37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4571 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4571  putative enzyme  100 
 
 		 312 aa  642    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1933  sulfotransferase-like protein  39.09 
 
 		 347 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.345912  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1177  sulfotransferase  32.72 
 
 		 325 aa  165  8e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4096  sulfotransferase  28.38 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2683  sulfotransferase-like protein  34.62 
 
 		 308 aa  145  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3976  hypothetical protein  32.14 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1483  sulfotransferase domain-containing protein  31.99 
 
 		 358 aa  126  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1941  hypothetical protein  32.7 
 
 		 320 aa  125  8.000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.944736  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0381  hypothetical protein  26.58 
 
 		 305 aa  122  9e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.593972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0562  hypothetical protein  29.36 
 
 		 319 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5203  hypothetical protein  28.83 
 
 		 325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.471663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8599  hypothetical protein  30.18 
 
 		 319 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0437  hypothetical protein  22.92 
 
 		 329 aa  92.4  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.474392  normal  0.018516 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18740  hypothetical protein  28.19 
 
 		 320 aa  90.9  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.856365  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3147  hypothetical protein  28.39 
 
 		 447 aa  89  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.130118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25581  hypothetical protein  25.68 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0203  hypothetical protein  25.71 
 
 		 284 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0173  hypothetical protein  27.52 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.919474  normal  0.0584223 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1798  hypothetical protein  25.09 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1946  hypothetical protein  32.35 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.428125  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2328  sulfotransferase  28.21 
 
 		 309 aa  53.1  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426443 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_6258  hypothetical protein  30.91 
 
 		 241 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4074  hypothetical protein  30.91 
 
 		 241 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.488227  normal  0.187336 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2761  sulfotransferase domain-containing protein  23.9 
 
 		 396 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0179  sulfotransferase domain-containing protein  23.9 
 
 		 384 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2617  hypothetical protein  23.9 
 
 		 392 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0878707  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0154  sulfotransferase domain-containing protein  23.9 
 
 		 384 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1323  sulfotransferase domain-containing protein  23.9 
 
 		 423 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1026  sulfotransferase domain-containing protein  23.9 
 
 		 392 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1208  hypothetical protein  25.64 
 
 		 347 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1180  hypothetical protein  35.11 
 
 		 281 aa  46.6  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.771788 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0641  sulfotransferase  22.56 
 
 		 346 aa  46.2  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1839  amino acid adenylation domain protein  22.13 
 
 		 1470 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1865  amino acid adenylation domain protein  22.13 
 
 		 1470 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0452  sulfotransferase domain-containing protein  25.13 
 
 		 380 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279842  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1912  sulfotransferase  26.45 
 
 		 319 aa  43.5  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3104  sulfotransferase  26.55 
 
 		 368 aa  43.1  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>