58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1652 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1652  hypothetical protein  100 
 
 
434 aa  910    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3525  hypothetical protein  62.53 
 
 
485 aa  530  1e-149  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2187  hypothetical protein  59.9 
 
 
435 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5641  hypothetical protein  40.6 
 
 
427 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295138 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2451  hypothetical protein  35.73 
 
 
424 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00674159  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4074  hypothetical protein  37.43 
 
 
391 aa  251  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.436936  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2268  hypothetical protein  38.6 
 
 
390 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3642  hypothetical protein  34.9 
 
 
394 aa  225  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.964783  normal  0.499897 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1533  sulfotransferase  33.51 
 
 
396 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251424  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4809  sulfotransferase  33.16 
 
 
424 aa  209  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2324  hypothetical protein  35.1 
 
 
383 aa  205  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0395191 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2758  hypothetical protein  37.33 
 
 
382 aa  203  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0925  hypothetical protein  32.15 
 
 
386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6396  hypothetical protein  32.87 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3601  hypothetical protein  34.93 
 
 
385 aa  199  6e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3664  hypothetical protein  32.29 
 
 
388 aa  198  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0232635  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4115  hypothetical protein  32.81 
 
 
409 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13562  hypothetical protein  32.53 
 
 
384 aa  197  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000084012 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3286  hypothetical protein  32.38 
 
 
388 aa  196  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1627  hypothetical protein  31.19 
 
 
411 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139041  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0307  hypothetical protein  32.45 
 
 
379 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.765461  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4733  hypothetical protein  33.7 
 
 
383 aa  193  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4645  hypothetical protein  33.7 
 
 
383 aa  193  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5493  sulfotransferase  30.71 
 
 
397 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320737  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5028  hypothetical protein  33.42 
 
 
383 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.298773  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5227  hypothetical protein  32.52 
 
 
381 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422187  normal  0.126406 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1531  hypothetical protein  32.8 
 
 
381 aa  187  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2698  hypothetical protein  31.51 
 
 
416 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2713  hypothetical protein  31.51 
 
 
416 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629687  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2668  hypothetical protein  31.51 
 
 
416 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3301  hypothetical protein  31.95 
 
 
416 aa  186  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4373  hypothetical protein  31.34 
 
 
386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0858648  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5540  hypothetical protein  31.85 
 
 
412 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2832  hypothetical protein  32.87 
 
 
374 aa  182  7e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3729  hypothetical protein  31.41 
 
 
387 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3480  hypothetical protein  31.77 
 
 
393 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.14232 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2230  hypothetical protein  30.39 
 
 
419 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0849644  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1831  hypothetical protein  32.01 
 
 
383 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2953  hypothetical protein  32.86 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3642  hypothetical protein  30.91 
 
 
422 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.222709  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2017  hypothetical protein  31.81 
 
 
375 aa  171  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0373  hypothetical protein  34.52 
 
 
403 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0287  hypothetical protein  31.35 
 
 
383 aa  167  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.295688  normal  0.52564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2635  hypothetical protein  31.78 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247113  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1960  hypothetical protein  28.91 
 
 
429 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4385  hypothetical protein  29.97 
 
 
385 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1943  hypothetical protein  29.55 
 
 
389 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1897  hypothetical protein  29.55 
 
 
389 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2494  hypothetical protein  30.1 
 
 
389 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4401  hypothetical protein  31.75 
 
 
393 aa  150  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1877  hypothetical protein  29.29 
 
 
389 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0767808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4230  hypothetical protein  27.6 
 
 
423 aa  136  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2756  hypothetical protein  23.32 
 
 
461 aa  73.6  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.834394  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1729  sulfotransferase  23.95 
 
 
336 aa  58.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.534947  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12294  hypothetical protein  22.81 
 
 
388 aa  57  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0831  hypothetical protein  21.39 
 
 
437 aa  56.6  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30814  predicted protein  23.45 
 
 
389 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0754602 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1491  hypothetical protein  22.9 
 
 
360 aa  50.8  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>