More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3942 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  100 
 
 
673 aa  1353    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  58.52 
 
 
542 aa  615  1e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  50.23 
 
 
677 aa  596  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  57.89 
 
 
604 aa  586  1e-166  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  59.24 
 
 
573 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  43.32 
 
 
669 aa  511  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  42.81 
 
 
663 aa  497  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  44.6 
 
 
634 aa  467  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  44.21 
 
 
652 aa  468  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  32.64 
 
 
1764 aa  298  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 
1406 aa  284  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  32.31 
 
 
695 aa  280  4e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  33.33 
 
 
725 aa  275  3e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 
697 aa  268  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  34.01 
 
 
648 aa  262  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  32.84 
 
 
700 aa  257  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  33.46 
 
 
531 aa  234  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  29.92 
 
 
546 aa  235  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  32.92 
 
 
530 aa  229  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.89 
 
 
530 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  30.33 
 
 
637 aa  224  4.9999999999999996e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  31.3 
 
 
656 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  27.55 
 
 
524 aa  208  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 
685 aa  207  6e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  33.27 
 
 
578 aa  202  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  31.33 
 
 
536 aa  202  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  27.08 
 
 
762 aa  201  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  27.08 
 
 
762 aa  201  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  38.1 
 
 
542 aa  200  9e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  28.13 
 
 
527 aa  194  6e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  30.78 
 
 
525 aa  187  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  27.78 
 
 
532 aa  187  6e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  31.7 
 
 
720 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  30.04 
 
 
533 aa  179  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  31.25 
 
 
717 aa  179  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0167  sulfotransferase  31.79 
 
 
488 aa  179  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  30.94 
 
 
899 aa  176  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  28.86 
 
 
889 aa  174  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  31.16 
 
 
624 aa  174  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 
713 aa  171  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  35.83 
 
 
322 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  31.83 
 
 
742 aa  158  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 
502 aa  148  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 
494 aa  148  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  27.07 
 
 
548 aa  146  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  26.8 
 
 
636 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  26.37 
 
 
484 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  23.62 
 
 
529 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  23.62 
 
 
514 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3336  sulfotransferase  32.44 
 
 
670 aa  140  7e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.850036 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  22.92 
 
 
594 aa  140  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  26.17 
 
 
519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  28.54 
 
 
549 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  25.89 
 
 
625 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  28.27 
 
 
614 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  21.4 
 
 
482 aa  117  5e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 
538 aa  108  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0258  sulfotransferase  28.46 
 
 
626 aa  105  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3552  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 
510 aa  105  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157607  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1421  tetratricopeptide TPR_2  23.73 
 
 
471 aa  99.4  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0844206  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1897  TPR repeat-containing protein  24.13 
 
 
598 aa  96.3  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00502769  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.62 
 
 
810 aa  90.9  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.99 
 
 
1694 aa  90.9  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1699  hypothetical protein  28.39 
 
 
307 aa  89  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.860301  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.31 
 
 
927 aa  87.4  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 
878 aa  87  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 
1276 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 
4079 aa  81.3  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 
505 aa  79.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 
1069 aa  79.7  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25.95 
 
 
1979 aa  79  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 
435 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  21.87 
 
 
816 aa  77.8  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 
681 aa  77  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 
909 aa  77  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0784  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 
709 aa  75.5  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  22.96 
 
 
745 aa  75.1  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  22.47 
 
 
543 aa  75.1  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  22.28 
 
 
465 aa  75.1  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 
662 aa  74.3  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  22.57 
 
 
725 aa  74.3  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 
1049 aa  74.3  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1311  hypothetical protein  23.48 
 
 
331 aa  73.9  0.000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 
465 aa  73.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.84 
 
 
622 aa  73.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.52 
 
 
466 aa  73.9  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  22.74 
 
 
366 aa  73.9  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  26.28 
 
 
865 aa  72.8  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 
740 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  28.41 
 
 
764 aa  72.8  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 
935 aa  72.4  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  22.01 
 
 
573 aa  72.4  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 
562 aa  72  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 
448 aa  71.6  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  25.34 
 
 
436 aa  71.6  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 
767 aa  72  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  22.76 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  19.62 
 
 
681 aa  71.6  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.99 
 
 
632 aa  71.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>