133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0768 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  53.04 
 
 
652 aa  702    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  100 
 
 
663 aa  1363    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  47.92 
 
 
669 aa  581  1e-164  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  43.02 
 
 
673 aa  491  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  41.9 
 
 
634 aa  448  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  39.84 
 
 
677 aa  422  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  41.1 
 
 
542 aa  410  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  42.6 
 
 
604 aa  387  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  40.12 
 
 
573 aa  383  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 
697 aa  285  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  37.78 
 
 
1764 aa  284  3.0000000000000004e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  38.61 
 
 
1406 aa  279  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  32.66 
 
 
725 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  33.13 
 
 
700 aa  253  7e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  32.68 
 
 
695 aa  249  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  31.93 
 
 
524 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.87 
 
 
530 aa  239  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  35.84 
 
 
530 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  33.26 
 
 
648 aa  235  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  31.27 
 
 
546 aa  231  5e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  30.58 
 
 
656 aa  224  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  37.24 
 
 
542 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  32.81 
 
 
578 aa  216  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  30.74 
 
 
531 aa  209  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  30.2 
 
 
637 aa  206  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  28.03 
 
 
527 aa  197  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  35.81 
 
 
525 aa  197  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  33.43 
 
 
889 aa  197  5.000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  31.28 
 
 
533 aa  196  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  27.65 
 
 
532 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  28.72 
 
 
762 aa  182  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  28.72 
 
 
762 aa  182  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  27.57 
 
 
536 aa  181  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  30.14 
 
 
899 aa  179  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  30.5 
 
 
717 aa  167  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  28.35 
 
 
720 aa  163  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  32.01 
 
 
322 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  31.31 
 
 
549 aa  159  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0167  sulfotransferase  27.79 
 
 
488 aa  157  9e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 
713 aa  156  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  31.37 
 
 
742 aa  150  6e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  24.93 
 
 
685 aa  149  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  33.98 
 
 
624 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  26.87 
 
 
636 aa  144  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3336  sulfotransferase  30.98 
 
 
670 aa  143  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.850036 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  27.06 
 
 
519 aa  134  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  29.77 
 
 
548 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 
538 aa  124  6e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  23.43 
 
 
529 aa  113  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  24.68 
 
 
614 aa  109  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  24.93 
 
 
482 aa  108  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  24.47 
 
 
514 aa  107  6e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  24.56 
 
 
484 aa  107  8e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  28.93 
 
 
625 aa  106  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  23.18 
 
 
502 aa  104  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  24.82 
 
 
594 aa  104  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1699  hypothetical protein  26.42 
 
 
307 aa  103  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.860301  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 
494 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0784  TPR repeat-containing protein  28.88 
 
 
709 aa  87.4  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0258  sulfotransferase  23.77 
 
 
626 aa  87.4  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3552  TPR repeat-containing protein  24.45 
 
 
510 aa  86.3  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157607  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1421  tetratricopeptide TPR_2  22.17 
 
 
471 aa  82.8  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0844206  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1897  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 
598 aa  69.7  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00502769  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9233  hypothetical protein  27.89 
 
 
290 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2481  hypothetical protein  26.46 
 
 
269 aa  63.5  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.49 
 
 
725 aa  61.2  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 
909 aa  58.9  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4121  sulfotransferase  24.58 
 
 
281 aa  58.9  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  28.93 
 
 
1073 aa  57.8  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
1037 aa  56.6  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1176  SecC motif-containing protein  27.56 
 
 
359 aa  56.6  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0799  sulfotransferase  23.68 
 
 
341 aa  57  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0670086  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3140  sulfotransferase  23.47 
 
 
430 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.615346  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 
878 aa  55.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  25.4 
 
 
1138 aa  54.3  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.93 
 
 
810 aa  54.3  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 
968 aa  54.3  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 
4079 aa  53.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  22.4 
 
 
676 aa  53.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  22.37 
 
 
1069 aa  53.1  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0641  sulfotransferase  24.05 
 
 
346 aa  51.6  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1937  hypothetical protein  23.65 
 
 
394 aa  51.2  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.314612  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 
3035 aa  51.2  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  29.08 
 
 
733 aa  50.8  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 
329 aa  50.8  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  23.48 
 
 
681 aa  50.8  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  38.64 
 
 
789 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0738  hypothetical protein  25.35 
 
 
318 aa  50.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  22.55 
 
 
1276 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  24.87 
 
 
1415 aa  49.7  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 
3145 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.8 
 
 
935 aa  49.3  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  19.26 
 
 
887 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1181  sulfotransferase  24.18 
 
 
266 aa  49.7  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.902134  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2061  sulfotransferase domain-containing protein  24.88 
 
 
291 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2197  sulfotransferase domain-containing protein  24.88 
 
 
296 aa  48.9  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.395211  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  23.01 
 
 
1094 aa  48.9  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 
718 aa  49.3  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.29 
 
 
764 aa  48.9  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.97 
 
 
689 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>