More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3163 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  100 
 
 		 700 aa  1397    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  56.2 
 
 		 697 aa  753    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  58.12 
 
 		 725 aa  770    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  53.71 
 
 		 695 aa  668    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  37.61 
 
 		 1764 aa  452  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  37.94 
 
 		 1406 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  35.63 
 
 		 648 aa  311  2e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  36.39 
 
 		 656 aa  287  4e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  32.19 
 
 		 652 aa  285  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  36.63 
 
 		 530 aa  265  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  31.95 
 
 		 673 aa  261  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  34.5 
 
 		 663 aa  258  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  32.83 
 
 		 669 aa  257  6e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.06 
 
 		 530 aa  250  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  35.24 
 
 		 604 aa  249  9e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  38.55 
 
 		 542 aa  244  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  33.87 
 
 		 677 aa  243  7.999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  35.19 
 
 		 542 aa  242  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  33.27 
 
 		 573 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  29.98 
 
 		 889 aa  224  4.9999999999999996e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  33.58 
 
 		 578 aa  221  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 685 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  37.76 
 
 		 536 aa  218  4e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  31.27 
 
 		 634 aa  217  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  28.38 
 
 		 762 aa  204  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  28.38 
 
 		 762 aa  204  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  33.88 
 
 		 717 aa  200  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  34.36 
 
 		 899 aa  198  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  34.29 
 
 		 525 aa  198  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  28.63 
 
 		 527 aa  196  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  29.18 
 
 		 637 aa  195  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  33.04 
 
 		 720 aa  191  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  38.76 
 
 		 322 aa  188  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  25.11 
 
 		 594 aa  175  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  31.57 
 
 		 549 aa  175  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  31.94 
 
 		 532 aa  174  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  40.74 
 
 		 732 aa  169  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  26.29 
 
 		 546 aa  165  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.14 
 
 		 810 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 		 878 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3336  sulfotransferase  31.62 
 
 		 670 aa  157  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.850036 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  29.67 
 
 		 624 aa  154  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 713 aa  152  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  29.36 
 
 		 742 aa  148  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  30.4 
 
 		 531 aa  146  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  37.58 
 
 		 828 aa  145  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0167  sulfotransferase  30.77 
 
 		 488 aa  145  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.83 
 
 		 632 aa  143  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 3145 aa  141  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  28.26 
 
 		 519 aa  141  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  29.64 
 
 		 533 aa  140  8.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  36.6 
 
 		 828 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  35.69 
 
 		 754 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  29.04 
 
 		 524 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  25.05 
 
 		 548 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  26.6 
 
 		 636 aa  137  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  24.89 
 
 		 529 aa  137  8e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 		 754 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  37.29 
 
 		 639 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 681 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 		 808 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  32.34 
 
 		 789 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  29.58 
 
 		 816 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  33.54 
 
 		 824 aa  132  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  29.39 
 
 		 625 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  23.6 
 
 		 514 aa  131  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  35.17 
 
 		 612 aa  131  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 		 909 aa  130  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  43.5 
 
 		 833 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  36.54 
 
 		 637 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  36.88 
 
 		 635 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  36.88 
 
 		 635 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  36.63 
 
 		 611 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.55 
 
 		 1022 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  21.28 
 
 		 614 aa  127  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 4489 aa  127  8.000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  35.97 
 
 		 612 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  36.3 
 
 		 636 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.03 
 
 		 988 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  41.46 
 
 		 833 aa  126  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.95 
 
 		 818 aa  124  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  34.12 
 
 		 620 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  36.96 
 
 		 715 aa  123  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  33.45 
 
 		 620 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  35.97 
 
 		 828 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.33 
 
 		 784 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  29.07 
 
 		 875 aa  122  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  34.67 
 
 		 626 aa  122  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  23.3 
 
 		 502 aa  122  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  30.57 
 
 		 1694 aa  121  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 649 aa  120  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  31.32 
 
 		 1276 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  31.2 
 
 		 482 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  34.32 
 
 		 615 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  33.47 
 
 		 637 aa  118  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.94 
 
 		 689 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3552  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 510 aa  117  6.9999999999999995e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 494 aa  116  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 538 aa  116  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  35.55 
 
 		 614 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>