77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12294 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12294  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  801    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0831  hypothetical protein  33.8 
 
 
437 aa  240  4e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30814  predicted protein  28.65 
 
 
389 aa  167  4e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0754602 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1729  sulfotransferase  33.12 
 
 
336 aa  155  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.534947  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1491  hypothetical protein  24.61 
 
 
360 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0918  hypothetical protein  24.8 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.800878 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2758  hypothetical protein  28.62 
 
 
382 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0287  hypothetical protein  26.09 
 
 
383 aa  76.6  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.295688  normal  0.52564 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2756  hypothetical protein  24.09 
 
 
461 aa  74.3  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.834394  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0925  hypothetical protein  27.34 
 
 
386 aa  72  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2451  hypothetical protein  26.28 
 
 
424 aa  70.5  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00674159  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2832  hypothetical protein  26.27 
 
 
374 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13562  hypothetical protein  24.25 
 
 
384 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000084012 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2494  hypothetical protein  28.2 
 
 
389 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3480  hypothetical protein  25.17 
 
 
393 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.14232 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0373  hypothetical protein  26.45 
 
 
403 aa  66.2  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5227  hypothetical protein  26.89 
 
 
381 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422187  normal  0.126406 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1627  hypothetical protein  25.89 
 
 
411 aa  65.1  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139041  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2635  hypothetical protein  27.56 
 
 
334 aa  63.5  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247113  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1533  sulfotransferase  26.57 
 
 
396 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251424  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3525  hypothetical protein  25.09 
 
 
485 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3601  hypothetical protein  24.81 
 
 
385 aa  62  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1531  hypothetical protein  26.05 
 
 
381 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1946  hypothetical protein  25.38 
 
 
300 aa  60.1  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.428125  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5493  sulfotransferase  23.64 
 
 
397 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320737  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0307  hypothetical protein  25.31 
 
 
379 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.765461  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5028  hypothetical protein  25.65 
 
 
383 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.298773  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4645  hypothetical protein  25.95 
 
 
383 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4373  hypothetical protein  24.9 
 
 
386 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0858648  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4733  hypothetical protein  25.95 
 
 
383 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1877  hypothetical protein  27.7 
 
 
389 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0767808 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2017  hypothetical protein  25.17 
 
 
375 aa  57  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1652  hypothetical protein  22.81 
 
 
434 aa  57  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5641  hypothetical protein  25.62 
 
 
427 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1208  hypothetical protein  25.61 
 
 
347 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4074  hypothetical protein  24.82 
 
 
391 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.436936  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1943  hypothetical protein  26.35 
 
 
389 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1897  hypothetical protein  26.35 
 
 
389 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2268  hypothetical protein  26.24 
 
 
390 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3286  hypothetical protein  26.17 
 
 
388 aa  54.3  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0641  sulfotransferase  23.67 
 
 
346 aa  53.9  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3664  hypothetical protein  23.88 
 
 
388 aa  53.5  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0232635  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0799  sulfotransferase  25 
 
 
341 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0670086  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4385  hypothetical protein  25 
 
 
385 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  28.21 
 
 
2762 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3642  hypothetical protein  25 
 
 
394 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.964783  normal  0.499897 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3552  sulfotransferase  25.68 
 
 
320 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0188645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6396  hypothetical protein  25.38 
 
 
381 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1252  hypothetical protein  25.62 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.330438 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1830  hypothetical protein  24.82 
 
 
319 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  26.62 
 
 
624 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1697  CurM  31.58 
 
 
358 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778957  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4230  hypothetical protein  25.98 
 
 
423 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2328  sulfotransferase  26.54 
 
 
309 aa  47.8  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.426443 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1181  sulfotransferase  25.56 
 
 
266 aa  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.902134  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 
538 aa  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0295  sulfotransferase  30 
 
 
280 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5540  hypothetical protein  27.15 
 
 
412 aa  47.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  25.93 
 
 
634 aa  47.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  29.41 
 
 
1764 aa  47  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0295  sulfotransferase  30 
 
 
280 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  21.54 
 
 
673 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  29.73 
 
 
725 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4599  hypothetical protein  26.92 
 
 
362 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0792  hypothetical protein  23.72 
 
 
288 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.565262  normal  0.407437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1207  hypothetical protein  22.98 
 
 
336 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996983  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  66.67 
 
 
525 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0452  sulfotransferase domain-containing protein  27.33 
 
 
380 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279842  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  27.21 
 
 
700 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2230  hypothetical protein  23.26 
 
 
419 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0849644  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4115  hypothetical protein  22.46 
 
 
409 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  24.4 
 
 
648 aa  43.5  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  27.35 
 
 
519 aa  43.5  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  23.39 
 
 
546 aa  43.5  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2324  hypothetical protein  23.74 
 
 
383 aa  43.5  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0395191 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2481  hypothetical protein  26.04 
 
 
269 aa  42.7  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3111  sulfotransferase  25 
 
 
329 aa  42.7  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>