89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03828 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  100 
 
 
533 aa  1068    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  33.27 
 
 
536 aa  234  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  30.95 
 
 
532 aa  232  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  27.87 
 
 
527 aa  221  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  32.69 
 
 
525 aa  206  9e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  31.89 
 
 
634 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  31.88 
 
 
652 aa  202  8e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  31.28 
 
 
663 aa  196  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  28.63 
 
 
1406 aa  183  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  30.04 
 
 
673 aa  180  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  28.68 
 
 
669 aa  180  5.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  27.68 
 
 
1764 aa  178  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  31.34 
 
 
677 aa  167  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  32.52 
 
 
695 aa  163  7e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  28.79 
 
 
542 aa  162  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  29.04 
 
 
578 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  30.48 
 
 
725 aa  161  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  30.71 
 
 
530 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  29.82 
 
 
604 aa  156  7e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 
573 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.84 
 
 
530 aa  154  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 
697 aa  151  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  32.81 
 
 
656 aa  146  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  33.64 
 
 
542 aa  141  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  30.13 
 
 
717 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  31.97 
 
 
322 aa  134  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  27.16 
 
 
648 aa  131  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  28.78 
 
 
720 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  29.16 
 
 
700 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  27.08 
 
 
889 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3336  sulfotransferase  31.4 
 
 
670 aa  128  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.850036 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  25.51 
 
 
762 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  25.51 
 
 
762 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  26.43 
 
 
519 aa  120  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  24.18 
 
 
637 aa  119  9e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0167  sulfotransferase  34.08 
 
 
488 aa  117  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  25.98 
 
 
899 aa  114  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  31.47 
 
 
742 aa  114  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 
713 aa  114  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  31.62 
 
 
624 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  25.62 
 
 
524 aa  105  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  21.86 
 
 
685 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  28.16 
 
 
531 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  23.39 
 
 
546 aa  101  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  25.28 
 
 
549 aa  98.6  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  25.73 
 
 
484 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  24.89 
 
 
614 aa  95.1  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  25.2 
 
 
529 aa  94  6e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  21.01 
 
 
482 aa  93.2  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 
538 aa  90.9  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  26.36 
 
 
594 aa  89.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 
494 aa  86.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1699  hypothetical protein  27.24 
 
 
307 aa  86.7  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.860301  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  27.78 
 
 
548 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  24.28 
 
 
514 aa  82.4  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  20.34 
 
 
502 aa  82  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0258  sulfotransferase  28.94 
 
 
626 aa  71.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  24.76 
 
 
636 aa  70.5  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1897  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 
598 aa  68.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00502769  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  26.5 
 
 
625 aa  67.8  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3552  TPR repeat-containing protein  23.46 
 
 
510 aa  66.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157607  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0784  TPR repeat-containing protein  22.1 
 
 
709 aa  59.3  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4121  sulfotransferase  22.55 
 
 
281 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  30.28 
 
 
3045 aa  55.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4599  hypothetical protein  21.53 
 
 
362 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1180  hypothetical protein  24.19 
 
 
281 aa  53.9  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.771788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0799  sulfotransferase  24.48 
 
 
341 aa  53.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0670086  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9233  hypothetical protein  28.8 
 
 
290 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  23.44 
 
 
1037 aa  52  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1208  hypothetical protein  25.56 
 
 
347 aa  51.6  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3140  sulfotransferase  22.07 
 
 
430 aa  50.8  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.615346  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1421  tetratricopeptide TPR_2  20.14 
 
 
471 aa  50.1  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0844206  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2787  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.59 
 
 
333 aa  50.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1965  hypothetical protein  25.93 
 
 
310 aa  48.9  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.763325  normal  0.0611171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2832  hypothetical protein  25 
 
 
374 aa  48.5  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4373  hypothetical protein  23.49 
 
 
386 aa  48.9  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0858648  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3601  hypothetical protein  25.26 
 
 
385 aa  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 
766 aa  47.4  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0452  sulfotransferase domain-containing protein  25.32 
 
 
380 aa  46.6  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279842  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3525  hypothetical protein  22.81 
 
 
485 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1207  hypothetical protein  24.56 
 
 
336 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996983  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2243  hypothetical protein  33.03 
 
 
349 aa  45.8  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0641  sulfotransferase  24.35 
 
 
346 aa  45.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6196  NodH sulfotransferase  29.21 
 
 
247 aa  45.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.871142  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  27.11 
 
 
929 aa  44.3  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1323  sulfotransferase domain-containing protein  24.81 
 
 
423 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3924  sulfotransferase  22.77 
 
 
314 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0563915  normal  0.391317 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1026  sulfotransferase domain-containing protein  24.89 
 
 
392 aa  43.5  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2617  hypothetical protein  24.89 
 
 
392 aa  43.5  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0878707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>