66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0307 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0307  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  774    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.765461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13562  hypothetical protein  40.8 
 
 		 384 aa  268  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000084012 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3601  hypothetical protein  39.22 
 
 		 385 aa  250  3e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2832  hypothetical protein  38.73 
 
 		 374 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0287  hypothetical protein  39.79 
 
 		 383 aa  237  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.295688  normal  0.52564 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0925  hypothetical protein  35.44 
 
 		 386 aa  233  4.0000000000000004e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5227  hypothetical protein  35.69 
 
 		 381 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422187  normal  0.126406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2758  hypothetical protein  36.96 
 
 		 382 aa  231  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2635  hypothetical protein  40.98 
 
 		 334 aa  230  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247113  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1531  hypothetical protein  35.08 
 
 		 381 aa  227  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4373  hypothetical protein  36.36 
 
 		 386 aa  226  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0858648  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4733  hypothetical protein  34.78 
 
 		 383 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4645  hypothetical protein  34.78 
 
 		 383 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5028  hypothetical protein  34.51 
 
 		 383 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.298773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5641  hypothetical protein  32.17 
 
 		 427 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295138 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2017  hypothetical protein  33.16 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4115  hypothetical protein  30.97 
 
 		 409 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2268  hypothetical protein  34.79 
 
 		 390 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1652  hypothetical protein  32.45 
 
 		 434 aa  194  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3525  hypothetical protein  32.73 
 
 		 485 aa  187  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2230  hypothetical protein  30.37 
 
 		 419 aa  186  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0849644  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2187  hypothetical protein  32.13 
 
 		 435 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1627  hypothetical protein  33.43 
 
 		 411 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139041  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1533  sulfotransferase  32.98 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251424  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4809  sulfotransferase  30.53 
 
 		 424 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4074  hypothetical protein  31.09 
 
 		 391 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.436936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5493  sulfotransferase  34.28 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320737  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2668  hypothetical protein  31.82 
 
 		 416 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2713  hypothetical protein  31.82 
 
 		 416 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629687  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2698  hypothetical protein  31.64 
 
 		 416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3642  hypothetical protein  31.5 
 
 		 394 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.964783  normal  0.499897 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4385  hypothetical protein  29.41 
 
 		 385 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3480  hypothetical protein  28.95 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.14232 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2451  hypothetical protein  32.19 
 
 		 424 aa  161  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00674159  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3664  hypothetical protein  30 
 
 		 388 aa  158  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0232635  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1960  hypothetical protein  28.23 
 
 		 429 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6396  hypothetical protein  29.57 
 
 		 381 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3642  hypothetical protein  31.05 
 
 		 422 aa  153  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.222709  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2324  hypothetical protein  29.26 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0395191 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3729  hypothetical protein  28.72 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1831  hypothetical protein  28.15 
 
 		 383 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3286  hypothetical protein  26.98 
 
 		 388 aa  139  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4230  hypothetical protein  29.22 
 
 		 423 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3301  hypothetical protein  30.93 
 
 		 416 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2953  hypothetical protein  31.15 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5540  hypothetical protein  29.46 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2494  hypothetical protein  29.3 
 
 		 389 aa  102  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4401  hypothetical protein  26.62 
 
 		 393 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1897  hypothetical protein  26.22 
 
 		 389 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1943  hypothetical protein  26.22 
 
 		 389 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0373  hypothetical protein  23.8 
 
 		 403 aa  91.3  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1877  hypothetical protein  25.96 
 
 		 389 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0767808 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0831  hypothetical protein  23.46 
 
 		 437 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2756  hypothetical protein  32 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.834394  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12294  hypothetical protein  25.31 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1729  sulfotransferase  24.09 
 
 		 336 aa  57  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.534947  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3111  sulfotransferase  30 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1208  hypothetical protein  23.29 
 
 		 347 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1491  hypothetical protein  24.21 
 
 		 360 aa  53.1  0.000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1656  hypothetical protein  26.87 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  32.05 
 
 		 525 aa  50.1  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  25.74 
 
 		 1764 aa  49.3  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30814  predicted protein  27.68 
 
 		 389 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0754602 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1176  SecC motif-containing protein  27.07 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0641  sulfotransferase  22.04 
 
 		 346 aa  43.1  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 1406 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>