28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0299 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0299  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  626  1e-178  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.112405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3251  hypothetical protein  41.72 
 
 		 320 aa  209  6e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1264  SecC motif-containing protein  27.37 
 
 		 336 aa  116  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00874366  hitchhiker  0.00404775 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0892  SecC motif-containing protein  26.41 
 
 		 342 aa  114  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1176  SecC motif-containing protein  29.73 
 
 		 359 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0738  hypothetical protein  25.22 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1491  hypothetical protein  29.05 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  23.77 
 
 		 762 aa  53.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  23.77 
 
 		 762 aa  53.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  27.88 
 
 		 542 aa  52.4  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1760  hypothetical protein  29.95 
 
 		 441 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.50844  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2698  hypothetical protein  28.08 
 
 		 416 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2668  hypothetical protein  27.4 
 
 		 416 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2713  hypothetical protein  27.4 
 
 		 416 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629687  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  26.81 
 
 		 525 aa  47.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 1406 aa  46.2  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2594  hypothetical protein  26.98 
 
 		 339 aa  45.8  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.935519  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1946  hypothetical protein  23.55 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.428125  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0792  hypothetical protein  23.53 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.565262  normal  0.407437 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  26.22 
 
 		 578 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  20.35 
 
 		 524 aa  43.9  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  23.89 
 
 		 536 aa  43.9  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  23.53 
 
 		 652 aa  43.5  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3601  hypothetical protein  29.71 
 
 		 385 aa  43.5  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 		 573 aa  43.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  21.93 
 
 		 1764 aa  42.7  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  25.95 
 
 		 527 aa  42.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  22.98 
 
 		 634 aa  42.4  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>