13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1830 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1830  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  661    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2594  hypothetical protein  29.8 
 
 		 339 aa  109  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.935519  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0831  hypothetical protein  26.74 
 
 		 437 aa  59.3  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1946  hypothetical protein  22.5 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.428125  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0892  SecC motif-containing protein  22.69 
 
 		 342 aa  50.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1176  SecC motif-containing protein  23.89 
 
 		 359 aa  50.1  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0738  hypothetical protein  24.77 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1264  SecC motif-containing protein  23.71 
 
 		 336 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00874366  hitchhiker  0.00404775 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12294  hypothetical protein  24.82 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3251  hypothetical protein  22.66 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  24.31 
 
 		 3045 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0641  sulfotransferase  22.08 
 
 		 346 aa  43.1  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22840  sulfotransferase  21.25 
 
 		 328 aa  43.1  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>