12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1335 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1335  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  590  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1400  hypothetical protein  57 
 
 
308 aa  335  7e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.527187  hitchhiker  0.00390596 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2244  sulfotransferase  47.9 
 
 
315 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00315501  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5968  hypothetical protein  50.34 
 
 
293 aa  280  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258311  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1957  hypothetical protein  48.48 
 
 
292 aa  269  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0877572 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1946  hypothetical protein  25.8 
 
 
300 aa  60.8  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.428125  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1207  hypothetical protein  29.49 
 
 
336 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996983  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0641  sulfotransferase  23.6 
 
 
346 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0799  sulfotransferase  24.83 
 
 
341 aa  49.7  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0670086  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1208  hypothetical protein  27.56 
 
 
347 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3251  hypothetical protein  28.11 
 
 
320 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0792  hypothetical protein  24.6 
 
 
288 aa  42.7  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.565262  normal  0.407437 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>