59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3664 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3664  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  790    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0232635  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3286  hypothetical protein  50.13 
 
 
388 aa  388  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3642  hypothetical protein  47.29 
 
 
394 aa  355  5.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.964783  normal  0.499897 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3729  hypothetical protein  41.47 
 
 
387 aa  272  6e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5493  sulfotransferase  36.75 
 
 
397 aa  239  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320737  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1533  sulfotransferase  35.16 
 
 
396 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251424  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3525  hypothetical protein  33.94 
 
 
485 aa  212  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5641  hypothetical protein  30.79 
 
 
427 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295138 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1652  hypothetical protein  32.29 
 
 
434 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4115  hypothetical protein  32.13 
 
 
409 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4809  sulfotransferase  32.91 
 
 
424 aa  193  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2713  hypothetical protein  31.91 
 
 
416 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629687  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2668  hypothetical protein  31.91 
 
 
416 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2698  hypothetical protein  31.65 
 
 
416 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2230  hypothetical protein  30.85 
 
 
419 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0849644  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2324  hypothetical protein  34.03 
 
 
383 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0395191 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1960  hypothetical protein  31.59 
 
 
429 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6396  hypothetical protein  33.69 
 
 
381 aa  176  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4385  hypothetical protein  31.7 
 
 
385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2187  hypothetical protein  30.15 
 
 
435 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1627  hypothetical protein  31.01 
 
 
411 aa  169  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139041  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0925  hypothetical protein  30.4 
 
 
386 aa  166  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4373  hypothetical protein  31.1 
 
 
386 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0858648  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0307  hypothetical protein  30 
 
 
379 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.765461  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2832  hypothetical protein  29 
 
 
374 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3301  hypothetical protein  30.33 
 
 
416 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2758  hypothetical protein  31.02 
 
 
382 aa  156  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0287  hypothetical protein  32.54 
 
 
383 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.295688  normal  0.52564 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5540  hypothetical protein  31.72 
 
 
412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2017  hypothetical protein  28.73 
 
 
375 aa  153  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3601  hypothetical protein  28.95 
 
 
385 aa  151  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3480  hypothetical protein  28.61 
 
 
393 aa  143  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.14232 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3642  hypothetical protein  28.68 
 
 
422 aa  144  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.222709  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4230  hypothetical protein  27.63 
 
 
423 aa  142  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1831  hypothetical protein  30.65 
 
 
383 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2635  hypothetical protein  29.32 
 
 
334 aa  138  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247113  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13562  hypothetical protein  28 
 
 
384 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000084012 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5028  hypothetical protein  28.8 
 
 
383 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.298773  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2953  hypothetical protein  27.47 
 
 
376 aa  132  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5227  hypothetical protein  27.15 
 
 
381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422187  normal  0.126406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4733  hypothetical protein  28.46 
 
 
383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4645  hypothetical protein  28.46 
 
 
383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4074  hypothetical protein  27.72 
 
 
391 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.436936  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1531  hypothetical protein  27.35 
 
 
381 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2268  hypothetical protein  27.91 
 
 
390 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2451  hypothetical protein  27.93 
 
 
424 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00674159  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0373  hypothetical protein  29.13 
 
 
403 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4401  hypothetical protein  25.81 
 
 
393 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2494  hypothetical protein  25.4 
 
 
389 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1877  hypothetical protein  25.52 
 
 
389 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0767808 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1943  hypothetical protein  25.52 
 
 
389 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1897  hypothetical protein  25.52 
 
 
389 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2756  hypothetical protein  27.74 
 
 
461 aa  65.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.834394  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0831  hypothetical protein  23.55 
 
 
437 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12294  hypothetical protein  23.88 
 
 
388 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0918  hypothetical protein  21.09 
 
 
312 aa  47.8  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.800878 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1729  sulfotransferase  22.07 
 
 
336 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.534947  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1491  hypothetical protein  21.01 
 
 
360 aa  44.3  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  23.61 
 
 
700 aa  42.7  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>