More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1757 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  84.72 
 
 
530 aa  918    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
530 aa  1085    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  40.17 
 
 
1406 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  38.18 
 
 
648 aa  319  7.999999999999999e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  33.97 
 
 
1764 aa  298  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  34.11 
 
 
697 aa  267  5e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  33.05 
 
 
725 aa  256  5e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  35.93 
 
 
695 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  33.91 
 
 
652 aa  243  5e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  36.06 
 
 
700 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  35.62 
 
 
634 aa  240  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  35.87 
 
 
663 aa  239  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  35.65 
 
 
669 aa  231  3e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  35.24 
 
 
677 aa  229  7e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  33.89 
 
 
673 aa  228  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 
573 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  33.27 
 
 
542 aa  223  8e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  37.53 
 
 
542 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  33.78 
 
 
604 aa  216  7e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  32.46 
 
 
717 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  32.71 
 
 
536 aa  207  5e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  30.81 
 
 
637 aa  202  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  33.13 
 
 
656 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  32.45 
 
 
525 aa  197  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  30.48 
 
 
578 aa  189  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  30.93 
 
 
720 aa  189  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  29 
 
 
532 aa  178  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  34.78 
 
 
322 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  30.08 
 
 
889 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  30.33 
 
 
762 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  30.33 
 
 
762 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  27.84 
 
 
527 aa  159  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  33.21 
 
 
899 aa  158  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  31.84 
 
 
533 aa  154  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  30.95 
 
 
524 aa  152  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
685 aa  150  5e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  28.2 
 
 
548 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3336  sulfotransferase  32.33 
 
 
670 aa  147  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.850036 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  27.41 
 
 
742 aa  145  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  31.55 
 
 
549 aa  134  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  23.46 
 
 
514 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  26.9 
 
 
546 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0167  sulfotransferase  29.33 
 
 
488 aa  130  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 
713 aa  130  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  27.74 
 
 
531 aa  130  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  25.73 
 
 
614 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  25.06 
 
 
482 aa  128  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  23.95 
 
 
529 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  27.7 
 
 
625 aa  126  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  30.28 
 
 
624 aa  124  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  25.29 
 
 
594 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  24.22 
 
 
484 aa  117  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 
538 aa  114  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 
502 aa  113  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1699  hypothetical protein  29.31 
 
 
307 aa  107  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.860301  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  23.19 
 
 
494 aa  103  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  30.15 
 
 
519 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3552  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 
510 aa  102  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157607  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  35.21 
 
 
887 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  23.57 
 
 
636 aa  97.8  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.99 
 
 
810 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 
878 aa  93.6  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 
927 aa  89  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 
1737 aa  87.8  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  45.37 
 
 
639 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  29.44 
 
 
795 aa  84.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  37.23 
 
 
465 aa  83.6  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  33.33 
 
 
560 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 
3172 aa  81.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  32.21 
 
 
762 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  34.36 
 
 
626 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  34.36 
 
 
614 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1421  tetratricopeptide TPR_2  24.07 
 
 
471 aa  81.3  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0844206  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  34.36 
 
 
614 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 
615 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
547 aa  80.1  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  42.59 
 
 
637 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.61 
 
 
632 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 
3301 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 
1486 aa  80.1  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  41.67 
 
 
626 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  41.67 
 
 
614 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  30.14 
 
 
340 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  24.72 
 
 
670 aa  79.3  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  41.67 
 
 
614 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 
636 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 
543 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 
612 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  41.67 
 
 
614 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  41.67 
 
 
611 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  41.67 
 
 
635 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  41.67 
 
 
635 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0258  sulfotransferase  27.51 
 
 
626 aa  78.6  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  31.72 
 
 
637 aa  78.2  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 
4489 aa  77.8  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 
909 aa  77.8  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.71 
 
 
397 aa  77.8  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  37.21 
 
 
623 aa  77.4  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 
739 aa  76.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>