More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3132 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  85.91 
 
 
717 aa  1066    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  100 
 
 
720 aa  1420    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  88.82 
 
 
322 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3336  sulfotransferase  35.51 
 
 
670 aa  290  9e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.850036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 
1406 aa  264  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  29.83 
 
 
1764 aa  258  3e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  34.35 
 
 
648 aa  246  9e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  33.17 
 
 
697 aa  237  5.0000000000000005e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  33.46 
 
 
695 aa  237  5.0000000000000005e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  33.07 
 
 
725 aa  235  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  35.34 
 
 
542 aa  214  7e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  32.26 
 
 
578 aa  209  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  30.42 
 
 
652 aa  207  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  33.97 
 
 
525 aa  204  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  30.72 
 
 
530 aa  204  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 
685 aa  201  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  34.17 
 
 
542 aa  199  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  33.9 
 
 
700 aa  197  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  29.75 
 
 
669 aa  197  8.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.13 
 
 
530 aa  194  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  29.12 
 
 
527 aa  193  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  30.76 
 
 
656 aa  192  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  29.74 
 
 
637 aa  192  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  31.5 
 
 
532 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  33.05 
 
 
536 aa  191  5e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  32.64 
 
 
673 aa  186  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  26.63 
 
 
594 aa  179  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  30.12 
 
 
634 aa  175  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  27.47 
 
 
762 aa  174  5.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  27.47 
 
 
762 aa  174  5.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  31.59 
 
 
573 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  27.57 
 
 
663 aa  170  8e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  32.03 
 
 
889 aa  170  9e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  31.1 
 
 
677 aa  167  8e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  31.52 
 
 
604 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  27.12 
 
 
546 aa  160  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  32.56 
 
 
899 aa  159  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  25.15 
 
 
514 aa  150  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0167  sulfotransferase  30.37 
 
 
488 aa  148  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  26.63 
 
 
524 aa  147  9e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  25.54 
 
 
529 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  31.27 
 
 
742 aa  142  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  27.81 
 
 
531 aa  142  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  32.23 
 
 
549 aa  141  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  24.54 
 
 
548 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 
713 aa  137  9e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  22.41 
 
 
614 aa  133  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  25.46 
 
 
482 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 
502 aa  131  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  28.78 
 
 
533 aa  130  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  23.82 
 
 
494 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  23.86 
 
 
484 aa  127  6e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  31.62 
 
 
519 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 
538 aa  112  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1699  hypothetical protein  29.43 
 
 
307 aa  108  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.860301  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  25.14 
 
 
636 aa  107  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 
909 aa  105  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  30.53 
 
 
624 aa  103  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 
878 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3958  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 
811 aa  100  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0310982  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
681 aa  97.4  9e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.58 
 
 
810 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 
637 aa  92.8  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  31.78 
 
 
865 aa  92.8  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  25.56 
 
 
625 aa  90.1  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 
505 aa  87.4  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
362 aa  87  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.09 
 
 
632 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.95 
 
 
725 aa  85.9  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  35.21 
 
 
714 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  29.9 
 
 
816 aa  82.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3552  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 
510 aa  82.4  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157607  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  26.67 
 
 
603 aa  82  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 
739 aa  82  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  37.11 
 
 
740 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 
1094 aa  78.6  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 
573 aa  78.2  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 
542 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 
612 aa  77.4  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  27.09 
 
 
750 aa  77  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
4489 aa  77  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.96 
 
 
689 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
583 aa  76.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  24.79 
 
 
1013 aa  76.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  26.29 
 
 
622 aa  76.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 
3035 aa  76.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 
4079 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  23.59 
 
 
795 aa  75.5  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  28.63 
 
 
581 aa  74.7  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.18 
 
 
543 aa  75.1  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  31.72 
 
 
714 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 
767 aa  74.3  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0784  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 
709 aa  73.9  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.03 
 
 
790 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  26.4 
 
 
564 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 
465 aa  73.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.89 
 
 
626 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  32.92 
 
 
620 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  27.15 
 
 
1694 aa  73.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  35.2 
 
 
614 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>