56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1897 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1897  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  801    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1943  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  801    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2494  hypothetical protein  81.44 
 
 
389 aa  644    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1877  hypothetical protein  98.97 
 
 
389 aa  791    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0767808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4401  hypothetical protein  53.55 
 
 
393 aa  411  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0373  hypothetical protein  35.66 
 
 
403 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3525  hypothetical protein  33.67 
 
 
485 aa  157  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1652  hypothetical protein  29.55 
 
 
434 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2187  hypothetical protein  31.16 
 
 
435 aa  150  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5641  hypothetical protein  28.53 
 
 
427 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295138 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4074  hypothetical protein  31.23 
 
 
391 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.436936  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4115  hypothetical protein  30.29 
 
 
409 aa  135  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4809  sulfotransferase  30.65 
 
 
424 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2268  hypothetical protein  30.56 
 
 
390 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2230  hypothetical protein  29.5 
 
 
419 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0849644  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1960  hypothetical protein  30.56 
 
 
429 aa  122  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2451  hypothetical protein  31.99 
 
 
424 aa  122  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00674159  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3642  hypothetical protein  30.4 
 
 
422 aa  120  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.222709  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6396  hypothetical protein  28.32 
 
 
381 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4385  hypothetical protein  29.32 
 
 
385 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3301  hypothetical protein  29.67 
 
 
416 aa  116  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2324  hypothetical protein  29.43 
 
 
383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0395191 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2713  hypothetical protein  28.65 
 
 
416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629687  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2668  hypothetical protein  28.65 
 
 
416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2698  hypothetical protein  28.39 
 
 
416 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2758  hypothetical protein  32.6 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0925  hypothetical protein  28.95 
 
 
386 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2832  hypothetical protein  30.14 
 
 
374 aa  103  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5493  sulfotransferase  29.44 
 
 
397 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320737  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3286  hypothetical protein  28.35 
 
 
388 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1531  hypothetical protein  28.32 
 
 
381 aa  100  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4373  hypothetical protein  28.65 
 
 
386 aa  99  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0858648  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1533  sulfotransferase  28.68 
 
 
396 aa  97.8  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251424  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4645  hypothetical protein  28.46 
 
 
383 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4733  hypothetical protein  28.46 
 
 
383 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2017  hypothetical protein  27.58 
 
 
375 aa  97.1  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5028  hypothetical protein  28.46 
 
 
383 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.298773  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3601  hypothetical protein  28.31 
 
 
385 aa  95.9  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13562  hypothetical protein  27.46 
 
 
384 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000084012 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0307  hypothetical protein  26.22 
 
 
379 aa  92.8  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.765461  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2953  hypothetical protein  28.07 
 
 
376 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3642  hypothetical protein  25.72 
 
 
394 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.964783  normal  0.499897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5227  hypothetical protein  27.88 
 
 
381 aa  92  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422187  normal  0.126406 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0287  hypothetical protein  27.07 
 
 
383 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.295688  normal  0.52564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2635  hypothetical protein  28.7 
 
 
334 aa  90.1  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247113  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3664  hypothetical protein  25.52 
 
 
388 aa  89.4  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0232635  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3480  hypothetical protein  25.45 
 
 
393 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.14232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4230  hypothetical protein  25.58 
 
 
423 aa  87  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3729  hypothetical protein  25.26 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1627  hypothetical protein  26.74 
 
 
411 aa  73.9  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139041  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1831  hypothetical protein  24.68 
 
 
383 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5540  hypothetical protein  25.23 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0831  hypothetical protein  25.74 
 
 
437 aa  64.7  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12294  hypothetical protein  26.71 
 
 
388 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1946  hypothetical protein  25.33 
 
 
300 aa  48.9  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.428125  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1774  sulfotransferase domain-containing protein  29.01 
 
 
358 aa  43.5  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.588183 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>