72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0843 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  98.76 
 
 
717 aa  662    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  662    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  88.82 
 
 
720 aa  600  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  39.61 
 
 
1406 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3336  sulfotransferase  39.86 
 
 
670 aa  213  4.9999999999999996e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.850036 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  37.22 
 
 
1764 aa  202  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  39.35 
 
 
695 aa  202  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  40.19 
 
 
697 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  39.8 
 
 
525 aa  199  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  39.35 
 
 
725 aa  195  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  35.54 
 
 
648 aa  192  6e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  38.76 
 
 
700 aa  188  9e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  33.23 
 
 
652 aa  188  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  37.7 
 
 
536 aa  183  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  35.33 
 
 
530 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  36.86 
 
 
542 aa  177  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  31.83 
 
 
527 aa  177  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  34.08 
 
 
669 aa  175  9e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.78 
 
 
530 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  34.59 
 
 
532 aa  170  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  34.74 
 
 
542 aa  170  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  35.12 
 
 
578 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  35.78 
 
 
656 aa  166  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  35.08 
 
 
634 aa  166  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  32.01 
 
 
663 aa  159  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  35.83 
 
 
673 aa  159  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  33.97 
 
 
604 aa  156  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  32.8 
 
 
889 aa  153  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  28.27 
 
 
637 aa  152  8.999999999999999e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  31.72 
 
 
899 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 
573 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  30.51 
 
 
524 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  31.25 
 
 
531 aa  146  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  28.9 
 
 
546 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  33.12 
 
 
677 aa  141  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0167  sulfotransferase  31.41 
 
 
488 aa  140  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  30.43 
 
 
742 aa  136  4e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  31.97 
 
 
533 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  28.93 
 
 
594 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  29.37 
 
 
762 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  29.37 
 
 
762 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  31.58 
 
 
549 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 
685 aa  126  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  30.53 
 
 
614 aa  125  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  26.9 
 
 
548 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  30.94 
 
 
519 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  24.68 
 
 
514 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1699  hypothetical protein  28.25 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.860301  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 
494 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  29.83 
 
 
502 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 
713 aa  112  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  26.37 
 
 
484 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  25.25 
 
 
482 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 
538 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  30.97 
 
 
624 aa  106  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  24.52 
 
 
529 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  29.08 
 
 
625 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  28.81 
 
 
636 aa  87.8  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1421  tetratricopeptide TPR_2  26.5 
 
 
471 aa  70.9  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0844206  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0784  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
709 aa  68.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3552  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 
510 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157607  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9233  hypothetical protein  25.84 
 
 
290 aa  52.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0258  sulfotransferase  27.2 
 
 
626 aa  51.2  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 
1037 aa  50.4  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0831  hypothetical protein  30.34 
 
 
437 aa  47  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1208  hypothetical protein  25.35 
 
 
347 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1897  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 
598 aa  44.3  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00502769  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2328  sulfotransferase  28.77 
 
 
335 aa  44.3  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195926  normal  0.935915 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1180  hypothetical protein  23.93 
 
 
281 aa  44.3  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.771788 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0641  sulfotransferase  24.02 
 
 
346 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4121  sulfotransferase  22.81 
 
 
281 aa  43.5  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3552  sulfotransferase  23.44 
 
 
320 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0188645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>