60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2230 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4115  hypothetical protein  90.66 
 
 
409 aa  764    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2230  hypothetical protein  100 
 
 
419 aa  857    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0849644  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4809  sulfotransferase  50 
 
 
424 aa  394  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1960  hypothetical protein  48.88 
 
 
429 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2668  hypothetical protein  46.08 
 
 
416 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2698  hypothetical protein  45.83 
 
 
416 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2713  hypothetical protein  46.08 
 
 
416 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629687  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4385  hypothetical protein  47.93 
 
 
385 aa  351  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3301  hypothetical protein  40.89 
 
 
416 aa  292  9e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3642  hypothetical protein  40.15 
 
 
422 aa  288  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.222709  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4230  hypothetical protein  34.41 
 
 
423 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5493  sulfotransferase  33.77 
 
 
397 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320737  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0307  hypothetical protein  30.37 
 
 
379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.765461  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3525  hypothetical protein  30.48 
 
 
485 aa  184  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3664  hypothetical protein  30.85 
 
 
388 aa  183  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0232635  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1533  sulfotransferase  31.98 
 
 
396 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251424  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3642  hypothetical protein  30.45 
 
 
394 aa  180  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.964783  normal  0.499897 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5641  hypothetical protein  28.87 
 
 
427 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295138 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3286  hypothetical protein  32.21 
 
 
388 aa  178  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1652  hypothetical protein  30.39 
 
 
434 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2832  hypothetical protein  34.15 
 
 
374 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2758  hypothetical protein  33.87 
 
 
382 aa  176  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2268  hypothetical protein  33.77 
 
 
390 aa  176  7e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4074  hypothetical protein  32.89 
 
 
391 aa  173  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.436936  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3480  hypothetical protein  30.29 
 
 
393 aa  169  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.14232 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2635  hypothetical protein  33.64 
 
 
334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247113  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6396  hypothetical protein  30.81 
 
 
381 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3729  hypothetical protein  30.37 
 
 
387 aa  161  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0287  hypothetical protein  31.01 
 
 
383 aa  156  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.295688  normal  0.52564 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13562  hypothetical protein  31.54 
 
 
384 aa  155  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000084012 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1831  hypothetical protein  30.79 
 
 
383 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1531  hypothetical protein  30.19 
 
 
381 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4733  hypothetical protein  31.47 
 
 
383 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4645  hypothetical protein  31.47 
 
 
383 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0925  hypothetical protein  33.06 
 
 
386 aa  152  8.999999999999999e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2017  hypothetical protein  31.98 
 
 
375 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5028  hypothetical protein  31.47 
 
 
383 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.298773  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2187  hypothetical protein  27.3 
 
 
435 aa  151  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5227  hypothetical protein  31.2 
 
 
381 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422187  normal  0.126406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2324  hypothetical protein  30.48 
 
 
383 aa  149  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0395191 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1627  hypothetical protein  29.18 
 
 
411 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139041  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3601  hypothetical protein  29.33 
 
 
385 aa  147  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2451  hypothetical protein  30.77 
 
 
424 aa  144  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00674159  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4373  hypothetical protein  30.45 
 
 
386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0858648  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5540  hypothetical protein  30.19 
 
 
412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1877  hypothetical protein  29.5 
 
 
389 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0767808 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1943  hypothetical protein  29.5 
 
 
389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1897  hypothetical protein  29.5 
 
 
389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2494  hypothetical protein  28.18 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4401  hypothetical protein  27.78 
 
 
393 aa  106  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2953  hypothetical protein  27.54 
 
 
376 aa  103  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0373  hypothetical protein  25.96 
 
 
403 aa  95.5  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30814  predicted protein  24.53 
 
 
389 aa  62.4  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0754602 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0831  hypothetical protein  28.32 
 
 
437 aa  54.3  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1729  sulfotransferase  23.69 
 
 
336 aa  53.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.534947  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4121  sulfotransferase  23.73 
 
 
281 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2756  hypothetical protein  22.89 
 
 
461 aa  47.4  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.834394  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1656  hypothetical protein  23.14 
 
 
378 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12294  hypothetical protein  23.63 
 
 
388 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0641  sulfotransferase  24.6 
 
 
346 aa  43.9  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>