31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0738 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0738  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  652    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  26.25 
 
 
524 aa  67  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0299  hypothetical protein  25.22 
 
 
307 aa  60.8  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.112405  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1176  SecC motif-containing protein  24.45 
 
 
359 aa  60.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  23.85 
 
 
532 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  28.08 
 
 
578 aa  56.2  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0892  SecC motif-containing protein  22.08 
 
 
342 aa  53.1  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  24.82 
 
 
652 aa  51.2  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 
1406 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  25.35 
 
 
663 aa  50.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  25.66 
 
 
742 aa  50.1  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  22.49 
 
 
531 aa  49.7  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3251  hypothetical protein  24.51 
 
 
320 aa  48.9  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1830  hypothetical protein  24.77 
 
 
319 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  28.03 
 
 
1764 aa  48.1  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1760  hypothetical protein  29.06 
 
 
441 aa  47  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.50844  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  26.14 
 
 
542 aa  46.6  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  27.5 
 
 
637 aa  46.2  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  29.93 
 
 
669 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  26.15 
 
 
594 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0157  sulfotransferase  25.93 
 
 
281 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  26.06 
 
 
546 aa  44.3  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  27.15 
 
 
762 aa  43.9  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  27.15 
 
 
762 aa  43.9  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 
713 aa  43.1  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  25.56 
 
 
549 aa  43.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  26.87 
 
 
527 aa  43.1  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  27.78 
 
 
656 aa  42.7  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  26.32 
 
 
542 aa  42.7  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0784  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 
709 aa  42.4  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1264  SecC motif-containing protein  23.62 
 
 
336 aa  42.4  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00874366  hitchhiker  0.00404775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>