18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1957 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1957  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  578  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0877572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5968  hypothetical protein  71.92 
 
 
293 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258311  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2244  sulfotransferase  55.02 
 
 
315 aa  317  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00315501  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1400  hypothetical protein  47.78 
 
 
308 aa  266  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.527187  hitchhiker  0.00390596 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1335  hypothetical protein  48.48 
 
 
292 aa  260  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1207  hypothetical protein  25.91 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996983  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0641  sulfotransferase  24.13 
 
 
346 aa  68.9  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1208  hypothetical protein  23.62 
 
 
347 aa  58.9  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3924  sulfotransferase  27.81 
 
 
314 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0563915  normal  0.391317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0799  sulfotransferase  26.52 
 
 
341 aa  57  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0670086  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3552  sulfotransferase  27.38 
 
 
320 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0188645 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2328  sulfotransferase  27.23 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.426443 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4599  hypothetical protein  18.47 
 
 
362 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1176  SecC motif-containing protein  22.83 
 
 
359 aa  49.3  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3104  sulfotransferase  27.83 
 
 
368 aa  46.6  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1181  sulfotransferase  30.05 
 
 
266 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.902134  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0892  SecC motif-containing protein  18.58 
 
 
342 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1946  hypothetical protein  26.56 
 
 
300 aa  43.1  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.428125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>