63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3601 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3601  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  786    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1531  hypothetical protein  64.55 
 
 
381 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13562  hypothetical protein  65.78 
 
 
384 aa  513  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000084012 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5028  hypothetical protein  63.23 
 
 
383 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.298773  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5227  hypothetical protein  63.23 
 
 
381 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422187  normal  0.126406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4733  hypothetical protein  63.23 
 
 
383 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4645  hypothetical protein  63.23 
 
 
383 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0925  hypothetical protein  64.02 
 
 
386 aa  502  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2758  hypothetical protein  63.3 
 
 
382 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2832  hypothetical protein  60.05 
 
 
374 aa  450  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4373  hypothetical protein  55.15 
 
 
386 aa  424  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0858648  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2635  hypothetical protein  58.75 
 
 
334 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247113  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2017  hypothetical protein  45.62 
 
 
375 aa  333  4e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0307  hypothetical protein  39.22 
 
 
379 aa  250  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.765461  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5641  hypothetical protein  34.68 
 
 
427 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295138 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0287  hypothetical protein  38.42 
 
 
383 aa  210  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.295688  normal  0.52564 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1652  hypothetical protein  34.93 
 
 
434 aa  199  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3525  hypothetical protein  33.61 
 
 
485 aa  190  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4074  hypothetical protein  35.92 
 
 
391 aa  188  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.436936  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5493  sulfotransferase  35.62 
 
 
397 aa  185  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320737  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2187  hypothetical protein  34.41 
 
 
435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1627  hypothetical protein  33.62 
 
 
411 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139041  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1831  hypothetical protein  31.78 
 
 
383 aa  169  7e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1533  sulfotransferase  33.15 
 
 
396 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251424  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3286  hypothetical protein  34.51 
 
 
388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6396  hypothetical protein  32.84 
 
 
381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2324  hypothetical protein  32.11 
 
 
383 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0395191 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2268  hypothetical protein  34.13 
 
 
390 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2953  hypothetical protein  35.73 
 
 
376 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2451  hypothetical protein  31.5 
 
 
424 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00674159  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2698  hypothetical protein  33.42 
 
 
416 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2713  hypothetical protein  33.16 
 
 
416 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629687  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2668  hypothetical protein  33.16 
 
 
416 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3664  hypothetical protein  28.95 
 
 
388 aa  151  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0232635  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4115  hypothetical protein  28.8 
 
 
409 aa  149  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3729  hypothetical protein  31.23 
 
 
387 aa  149  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4809  sulfotransferase  31.93 
 
 
424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2230  hypothetical protein  29.33 
 
 
419 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0849644  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3642  hypothetical protein  31.36 
 
 
394 aa  143  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.964783  normal  0.499897 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4385  hypothetical protein  30.27 
 
 
385 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3480  hypothetical protein  30.77 
 
 
393 aa  133  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.14232 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3642  hypothetical protein  30.9 
 
 
422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.222709  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1960  hypothetical protein  28.46 
 
 
429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5540  hypothetical protein  32.38 
 
 
412 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3301  hypothetical protein  28.91 
 
 
416 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4401  hypothetical protein  31.32 
 
 
393 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0373  hypothetical protein  30.05 
 
 
403 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4230  hypothetical protein  27.59 
 
 
423 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2494  hypothetical protein  28.46 
 
 
389 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1897  hypothetical protein  28.31 
 
 
389 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1943  hypothetical protein  28.31 
 
 
389 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1877  hypothetical protein  28.42 
 
 
389 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0767808 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12294  hypothetical protein  24.81 
 
 
388 aa  62  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2756  hypothetical protein  27.35 
 
 
461 aa  62  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.834394  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0831  hypothetical protein  24.73 
 
 
437 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1729  sulfotransferase  25.69 
 
 
336 aa  57.4  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.534947  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1491  hypothetical protein  28.29 
 
 
360 aa  52.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4599  hypothetical protein  20.53 
 
 
362 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  25.26 
 
 
533 aa  48.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0799  sulfotransferase  25 
 
 
341 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0670086  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30814  predicted protein  26.24 
 
 
389 aa  46.6  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0754602 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1181  sulfotransferase  27.43 
 
 
266 aa  45.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.902134  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0299  hypothetical protein  29.71 
 
 
307 aa  43.1  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.112405  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>