56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1946 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1946  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  598  1e-170  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.428125  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0641  sulfotransferase  24.92 
 
 
346 aa  69.3  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1208  hypothetical protein  25.4 
 
 
347 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3108  sulfotransferase  28.83 
 
 
370 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3924  sulfotransferase  23 
 
 
314 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0563915  normal  0.391317 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1176  SecC motif-containing protein  26.14 
 
 
359 aa  64.7  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0892  SecC motif-containing protein  23.99 
 
 
342 aa  63.5  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0799  sulfotransferase  25.39 
 
 
341 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0670086  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  25.1 
 
 
637 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12294  hypothetical protein  25.23 
 
 
388 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3552  sulfotransferase  22 
 
 
320 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0188645 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4571  putative enzyme  32.35 
 
 
312 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1830  hypothetical protein  22.5 
 
 
319 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2244  sulfotransferase  24.76 
 
 
315 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00315501  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  26.09 
 
 
742 aa  57.4  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0792  hypothetical protein  24.46 
 
 
288 aa  56.2  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.565262  normal  0.407437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4121  sulfotransferase  22.18 
 
 
281 aa  56.2  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0831  hypothetical protein  23.81 
 
 
437 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1181  sulfotransferase  25.32 
 
 
266 aa  53.9  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.902134  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.66 
 
 
530 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1335  hypothetical protein  25.8 
 
 
292 aa  53.5  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1207  hypothetical protein  25.6 
 
 
336 aa  53.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996983  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1877  hypothetical protein  25.67 
 
 
389 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0767808 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  25.1 
 
 
648 aa  51.6  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  26.44 
 
 
530 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2758  hypothetical protein  25.09 
 
 
382 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2328  sulfotransferase  24.18 
 
 
309 aa  49.3  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.426443 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1943  hypothetical protein  25.33 
 
 
389 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1897  hypothetical protein  25.33 
 
 
389 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2481  hypothetical protein  20.69 
 
 
269 aa  48.9  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1180  hypothetical protein  33.33 
 
 
281 aa  48.9  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.771788 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1697  CurM  23.9 
 
 
358 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778957  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1481  sulfotransferase  21.59 
 
 
427 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4096  sulfotransferase  22.44 
 
 
282 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2494  hypothetical protein  23.53 
 
 
389 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1264  SecC motif-containing protein  21.51 
 
 
336 aa  46.6  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00874366  hitchhiker  0.00404775 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  24.44 
 
 
725 aa  46.6  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0295  sulfotransferase  23.23 
 
 
280 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5641  hypothetical protein  20.37 
 
 
427 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295138 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0299  hypothetical protein  23.55 
 
 
307 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.112405  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0295  sulfotransferase  23.23 
 
 
280 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1400  hypothetical protein  23.47 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.527187  hitchhiker  0.00390596 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  22.22 
 
 
899 aa  43.9  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0452  sulfotransferase domain-containing protein  25.57 
 
 
380 aa  43.5  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279842  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3105  sulfotransferase  27.66 
 
 
388 aa  43.1  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1957  hypothetical protein  26.56 
 
 
292 aa  43.1  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0877572 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1912  sulfotransferase  27.81 
 
 
319 aa  42.7  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275362  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4373  hypothetical protein  19.66 
 
 
386 aa  42.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0858648  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2761  sulfotransferase domain-containing protein  24.6 
 
 
396 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  24.08 
 
 
669 aa  42.4  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  24.9 
 
 
656 aa  42.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1026  sulfotransferase domain-containing protein  24.6 
 
 
392 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1323  sulfotransferase domain-containing protein  24.58 
 
 
423 aa  42.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2617  hypothetical protein  24.58 
 
 
392 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0878707  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0179  sulfotransferase domain-containing protein  24.6 
 
 
384 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0154  sulfotransferase domain-containing protein  24.6 
 
 
384 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>