164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1264 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1264  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 336 aa  695    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00874366  hitchhiker  0.00404775 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1176  SecC motif-containing protein  57.02 
 
 		 359 aa  418  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0892  SecC motif-containing protein  54.84 
 
 		 342 aa  359  3e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0299  hypothetical protein  27.37 
 
 		 307 aa  116  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.112405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3251  hypothetical protein  27.59 
 
 		 320 aa  106  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1865  amino acid adenylation domain protein  25.74 
 
 		 1470 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1839  amino acid adenylation domain protein  25.74 
 
 		 1470 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0792  hypothetical protein  24.6 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.565262  normal  0.407437 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  27.16 
 
 		 546 aa  62.8  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1760  hypothetical protein  25.25 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.50844  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1208  hypothetical protein  23.05 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  25.85 
 
 		 2762 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5968  hypothetical protein  25.26 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258311  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22840  sulfotransferase  22.33 
 
 		 328 aa  53.9  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1181  sulfotransferase  26.27 
 
 		 266 aa  53.1  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.902134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1990  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 911 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0641  sulfotransferase  22.13 
 
 		 346 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  22.64 
 
 		 384 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4599  hypothetical protein  22.69 
 
 		 362 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  24.38 
 
 		 527 aa  50.4  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1207  hypothetical protein  20.3 
 
 		 336 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  23.45 
 
 		 1037 aa  50.4  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3738  preprotein translocase, SecA subunit  52.94 
 
 		 947 aa  50.1  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361446  normal  0.764216 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4232  preprotein translocase subunit SecA  45.83 
 
 		 930 aa  50.1  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41363  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0101  preprotein translocase subunit SecA  26.17 
 
 		 865 aa  50.1  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.17444  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  30.77 
 
 		 578 aa  50.1  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1020  preprotein translocase subunit SecA  46.34 
 
 		 862 aa  49.7  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0966  preprotein translocase subunit SecA  46.34 
 
 		 862 aa  49.7  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00335629  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1165  preprotein translocase subunit SecA  46.34 
 
 		 862 aa  49.7  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0921  preprotein translocase subunit SecA  45.1 
 
 		 862 aa  49.3  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.895177  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  24.44 
 
 		 762 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1149  preprotein translocase subunit SecA  48 
 
 		 862 aa  48.5  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.498004  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  24.44 
 
 		 762 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0799  sulfotransferase  21.71 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0670086  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1830  hypothetical protein  23.71 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2525  preprotein translocase, SecA subunit  52.78 
 
 		 949 aa  48.5  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1817  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 911 aa  48.1  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.513906  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4035  preprotein translocase, SecA subunit  43.48 
 
 		 954 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3140  sulfotransferase  24.57 
 
 		 430 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.615346  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  48.78 
 
 		 939 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002976  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  29.09 
 
 		 205 aa  47.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  24.55 
 
 		 542 aa  47  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  23.79 
 
 		 524 aa  47  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 573 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3552  sulfotransferase  22.26 
 
 		 320 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0188645 
 
 
-
 
NC_004310  BR1945  preprotein translocase subunit SecA  43.59 
 
 		 906 aa  46.6  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.267461  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9233  hypothetical protein  23.4 
 
 		 290 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1871  preprotein translocase subunit SecA  43.59 
 
 		 906 aa  47  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25156  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09010  protein translocase subunit secA  57.69 
 
 		 920 aa  46.6  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.665713  normal  0.0250229 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1946  hypothetical protein  21.51 
 
 		 300 aa  46.6  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.428125  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2599  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 901 aa  46.6  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.213228  normal  0.874755 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3254  preprotein translocase, SecA subunit  60 
 
 		 956 aa  46.2  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  44.74 
 
 		 932 aa  46.6  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 		 914 aa  46.2  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 		 914 aa  46.2  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0287  preprotein translocase subunit SecA  57.69 
 
 		 964 aa  46.2  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.196625  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1687  preprotein translocase subunit SecA  38.3 
 
 		 842 aa  46.2  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1730  preprotein translocase, SecA subunit  83.33 
 
 		 935 aa  46.2  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2505  preprotein translocase, SecA subunit  62.96 
 
 		 981 aa  45.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.297054  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 904 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  70 
 
 		 903 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 915 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0485  preprotein translocase subunit SecA  44.44 
 
 		 951 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2758  hypothetical protein  20.55 
 
 		 382 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0225  preprotein translocase, SecA subunit  57.69 
 
 		 914 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 910 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0379  hypothetical protein  24.56 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.574766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57220  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 916 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  22.98 
 
 		 3045 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1440  protein translocase subunit secA  55.17 
 
 		 937 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1420  protein translocase subunit SecA  58.33 
 
 		 935 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0249781 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 		 980 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  47.73 
 
 		 916 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0401  preprotein translocase, SecA subunit  57.69 
 
 		 914 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0753123 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0737  preprotein translocase, SecA subunit  70 
 
 		 963 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0793771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1756  preprotein translocase, SecA subunit  70 
 
 		 970 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 931 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0708  preprotein translocase, SecA subunit  70 
 
 		 958 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 931 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 930 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2268  protein translocase subunit secA  70 
 
 		 955 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  43.18 
 
 		 906 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1478  preprotein translocase, SecA subunit  70 
 
 		 970 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130752 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 912 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 931 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1320  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 931 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 931 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3540  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 931 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 931 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4120  hypothetical protein  24.69 
 
 		 274 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0502651 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 909 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2016  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 925 aa  44.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2607  preprotein translocase, SecA subunit  51.72 
 
 		 900 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.065848  hitchhiker  0.000000000349821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0777  preprotein translocase subunit SecA  46.88 
 
 		 933 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.648887  normal  0.618411 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0910  preprotein translocase, SecA subunit  66.67 
 
 		 971 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.822535  normal  0.604814 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1478  preprotein translocase, SecA subunit  70 
 
 		 970 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.301651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  24.58 
 
 		 634 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1791  preprotein translocase, SecA subunit  70 
 
 		 958 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29973  normal  0.0159583 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2490  preprotein translocase subunit SecA  57.69 
 
 		 968 aa  44.3  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.801958  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  27.2 
 
 		 542 aa  44.3  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>