230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1176 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1176  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 359 aa  741    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1264  SecC motif-containing protein  57.02 
 
 		 336 aa  418  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00874366  hitchhiker  0.00404775 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0892  SecC motif-containing protein  52.08 
 
 		 342 aa  348  1e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0299  hypothetical protein  29.46 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.112405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3251  hypothetical protein  28.97 
 
 		 320 aa  107  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1839  amino acid adenylation domain protein  26.61 
 
 		 1470 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1865  amino acid adenylation domain protein  26.61 
 
 		 1470 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1208  hypothetical protein  25 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1760  hypothetical protein  30.22 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.50844  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0641  sulfotransferase  22.88 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0792  hypothetical protein  25 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.565262  normal  0.407437 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1946  hypothetical protein  26.14 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.428125  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1207  hypothetical protein  24.72 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0799  sulfotransferase  23.35 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0670086  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  26.61 
 
 		 542 aa  60.8  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  25.45 
 
 		 524 aa  60.8  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  22.92 
 
 		 527 aa  60.5  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0738  hypothetical protein  24.45 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3924  sulfotransferase  26.21 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0563915  normal  0.391317 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  27.63 
 
 		 525 aa  59.3  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  24.9 
 
 		 3045 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9233  hypothetical protein  28.05 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  24.11 
 
 		 762 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  24.11 
 
 		 762 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1656  hypothetical protein  28.65 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  25.75 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  27.56 
 
 		 663 aa  56.6  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  22.61 
 
 		 2762 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1181  sulfotransferase  26.58 
 
 		 266 aa  55.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.902134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  25.76 
 
 		 725 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22840  sulfotransferase  22.05 
 
 		 328 aa  53.5  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2490  preprotein translocase subunit SecA  42.86 
 
 		 968 aa  53.5  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.801958  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1189  hypothetical protein  25.49 
 
 		 626 aa  53.1  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0248  preprotein translocase subunit SecA  82.61 
 
 		 929 aa  52.8  0.000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0274  preprotein translocase subunit SecA  82.61 
 
 		 926 aa  52.8  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4599  hypothetical protein  21.43 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  25.43 
 
 		 700 aa  52.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0738  preprotein translocase subunit SecA  41.67 
 
 		 921 aa  52.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.687802  normal  0.0603491 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  24.14 
 
 		 652 aa  52.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  25.99 
 
 		 1037 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0167  sulfotransferase  28.44 
 
 		 488 aa  51.6  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2761  preprotein translocase subunit SecA  42.86 
 
 		 906 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3552  sulfotransferase  22.05 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0188645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5968  hypothetical protein  24.06 
 
 		 293 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258311  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  23.79 
 
 		 536 aa  50.8  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  26.29 
 
 		 669 aa  51.2  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  27.72 
 
 		 531 aa  51.2  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4121  sulfotransferase  24.8 
 
 		 281 aa  50.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3738  preprotein translocase, SecA subunit  66.67 
 
 		 947 aa  50.1  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361446  normal  0.764216 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4277  preprotein translocase, SecA subunit  43.75 
 
 		 1075 aa  50.4  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.259413  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3511  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 909 aa  50.4  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00666871  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2016  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 925 aa  50.4  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  22.65 
 
 		 578 aa  50.4  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1830  hypothetical protein  23.89 
 
 		 319 aa  50.1  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1169  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 908 aa  50.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2831  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 908 aa  50.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.125346  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0777  preprotein translocase subunit SecA  36.62 
 
 		 933 aa  50.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.648887  normal  0.618411 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1697  CurM  25.17 
 
 		 358 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778957  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2000  preprotein translocase, SecA subunit  65.38 
 
 		 934 aa  49.3  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000011814 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2607  preprotein translocase, SecA subunit  68 
 
 		 900 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.065848  hitchhiker  0.000000000349821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1957  hypothetical protein  22.83 
 
 		 292 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0877572 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  35.37 
 
 		 909 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  54.55 
 
 		 931 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  54.55 
 
 		 931 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4454  preprotein translocase, SecA subunit  70.83 
 
 		 893 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 932 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 932 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4809  sulfotransferase  23.84 
 
 		 424 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  23.67 
 
 		 549 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0287  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 964 aa  48.5  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.196625  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 932 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  24.45 
 
 		 1406 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0271  preprotein translocase, SecA subunit  29.79 
 
 		 1102 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.838205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 932 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  24.91 
 
 		 637 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1175  SecC motif-containing protein  39.44 
 
 		 383 aa  48.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3480  hypothetical protein  23.56 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.14232 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 		 934 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 931 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2714  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 		 934 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 931 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  25.82 
 
 		 648 aa  47.8  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 930 aa  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1420  protein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 935 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0249781 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  58.62 
 
 		 936 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 		 934 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1180  hypothetical protein  29.41 
 
 		 281 aa  47.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.771788 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 932 aa  47.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 931 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1320  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 931 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 931 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3540  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 931 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 931 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3461  preprotein translocase subunit SecA  58.62 
 
 		 936 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126577  decreased coverage  0.000173777 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1533  sulfotransferase  22.66 
 
 		 396 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251424  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  70.83 
 
 		 923 aa  47.4  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 902 aa  47.4  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  43.33 
 
 		 897 aa  47.4  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 		 904 aa  47  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  30.56 
 
 		 904 aa  47  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>