 aa  151  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  27.56 
 
 		 531 aa  148  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  28.02 
 
 		 656 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  28.01 
 
 		 482 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0167  sulfotransferase  30.56 
 
 		 488 aa  141  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 502 aa  141  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  27.68 
 
 		 548 aa  137  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  25.97 
 
 		 524 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  25.79 
 
 		 484 aa  134  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  26.2 
 
 		 514 aa  131  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  28.16 
 
 		 529 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 538 aa  129  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 494 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 713 aa  128  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  25.14 
 
 		 594 aa  124  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  33.33 
 
 		 519 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  32.05 
 
 		 614 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  29.07 
 
 		 549 aa  117  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1699  hypothetical protein  26.93 
 
 		 307 aa  113  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.860301  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  28.57 
 
 		 624 aa  104  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  27.67 
 
 		 742 aa  104  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  27.97 
 
 		 625 aa  99.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  30.04 
 
 		 636 aa  94  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3552  TPR repeat-containing protein  22.55 
 
 		 510 aa  80.5  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1421  tetratricopeptide TPR_2  27.59 
 
 		 471 aa  79.7  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0844206  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0258  sulfotransferase  29.06 
 
 		 626 aa  76.3  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1897  TPR repeat-containing protein  22.36 
 
 		 598 aa  72.4  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00502769  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4599  hypothetical protein  25.35 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.49 
 
 		 632 aa  70.5  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 		 878 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.09 
 
 		 810 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 593 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0799  sulfotransferase  25.19 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0670086  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 602 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0784  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 709 aa  59.7  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.08 
 
 		 2240 aa  59.7  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1774  sulfotransferase domain-containing protein  25.99 
 
 		 358 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.588183 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4121  sulfotransferase  24.36 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1207  hypothetical protein  24.24 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0738  hypothetical protein  23.85 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0641  sulfotransferase  24.14 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 3145 aa  57.8  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 		 1037 aa  57.4  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  24.33 
 
 		 545 aa  57  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 		 828 aa  57  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 		 761 aa  57  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1208  hypothetical protein  26.73 
 
 		 347 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 		 3035 aa  56.2  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 527 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.7 
 
 		 739 aa  55.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 		 4079 aa  55.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1760  glycosyl transferase family 2  23.53 
 
 		 392 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 597 aa  55.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 375 aa  55.1  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  26 
 
 		 648 aa  55.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1364  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.75 
 
 		 264 aa  54.7  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000696413  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  31.51 
 
 		 1694 aa  54.3  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  40.85 
 
 		 732 aa  54.3  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 1276 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  36.62 
 
 		 1252 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  36.62 
 
 		 1252 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 		 376 aa  53.9  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 		 356 aa  53.5  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  25.47 
 
 		 587 aa  53.5  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>